203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4575 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  86.78 
 
 		 2866 aa  916    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  69.65 
 
 		 2505 aa  789    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  86.15 
 
 		 2814 aa  919    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  74.3 
 
 		 898 aa  647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  100 
 
 		 2493 aa  4221    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1946  putative cell surface protein  58.53 
 
 		 1916 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0957  outer membrane protein, putative  55.98 
 
 		 2025 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  88.92 
 
 		 2728 aa  572  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  88.92 
 
 		 2778 aa  572  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0459  haemagluttinin family protein  59.19 
 
 		 2757 aa  510  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.312259  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  49.73 
 
 		 1705 aa  443  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2042  putative cell surface protein  71.27 
 
 		 365 aa  436  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  49.18 
 
 		 1766 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  45.51 
 
 		 1626 aa  360  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  45.45 
 
 		 715 aa  327  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  49.17 
 
 		 1535 aa  301  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  54.26 
 
 		 977 aa  295  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  52.83 
 
 		 1487 aa  290  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0810  YadA-like C-terminal region protein  60.5 
 
 		 459 aa  266  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0646  YadA-like C-terminal region protein  60.5 
 
 		 459 aa  266  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0378174  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1599  YadA-like C-terminal region protein  60.5 
 
 		 459 aa  266  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  50.35 
 
 		 1654 aa  258  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  58.96 
 
 		 1669 aa  256  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2048  putative outer membrane protein  54.74 
 
 		 322 aa  254  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  53.66 
 
 		 2396 aa  236  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  39.84 
 
 		 1434 aa  225  9e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  65.58 
 
 		 1854 aa  214  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  55.6 
 
 		 2141 aa  212  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  65.81 
 
 		 1471 aa  212  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  65.81 
 
 		 1471 aa  212  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  65.81 
 
 		 1546 aa  211  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  53.89 
 
 		 1353 aa  209  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  38.43 
 
 		 4384 aa  200  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0533  YadA-like C-terminal region protein  56.28 
 
 		 229 aa  199  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  51.5 
 
 		 2157 aa  197  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  60.23 
 
 		 1122 aa  193  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  60.23 
 
 		 1122 aa  194  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  60.23 
 
 		 1122 aa  194  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  60.23 
 
 		 1090 aa  193  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  60.23 
 
 		 1074 aa  193  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  60.23 
 
 		 1090 aa  193  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  60.23 
 
 		 1090 aa  193  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  36.99 
 
 		 575 aa  168  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  38.98 
 
 		 536 aa  167  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1951  membrane-anchored cell surface protein  54.09 
 
 		 1608 aa  166  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  41.82 
 
 		 1417 aa  163  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  34.75 
 
 		 827 aa  160  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  36.75 
 
 		 589 aa  153  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  37.88 
 
 		 1117 aa  152  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  35.27 
 
 		 655 aa  147  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  38.25 
 
 		 600 aa  137  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  39.92 
 
 		 691 aa  129  6e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  42 
 
 		 740 aa  129  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  41.31 
 
 		 766 aa  127  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  28.3 
 
 		 1065 aa  127  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0463  putative membrane-anchored cell surface protein  57.6 
 
 		 1616 aa  122  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.590511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  43.14 
 
 		 1186 aa  120  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  39.68 
 
 		 492 aa  119  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  39.38 
 
 		 4726 aa  119  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0602  adhesin  38.37 
 
 		 404 aa  119  8.999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  32.35 
 
 		 3635 aa  117  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  36.65 
 
 		 1230 aa  115  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  34.81 
 
 		 1012 aa  115  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  32.32 
 
 		 1326 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  27.88 
 
 		 1333 aa  113  5e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  39.52 
 
 		 595 aa  112  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  40.33 
 
 		 572 aa  111  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  33.33 
 
 		 831 aa  107  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  42.75 
 
 		 601 aa  106  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  41.67 
 
 		 533 aa  104  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  31.87 
 
 		 810 aa  104  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0589  adhesin  36.99 
 
 		 386 aa  103  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  30.78 
 
 		 737 aa  104  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  34.81 
 
 		 1068 aa  102  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  30.27 
 
 		 1674 aa  102  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  32.35 
 
 		 831 aa  101  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  32.35 
 
 		 831 aa  101  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  40.38 
 
 		 460 aa  101  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  37.7 
 
 		 1516 aa  100  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  38.15 
 
 		 1309 aa  100  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  36.98 
 
 		 1472 aa  100  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  41.83 
 
 		 192 aa  100  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  41.83 
 
 		 192 aa  100  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  36.23 
 
 		 373 aa  99.8  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  36.23 
 
 		 373 aa  99.8  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  40.91 
 
 		 378 aa  99.8  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  36.23 
 
 		 378 aa  99.8  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  30.8 
 
 		 1616 aa  99  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  30.8 
 
 		 1616 aa  99  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  34.3 
 
 		 1916 aa  98.6  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  29.39 
 
 		 1616 aa  99  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  31.08 
 
 		 1549 aa  98.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  39.92 
 
 		 816 aa  98.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  34.34 
 
 		 2868 aa  98.2  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  36.82 
 
 		 2095 aa  98.2  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  29.08 
 
 		 1588 aa  97.1  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  30.49 
 
 		 548 aa  95.5  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88532  predicted protein  18.11 
 
 		 3608 aa  94.4  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.478087 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  35.2 
 
 		 601 aa  94.4  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  32.64 
 
 		 1212 aa  94  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>