More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0600 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  100 
 
 
601 aa  1184    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  75.15 
 
 
1411 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  61.07 
 
 
2091 aa  303  7.000000000000001e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  60.15 
 
 
2078 aa  301  2e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  60.31 
 
 
2073 aa  300  4e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  59.7 
 
 
2075 aa  299  1e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  59.32 
 
 
2092 aa  295  1e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  61.07 
 
 
2078 aa  283  9e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  57.14 
 
 
1065 aa  212  2e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1341  YadA domain protein  38.24 
 
 
563 aa  210  8e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  37.11 
 
 
572 aa  209  2e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  56.52 
 
 
1212 aa  206  7e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  55.1 
 
 
1230 aa  206  1e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  31.96 
 
 
595 aa  199  9e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  52.74 
 
 
1333 aa  198  3e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  31.43 
 
 
600 aa  188  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  31.25 
 
 
691 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1334  YadA domain protein  50.78 
 
 
565 aa  183  8.000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  51.37 
 
 
1813 aa  133  7.999999999999999e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  30.38 
 
 
1916 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  46.38 
 
 
998 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  52.07 
 
 
1014 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0873  OmpA/MotB domain protein  33.6 
 
 
314 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0248  OmpA/MotB domain protein  31.84 
 
 
367 aa  103  8e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  36.73 
 
 
2505 aa  102  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  37.81 
 
 
655 aa  99.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  35.9 
 
 
2396 aa  98.6  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  37.97 
 
 
2814 aa  97.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0957  outer membrane protein, putative  46.79 
 
 
2025 aa  96.3  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  51.02 
 
 
977 aa  96.3  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  36.57 
 
 
1654 aa  95.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  42.78 
 
 
1434 aa  95.1  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  34.5 
 
 
2493 aa  95.5  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0459  haemagluttinin family protein  51.02 
 
 
2757 aa  94  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.312259  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1946  putative cell surface protein  51.02 
 
 
1916 aa  94  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  36.22 
 
 
2141 aa  93.6  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  37.97 
 
 
2728 aa  93.6  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  37.97 
 
 
2778 aa  93.6  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224013 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  36.46 
 
 
1616 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  36.08 
 
 
1588 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  36.46 
 
 
1616 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  36.46 
 
 
1616 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  36.76 
 
 
536 aa  90.5  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  37.43 
 
 
2866 aa  89.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  36.69 
 
 
575 aa  88.6  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0602  adhesin  32.2 
 
 
404 aa  85.1  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  34.16 
 
 
1117 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  31.5 
 
 
898 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  37.74 
 
 
820 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  37.74 
 
 
831 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  37.74 
 
 
816 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  37.74 
 
 
816 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  37.74 
 
 
831 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  37.74 
 
 
816 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  37.74 
 
 
816 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  39.63 
 
 
1854 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  27.2 
 
 
740 aa  80.9  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  32.03 
 
 
492 aa  80.9  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0589  adhesin  32.98 
 
 
386 aa  80.1  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  42.72 
 
 
4384 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  37.68 
 
 
766 aa  79.3  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  33.33 
 
 
1549 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  37.5 
 
 
589 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  35.37 
 
 
1471 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  35.37 
 
 
1471 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  28.29 
 
 
1342 aa  77  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  31.58 
 
 
1669 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  28.29 
 
 
1447 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  31.58 
 
 
1535 aa  77  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  31.58 
 
 
1626 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  28.29 
 
 
1447 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  31.58 
 
 
1766 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  31.58 
 
 
1705 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  28.29 
 
 
1446 aa  75.5  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  27.3 
 
 
1472 aa  75.5  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  36.02 
 
 
1546 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  30.47 
 
 
1122 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  31.44 
 
 
1122 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  31.44 
 
 
1122 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  31.44 
 
 
1090 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  31.44 
 
 
1090 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  64.71 
 
 
831 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  31.44 
 
 
1090 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  32.2 
 
 
1074 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2042  putative cell surface protein  53.62 
 
 
365 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  35.05 
 
 
1487 aa  72  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  27.72 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  28.24 
 
 
1713 aa  71.2  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  35.37 
 
 
2868 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  33.51 
 
 
715 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  43.56 
 
 
4726 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  31.77 
 
 
2095 aa  68.9  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  38.26 
 
 
5143 aa  68.2  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  25.95 
 
 
1814 aa  67.4  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  29.51 
 
 
650 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  31.19 
 
 
2157 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  30.85 
 
 
1405 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  40.37 
 
 
1353 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  39.42 
 
 
597 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  39.42 
 
 
597 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>