More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1166 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1166  Outer membrane protein and related peptidoglycan- associated (lipo)protein-like protein  100 
 
 		 151 aa  289  9e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0873  OmpA/MotB domain protein  66.93 
 
 		 314 aa  149  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0248  OmpA/MotB domain protein  48.55 
 
 		 367 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  33.33 
 
 		 601 aa  59.7  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  42.42 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0918  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.4 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  45.45 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  45.45 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  43.94 
 
 		 607 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  42.86 
 
 		 367 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  45.59 
 
 		 346 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  45.59 
 
 		 346 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  45.59 
 
 		 346 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  45.59 
 
 		 354 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  45.59 
 
 		 365 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  45.59 
 
 		 346 aa  51.6  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  45.59 
 
 		 346 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  45.59 
 
 		 350 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  45.45 
 
 		 219 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  27.18 
 
 		 217 aa  51.2  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  45.59 
 
 		 351 aa  51.2  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1976  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 331 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0825703  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  45.59 
 
 		 358 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  43.94 
 
 		 219 aa  50.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0563  OmpA/MotB domain-containing protein  40.58 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 225 aa  50.8  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  45.45 
 
 		 222 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  45.45 
 
 		 222 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.45 
 
 		 222 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  45.45 
 
 		 222 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  40.91 
 
 		 218 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000937501  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0841  OmpA/MotB domain protein  42.42 
 
 		 218 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0197529 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  37.88 
 
 		 233 aa  49.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0770  OmpA/MotB domain protein  42.42 
 
 		 218 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  42.42 
 
 		 231 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  42.42 
 
 		 218 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  42.47 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  33.96 
 
 		 2091 aa  48.9  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  43.94 
 
 		 222 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  43.94 
 
 		 222 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  42.42 
 
 		 218 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  43.94 
 
 		 222 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 		 242 aa  48.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  25.2 
 
 		 537 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  34.85 
 
 		 310 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  44.12 
 
 		 358 aa  48.9  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 320 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  34.85 
 
 		 310 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3010  OmpA/MotB domain protein  61.11 
 
 		 215 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354586  normal  0.0152683 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  30.08 
 
 		 261 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.85 
 
 		 217 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 316 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  36 
 
 		 613 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  61.11 
 
 		 215 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 217 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  39.71 
 
 		 319 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  42.65 
 
 		 369 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  34.85 
 
 		 311 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0955  OmpA family protein  42.42 
 
 		 179 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  42.65 
 
 		 369 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0973  OmpA/MotB family outer membrane protein  61.11 
 
 		 215 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0727581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 230 aa  47.8  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  42.65 
 
 		 358 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  42.65 
 
 		 358 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  42.65 
 
 		 371 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  34.85 
 
 		 221 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  34.85 
 
 		 221 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 		 219 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0462  OmpA family protein  35.9 
 
 		 175 aa  47.8  0.00006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  34.85 
 
 		 217 aa  47.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  34.85 
 
 		 221 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2051  OmpA/MotB domain-containing protein  35.82 
 
 		 277 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0438316  hitchhiker  0.0000220927 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  40 
 
 		 277 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2581  OmpA family protein  42.42 
 
 		 209 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0436  OmpA family protein  42.42 
 
 		 224 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  42.42 
 
 		 224 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2891  ompA family protein  42.42 
 
 		 224 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2953  ompA family protein  42.42 
 
 		 224 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  33.04 
 
 		 2073 aa  47  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0192  OmpA family protein  42.42 
 
 		 224 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  33.04 
 
 		 2078 aa  47  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  33.33 
 
 		 310 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  33.33 
 
 		 310 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  33.33 
 
 		 310 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  33.33 
 
 		 310 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  40.3 
 
 		 227 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  41.1 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  34.85 
 
 		 316 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  33.33 
 
 		 310 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  36.36 
 
 		 248 aa  47  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  42.42 
 
 		 224 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.36 
 
 		 609 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  40.91 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1239  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.36 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216334  normal  0.113587 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  39.71 
 
 		 354 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  29.91 
 
 		 227 aa  47  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  31.82 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  58.33 
 
 		 217 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05164  hypothetical protein  34.92 
 
 		 301 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3785  OmpA/MotB domain-containing protein  37.88 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000797099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>