181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3245 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  100 
 
 
1814 aa  3537    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  27.55 
 
 
1588 aa  172  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  27.48 
 
 
1616 aa  168  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  27.56 
 
 
1616 aa  167  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  27.56 
 
 
1616 aa  167  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  26.42 
 
 
1472 aa  155  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  33.08 
 
 
1309 aa  153  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  26.48 
 
 
1446 aa  146  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  31.55 
 
 
2392 aa  141  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  30 
 
 
1613 aa  141  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  33.79 
 
 
735 aa  130  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  32.42 
 
 
597 aa  128  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  30.7 
 
 
2095 aa  124  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  32.75 
 
 
827 aa  123  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  31.37 
 
 
597 aa  122  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  31.37 
 
 
597 aa  122  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  27.12 
 
 
1333 aa  121  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  27.25 
 
 
2832 aa  119  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  28.4 
 
 
3126 aa  118  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  30.83 
 
 
737 aa  116  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  29.39 
 
 
1674 aa  116  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  29.03 
 
 
1411 aa  115  6e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  33.93 
 
 
1549 aa  114  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  33.49 
 
 
877 aa  111  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  27.69 
 
 
1447 aa  106  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  29.31 
 
 
1342 aa  105  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  24.7 
 
 
1230 aa  105  8e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  30.33 
 
 
1265 aa  103  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  31.86 
 
 
1186 aa  103  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03061  adhesin-like protein B  30.62 
 
 
989 aa  100  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  26.82 
 
 
691 aa  100  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  35.1 
 
 
601 aa  99.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  28.93 
 
 
1447 aa  99.4  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  31.08 
 
 
1654 aa  99.4  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  30.77 
 
 
1471 aa  98.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  38.43 
 
 
963 aa  98.6  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  30.77 
 
 
1471 aa  98.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  34.01 
 
 
650 aa  98.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  34.89 
 
 
1246 aa  97.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  31.23 
 
 
1546 aa  96.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  32.79 
 
 
548 aa  95.5  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  32.05 
 
 
536 aa  95.5  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  29.68 
 
 
1854 aa  94.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  31.94 
 
 
715 aa  94.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  25.81 
 
 
1516 aa  95.1  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  31.94 
 
 
1535 aa  93.6  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  28.11 
 
 
4384 aa  93.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  32.14 
 
 
1068 aa  93.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  36.73 
 
 
3718 aa  93.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  27.69 
 
 
2866 aa  93.2  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  31.94 
 
 
1766 aa  93.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  31.94 
 
 
1669 aa  92.8  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  31.94 
 
 
1626 aa  92  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  29.71 
 
 
617 aa  92  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  26.62 
 
 
3635 aa  91.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  31.33 
 
 
4191 aa  90.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  30.07 
 
 
1487 aa  90.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  34.02 
 
 
962 aa  90.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  31.72 
 
 
1705 aa  90.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  34.69 
 
 
1012 aa  90.5  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  32.96 
 
 
810 aa  90.5  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  33.21 
 
 
572 aa  88.2  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  29.73 
 
 
600 aa  88.2  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  29.4 
 
 
1117 aa  88.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  38.37 
 
 
3355 aa  87.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0314  Brp family immunodominant surface antigen  25.89 
 
 
1235 aa  87  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0768  YadA domain-containing protein  36.59 
 
 
997 aa  86.3  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0855  outer membrane protein XadA  36.59 
 
 
815 aa  86.3  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.912116  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  28.4 
 
 
589 aa  85.9  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  26.39 
 
 
1212 aa  85.1  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  28.73 
 
 
820 aa  84  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  28.73 
 
 
831 aa  83.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  28.73 
 
 
831 aa  83.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  28.73 
 
 
816 aa  83.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  28.73 
 
 
816 aa  84  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  28.73 
 
 
816 aa  83.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  28.73 
 
 
816 aa  83.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  28.89 
 
 
2868 aa  82.4  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  29.25 
 
 
831 aa  82.4  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  30.8 
 
 
595 aa  81.6  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  30.67 
 
 
2396 aa  81.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  28.44 
 
 
575 aa  80.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  25.85 
 
 
2914 aa  81.3  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  28.68 
 
 
990 aa  81.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  26.97 
 
 
1434 aa  80.1  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  26.54 
 
 
753 aa  79  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  29.5 
 
 
1353 aa  78.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  29.22 
 
 
655 aa  78.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  32.81 
 
 
1072 aa  77.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  25.54 
 
 
1065 aa  76.6  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3661  hemagluttinin-like protein  32.09 
 
 
418 aa  73.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0725058  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  32.76 
 
 
3192 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  28.14 
 
 
2493 aa  74.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  35.93 
 
 
898 aa  72.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  31.38 
 
 
472 aa  72  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  31.76 
 
 
492 aa  70.1  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3593  YadA domain protein  42 
 
 
742 aa  69.3  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.50488  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  39.41 
 
 
2505 aa  68.9  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  23.9 
 
 
2851 aa  68.2  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0602  adhesin  29.63 
 
 
404 aa  67.4  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>