218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5983 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  84.93 
 
 
1854 aa  1167    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  90.79 
 
 
1434 aa  1023    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  97.77 
 
 
1546 aa  1014    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  100 
 
 
1471 aa  2712    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  87.45 
 
 
1353 aa  1043    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  100 
 
 
1471 aa  2712    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  57.34 
 
 
1487 aa  852    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  57.64 
 
 
1117 aa  549  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  63.77 
 
 
2141 aa  512  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  40.37 
 
 
2778 aa  416  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  40.38 
 
 
2728 aa  396  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0957  outer membrane protein, putative  60.52 
 
 
2025 aa  383  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  44.62 
 
 
1705 aa  351  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1946  putative cell surface protein  59.26 
 
 
1916 aa  346  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  40.02 
 
 
2505 aa  333  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0459  haemagluttinin family protein  50.87 
 
 
2757 aa  330  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.312259  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  37.65 
 
 
1766 aa  322  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  39.02 
 
 
1669 aa  320  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  51.57 
 
 
2814 aa  305  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  44.25 
 
 
1535 aa  301  8e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  44.64 
 
 
1626 aa  298  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  62.5 
 
 
330 aa  297  9e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  58.53 
 
 
2866 aa  282  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  42.77 
 
 
1654 aa  278  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  58.84 
 
 
898 aa  274  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  51.52 
 
 
2396 aa  245  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2042  putative cell surface protein  69.7 
 
 
365 aa  227  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  52.72 
 
 
977 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  30.16 
 
 
1342 aa  216  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  62.5 
 
 
715 aa  215  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  35.11 
 
 
1588 aa  205  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  34.94 
 
 
1616 aa  204  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  51.94 
 
 
2493 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  43.81 
 
 
716 aa  196  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  43.3 
 
 
716 aa  193  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  33.93 
 
 
1616 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  33.93 
 
 
1616 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  41.95 
 
 
1417 aa  187  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  32.64 
 
 
1549 aa  183  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  34.22 
 
 
1012 aa  179  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  34.33 
 
 
1068 aa  179  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  33.73 
 
 
962 aa  169  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  37.75 
 
 
816 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  37.75 
 
 
816 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  37.75 
 
 
816 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  37.75 
 
 
816 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  37.75 
 
 
831 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  37.75 
 
 
831 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  37.75 
 
 
820 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  37.66 
 
 
1674 aa  166  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  33.87 
 
 
880 aa  163  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  52.17 
 
 
753 aa  162  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  33.69 
 
 
876 aa  162  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  38.07 
 
 
1186 aa  159  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  39.72 
 
 
827 aa  158  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  37.45 
 
 
831 aa  157  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  36.94 
 
 
2095 aa  157  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  38.92 
 
 
1326 aa  153  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  35.3 
 
 
617 aa  152  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  37.75 
 
 
1090 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  37.75 
 
 
1090 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  37.75 
 
 
1090 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  37.75 
 
 
1074 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  36.9 
 
 
472 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  37.75 
 
 
1122 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  37.75 
 
 
1122 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  33.41 
 
 
4384 aa  149  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  37.75 
 
 
1122 aa  149  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  34.27 
 
 
1309 aa  149  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  31.13 
 
 
1411 aa  149  5e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  34.62 
 
 
878 aa  149  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  36.04 
 
 
1440 aa  145  7e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  36.04 
 
 
1190 aa  144  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  31.66 
 
 
877 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  31.34 
 
 
691 aa  140  2e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  36.75 
 
 
601 aa  138  9e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0463  putative membrane-anchored cell surface protein  49.69 
 
 
1616 aa  136  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.590511  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1951  membrane-anchored cell surface protein  49.69 
 
 
1608 aa  135  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  36.04 
 
 
2868 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  28.78 
 
 
1333 aa  133  3e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  41.28 
 
 
492 aa  132  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0810  YadA-like C-terminal region protein  49.69 
 
 
459 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  44 
 
 
533 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1599  YadA-like C-terminal region protein  49.69 
 
 
459 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  33.98 
 
 
1265 aa  129  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0646  YadA-like C-terminal region protein  49.69 
 
 
459 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0378174  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2048  putative outer membrane protein  49.69 
 
 
322 aa  129  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  43.5 
 
 
373 aa  127  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  43.5 
 
 
373 aa  127  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  43.5 
 
 
378 aa  127  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  34.58 
 
 
1390 aa  127  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  33.25 
 
 
3635 aa  126  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  43.43 
 
 
192 aa  125  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  43.43 
 
 
192 aa  125  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  35.27 
 
 
600 aa  125  7e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  40.4 
 
 
378 aa  125  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  36.49 
 
 
650 aa  125  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  30.81 
 
 
1516 aa  124  9.999999999999999e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  35.54 
 
 
737 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  34.36 
 
 
2504 aa  124  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>