179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8539 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  100 
 
 		 2157 aa  4062    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  44.89 
 
 		 740 aa  390  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  44.35 
 
 		 766 aa  382  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  36.88 
 
 		 1122 aa  304  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  36.88 
 
 		 1122 aa  304  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  36.88 
 
 		 1074 aa  303  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  36.77 
 
 		 1122 aa  303  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  36.88 
 
 		 1090 aa  303  4e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  36.88 
 
 		 1090 aa  303  4e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  36.88 
 
 		 1090 aa  303  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  31.43 
 
 		 1326 aa  281  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  38.91 
 
 		 4384 aa  241  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  43 
 
 		 2778 aa  233  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  43 
 
 		 2728 aa  232  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  43 
 
 		 2814 aa  232  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  28.19 
 
 		 1472 aa  225  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  50.87 
 
 		 2493 aa  217  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  29.74 
 
 		 1342 aa  205  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  29.55 
 
 		 1446 aa  204  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  29.45 
 
 		 1447 aa  204  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0086  YadA domain-containing protein  52.19 
 
 		 599 aa  203  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  30.8 
 
 		 2504 aa  202  6e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  29.26 
 
 		 1447 aa  199  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  30.43 
 
 		 1440 aa  199  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  43.04 
 
 		 2505 aa  197  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  41.21 
 
 		 1487 aa  193  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  52.14 
 
 		 492 aa  192  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  33.46 
 
 		 3126 aa  184  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  38.38 
 
 		 2396 aa  177  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  27.63 
 
 		 1390 aa  176  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  42.29 
 
 		 2141 aa  163  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  28.06 
 
 		 1674 aa  163  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0314  Brp family immunodominant surface antigen  39.79 
 
 		 1235 aa  161  1e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0957  outer membrane protein, putative  45.52 
 
 		 2025 aa  159  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  26.42 
 
 		 2095 aa  155  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  29.77 
 
 		 4726 aa  155  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  28.35 
 
 		 1616 aa  155  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1616 aa  155  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  32.6 
 
 		 990 aa  153  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  28.24 
 
 		 1616 aa  153  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  28.24 
 
 		 1588 aa  153  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  36.28 
 
 		 1916 aa  151  2.0000000000000003e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0311  Brp family immunodominant surface antigen  39.75 
 
 		 551 aa  145  7e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  37.59 
 
 		 1309 aa  141  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  29.87 
 
 		 1197 aa  140  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  36.44 
 
 		 3192 aa  140  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  38.81 
 
 		 2832 aa  137  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  37.22 
 
 		 735 aa  135  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  29.97 
 
 		 1197 aa  135  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  30.97 
 
 		 3635 aa  135  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  29.97 
 
 		 1197 aa  135  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  33.51 
 
 		 3718 aa  133  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  28.42 
 
 		 1549 aa  133  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  41.32 
 
 		 831 aa  131  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  41.32 
 
 		 831 aa  131  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  41.32 
 
 		 816 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  41.32 
 
 		 820 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  41.32 
 
 		 816 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  41.32 
 
 		 816 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  41.32 
 
 		 816 aa  128  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  28.66 
 
 		 1125 aa  127  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  41.41 
 
 		 831 aa  124  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  36.34 
 
 		 4191 aa  123  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  27.87 
 
 		 1190 aa  122  6e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  34.59 
 
 		 1204 aa  121  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  27.65 
 
 		 753 aa  118  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  28.29 
 
 		 2868 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  33.65 
 
 		 2392 aa  116  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  31.66 
 
 		 1451 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  33.41 
 
 		 1613 aa  113  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  34.46 
 
 		 1854 aa  111  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  29.36 
 
 		 1411 aa  110  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  25.61 
 
 		 1333 aa  109  5e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  31.98 
 
 		 1471 aa  109  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  31.98 
 
 		 1471 aa  109  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  42.13 
 
 		 2866 aa  107  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0459  haemagluttinin family protein  45.15 
 
 		 2757 aa  107  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.312259  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  29.19 
 
 		 691 aa  107  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  32.7 
 
 		 878 aa  107  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1946  putative cell surface protein  45.15 
 
 		 1916 aa  107  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  39.61 
 
 		 1434 aa  106  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  35.38 
 
 		 967 aa  105  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  28.48 
 
 		 1230 aa  105  9e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  27.03 
 
 		 1212 aa  105  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  41.26 
 
 		 898 aa  103  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  33.51 
 
 		 876 aa  102  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  38.86 
 
 		 1117 aa  101  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  26.95 
 
 		 1259 aa  101  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  42.08 
 
 		 1535 aa  100  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  42.08 
 
 		 1705 aa  100  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  34.44 
 
 		 1654 aa  100  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  42.08 
 
 		 1626 aa  100  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  42.08 
 
 		 1669 aa  100  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  42.08 
 
 		 1766 aa  100  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  31.59 
 
 		 716 aa  100  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  30.35 
 
 		 880 aa  100  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  29.33 
 
 		 1246 aa  98.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  32.44 
 
 		 1546 aa  97.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  31.33 
 
 		 716 aa  97.4  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  30.39 
 
 		 1065 aa  96.7  5e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>