More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0873 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0873  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 314 aa  615  1e-175  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0248  OmpA/MotB domain protein  57.38 
 
 		 367 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1182  YadA domain protein  57.99 
 
 		 224 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1166  Outer membrane protein and related peptidoglycan- associated (lipo)protein-like protein  62.5 
 
 		 151 aa  160  2e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0888  YadA domain protein  53.97 
 
 		 210 aa  136  4e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  34.13 
 
 		 601 aa  105  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  33.2 
 
 		 2078 aa  104  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  32.82 
 
 		 2091 aa  104  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  33.2 
 
 		 2073 aa  104  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  32.03 
 
 		 2092 aa  97.1  4e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  31.66 
 
 		 2075 aa  95.1  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  32.81 
 
 		 2078 aa  92.4  9e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  32.39 
 
 		 1411 aa  89  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  41.58 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  32.54 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  41.57 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  29.08 
 
 		 217 aa  67  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  36.27 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  39.51 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  28.99 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.31 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  39.6 
 
 		 219 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  43.02 
 
 		 607 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  40.7 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 217 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  27.86 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  37.62 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  26.69 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  37.62 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  29.86 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  38.61 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  36.63 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  36.63 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  38.61 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  38.2 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  37.72 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  37.62 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  38.2 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  25.71 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  38.37 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  34.19 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  34.65 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.37 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  38.61 
 
 		 222 aa  62.4  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 		 187 aa  62.4  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  40.51 
 
 		 537 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  39.39 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  35.71 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  36.63 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1976  OmpA/MotB domain protein  32.41 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0825703  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  23.61 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  36.36 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  28.68 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  37.21 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1908  OmpA/MotB domain protein  31.19 
 
 		 519 aa  60.8  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.533887  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  34.65 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  41.41 
 
 		 641 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  32.35 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  30.39 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  39.19 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  28.47 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  37.21 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  44.93 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  30.19 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  26.06 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0615  OmpA/MotB domain-containing protein  30.2 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  43.66 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  34.65 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  34.31 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  35.71 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  39.19 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  34.65 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  31.25 
 
 		 1014 aa  58.9  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  37.25 
 
 		 175 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1220  OmpA/MotB domain protein  35.64 
 
 		 168 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  40.58 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.34 
 
 		 609 aa  58.9  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  25.71 
 
 		 216 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  35.71 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  34.29 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  25.71 
 
 		 216 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  25.53 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  31.25 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  31.48 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  28.43 
 
 		 707 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  30.39 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  39.6 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  35.78 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>