More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1243 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  100 
 
 
1411 aa  2714    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  54.31 
 
 
1212 aa  1038    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  77.64 
 
 
601 aa  469  9.999999999999999e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  48.45 
 
 
1230 aa  355  2.9999999999999997e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  70.88 
 
 
2075 aa  350  1e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  69.47 
 
 
2078 aa  348  4e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  69.47 
 
 
2073 aa  347  8e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  70.11 
 
 
2092 aa  345  2e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  69.08 
 
 
2091 aa  343  1e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  46.69 
 
 
1065 aa  328  4.0000000000000003e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  62.86 
 
 
572 aa  327  1e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  69.08 
 
 
2078 aa  323  9.999999999999999e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  50.57 
 
 
595 aa  298  4e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  39.66 
 
 
1333 aa  259  4e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  37.14 
 
 
691 aa  229  2e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1341  YadA domain protein  50.83 
 
 
563 aa  209  4e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1334  YadA domain protein  52.31 
 
 
565 aa  198  6e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  53.19 
 
 
600 aa  196  3e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  32.86 
 
 
2095 aa  175  5.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  56.67 
 
 
1813 aa  149  4.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  32.25 
 
 
1616 aa  147  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  32.25 
 
 
1616 aa  147  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  32.25 
 
 
1616 aa  147  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  32.08 
 
 
1471 aa  147  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  32.08 
 
 
1471 aa  147  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  32.11 
 
 
1854 aa  140  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  33.63 
 
 
1546 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  49.12 
 
 
1014 aa  136  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  31.34 
 
 
1117 aa  132  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  31.6 
 
 
1353 aa  124  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  37.92 
 
 
1674 aa  122  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  45.62 
 
 
998 aa  120  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  35.9 
 
 
1916 aa  118  6.9999999999999995e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  29.53 
 
 
1549 aa  118  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  30.76 
 
 
2396 aa  117  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  31.49 
 
 
1068 aa  116  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  34.6 
 
 
1588 aa  116  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  32.98 
 
 
1535 aa  113  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  32.98 
 
 
1766 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  27.42 
 
 
650 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  32.57 
 
 
962 aa  111  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  32.77 
 
 
1705 aa  111  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  32.77 
 
 
1669 aa  111  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  29.28 
 
 
1814 aa  109  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  29.25 
 
 
737 aa  109  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  32.58 
 
 
655 aa  108  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  31.67 
 
 
1012 aa  108  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  32.26 
 
 
492 aa  107  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  31.15 
 
 
1626 aa  107  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  30.96 
 
 
1186 aa  107  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  29.74 
 
 
617 aa  107  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  30.56 
 
 
827 aa  106  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  38.39 
 
 
2505 aa  105  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  26.98 
 
 
1613 aa  103  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  34.27 
 
 
575 aa  103  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  28.87 
 
 
548 aa  102  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1946  putative cell surface protein  52.63 
 
 
1916 aa  102  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0459  haemagluttinin family protein  52.63 
 
 
2757 aa  102  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.312259  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  32.46 
 
 
1516 aa  101  9e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  29.65 
 
 
1434 aa  100  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  44.44 
 
 
2814 aa  100  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  29.57 
 
 
2157 aa  100  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  44.44 
 
 
2778 aa  100  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  44.44 
 
 
2728 aa  100  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1616  large adhesin  24.69 
 
 
3078 aa  99  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0957  outer membrane protein, putative  50.53 
 
 
2025 aa  98.6  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  28.22 
 
 
4526 aa  97.1  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0383  large adhesin  28.44 
 
 
4238 aa  96.7  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  35.88 
 
 
2493 aa  96.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0873  OmpA/MotB domain protein  32.39 
 
 
314 aa  96.3  4e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  30.24 
 
 
2392 aa  95.9  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  28.95 
 
 
1265 aa  95.5  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  48.96 
 
 
977 aa  95.1  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  32.59 
 
 
536 aa  95.1  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  31.99 
 
 
1487 aa  95.1  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  50 
 
 
4384 aa  94.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1085  large adhesin  28.24 
 
 
3737 aa  94.4  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0248  OmpA/MotB domain protein  32.81 
 
 
367 aa  93.2  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  34.2 
 
 
1072 aa  92.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  46.6 
 
 
2141 aa  92.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0086  YadA domain-containing protein  30.71 
 
 
599 aa  92  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  27.17 
 
 
2504 aa  92  8e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  28.06 
 
 
810 aa  91.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  28.86 
 
 
1122 aa  90.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  44.95 
 
 
2866 aa  90.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  30.21 
 
 
5143 aa  90.5  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  28.86 
 
 
1090 aa  88.6  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  28.86 
 
 
1090 aa  88.6  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  28.86 
 
 
1090 aa  88.6  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  24.96 
 
 
3355 aa  88.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  29.26 
 
 
1122 aa  87.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  27.35 
 
 
3920 aa  88.2  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  29.26 
 
 
1122 aa  88.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  29.26 
 
 
1074 aa  87.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  25.89 
 
 
2868 aa  87.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  26.27 
 
 
2914 aa  86.7  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0602  adhesin  28.67 
 
 
404 aa  86.3  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  29.15 
 
 
1472 aa  83.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  44.55 
 
 
589 aa  83.2  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2042  putative cell surface protein  65.45 
 
 
365 aa  83.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>