More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3785 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008607  Ppro_3785  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 191 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000797099  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0261  OmpA/MotB domain-containing protein  36.73 
 
 		 201 aa  95.5  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.836799  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0324  OmpA/MotB domain protein  34.52 
 
 		 201 aa  84.3  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2172  OmpA domain-containing protein  31.41 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  44.21 
 
 		 358 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  44.21 
 
 		 358 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  44.21 
 
 		 369 aa  62  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  44.21 
 
 		 369 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  44.21 
 
 		 371 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  33.64 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  34.71 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  33.98 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  34.95 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  34.95 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  42.11 
 
 		 358 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  42.11 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  42.11 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  42.11 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  42.11 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  42.11 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  42.11 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  42.11 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  42.11 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  33.65 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  36.63 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  41.05 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  31.14 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  47.54 
 
 		 361 aa  58.9  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  47.54 
 
 		 366 aa  58.5  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  34.15 
 
 		 357 aa  58.2  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  35.85 
 
 		 264 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  34.15 
 
 		 353 aa  58.2  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  38.61 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  34.15 
 
 		 353 aa  58.2  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  50.88 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  33.02 
 
 		 237 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  35.42 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  34.65 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  49.12 
 
 		 354 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  32.38 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  33.04 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0873  OmpA/MotB domain protein  33.63 
 
 		 314 aa  55.5  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1976  OmpA/MotB domain protein  34 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0825703  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  45.9 
 
 		 358 aa  55.5  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  36.97 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  40.95 
 
 		 348 aa  55.5  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  35.58 
 
 		 345 aa  54.7  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  38.24 
 
 		 409 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  36.27 
 
 		 401 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1334  OmpA/MotB domain protein  36 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471341  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  31.07 
 
 		 330 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  33.01 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  32.43 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  33.01 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  32.38 
 
 		 236 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  34.62 
 
 		 337 aa  53.5  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  36.63 
 
 		 415 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2499  hypothetical protein  34.12 
 
 		 240 aa  53.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  34.68 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  31.43 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  32.38 
 
 		 240 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  31.48 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  38 
 
 		 337 aa  53.5  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  33.66 
 
 		 228 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  33.33 
 
 		 229 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3582  OmpA/MotB domain protein  30.43 
 
 		 366 aa  52.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.645571  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4248  OmpA/MotB domain-containing protein  35.64 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000908263  unclonable  0.0000000127118 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 440 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1832  OmpA/MotB  39.45 
 
 		 523 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  33.9 
 
 		 352 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  32.38 
 
 		 247 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  34.86 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  31.43 
 
 		 240 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  33.66 
 
 		 230 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  33.66 
 
 		 230 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  33.66 
 
 		 230 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  33.66 
 
 		 230 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  32.38 
 
 		 229 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  33.66 
 
 		 230 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  33.66 
 
 		 230 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  33.66 
 
 		 230 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0248  OmpA/MotB domain protein  41.49 
 
 		 367 aa  52  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 226 aa  52  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  33.65 
 
 		 269 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4226  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 234 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171921  normal  0.240797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7252  OmpA/MotB domain-containing protein  31.13 
 
 		 200 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134508  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  34.26 
 
 		 221 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  34.26 
 
 		 221 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  34.26 
 
 		 221 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  38.27 
 
 		 355 aa  51.2  0.000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000658717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  33.65 
 
 		 269 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  33.96 
 
 		 319 aa  51.2  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  37.74 
 
 		 669 aa  51.2  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  35.64 
 
 		 225 aa  51.2  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>