213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5560 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  100 
 
 		 2396 aa  4419    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  50.57 
 
 		 2141 aa  446  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  52.46 
 
 		 1117 aa  350  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  32.14 
 
 		 1446 aa  325  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  32.51 
 
 		 1472 aa  323  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  32.33 
 
 		 1447 aa  323  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  32.51 
 
 		 1342 aa  320  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  32.27 
 
 		 1447 aa  319  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  38.73 
 
 		 1487 aa  317  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  33.04 
 
 		 1549 aa  281  8e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  51.66 
 
 		 1546 aa  269  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  51.51 
 
 		 1854 aa  268  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  51.52 
 
 		 1471 aa  268  8e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  51.52 
 
 		 1471 aa  268  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  34.03 
 
 		 1616 aa  261  9e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  33.9 
 
 		 1588 aa  261  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  50.29 
 
 		 1353 aa  249  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  34.13 
 
 		 1616 aa  248  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  34.13 
 
 		 1616 aa  248  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  79.43 
 
 		 1434 aa  243  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  50 
 
 		 1654 aa  241  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  34.71 
 
 		 4726 aa  236  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  54.39 
 
 		 2866 aa  224  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  36.09 
 
 		 3635 aa  221  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  56.34 
 
 		 2493 aa  218  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  56.14 
 
 		 2814 aa  214  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  40.52 
 
 		 1090 aa  211  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  40.52 
 
 		 1090 aa  211  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  40.52 
 
 		 1090 aa  211  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  40.52 
 
 		 1122 aa  210  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  40.52 
 
 		 1074 aa  210  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  40.52 
 
 		 1122 aa  209  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  40.3 
 
 		 1122 aa  208  9e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  48.93 
 
 		 898 aa  208  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  55.44 
 
 		 2728 aa  208  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  55.44 
 
 		 2778 aa  208  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  35.12 
 
 		 766 aa  206  5e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  35.7 
 
 		 1674 aa  202  6e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  36.95 
 
 		 753 aa  197  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  37.98 
 
 		 740 aa  196  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  34.97 
 
 		 1190 aa  195  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  43.11 
 
 		 715 aa  191  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  34.22 
 
 		 827 aa  180  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  39.04 
 
 		 2157 aa  177  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  48.84 
 
 		 2505 aa  177  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  44.66 
 
 		 1713 aa  175  7.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  30.31 
 
 		 1065 aa  174  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  30.18 
 
 		 1333 aa  174  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  31.71 
 
 		 3192 aa  170  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  33.75 
 
 		 3126 aa  169  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  42.08 
 
 		 1626 aa  168  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  51.02 
 
 		 1669 aa  168  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  51.02 
 
 		 1766 aa  168  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  51.02 
 
 		 1535 aa  167  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  32.86 
 
 		 4384 aa  164  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  43.57 
 
 		 1705 aa  163  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  29.23 
 
 		 880 aa  160  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  29.36 
 
 		 876 aa  161  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  28.7 
 
 		 1230 aa  155  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  36.01 
 
 		 1186 aa  154  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  35.02 
 
 		 816 aa  152  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  35.02 
 
 		 831 aa  152  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  35.02 
 
 		 831 aa  152  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  35.02 
 
 		 816 aa  152  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  35.02 
 
 		 816 aa  152  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  35.02 
 
 		 816 aa  152  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  35.02 
 
 		 820 aa  152  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  37.93 
 
 		 279 aa  151  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  31.68 
 
 		 1411 aa  150  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  36.41 
 
 		 1068 aa  149  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  35.94 
 
 		 575 aa  148  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0086  YadA domain-containing protein  36.11 
 
 		 599 aa  145  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  33.87 
 
 		 810 aa  142  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  38.76 
 
 		 831 aa  140  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  32.83 
 
 		 2868 aa  139  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  29.08 
 
 		 1309 aa  138  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  51.82 
 
 		 1440 aa  138  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  36.92 
 
 		 536 aa  137  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  32.84 
 
 		 877 aa  135  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  51.82 
 
 		 2504 aa  131  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  31.92 
 
 		 1613 aa  131  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  35.62 
 
 		 1390 aa  131  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  31.6 
 
 		 691 aa  130  3e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  36.47 
 
 		 589 aa  130  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  32.7 
 
 		 737 aa  130  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  28.11 
 
 		 1265 aa  126  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0311  Brp family immunodominant surface antigen  35.16 
 
 		 551 aa  124  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  28.7 
 
 		 1259 aa  124  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  39.22 
 
 		 1012 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  46.32 
 
 		 2095 aa  120  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  35.47 
 
 		 492 aa  119  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  35.63 
 
 		 716 aa  118  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  45.99 
 
 		 716 aa  118  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  32.63 
 
 		 2832 aa  116  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  33.67 
 
 		 617 aa  115  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  31.04 
 
 		 1326 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  32.35 
 
 		 655 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  37.72 
 
 		 962 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  29.71 
 
 		 1814 aa  112  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  59.4 
 
 		 977 aa  111  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>