More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0324 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0324  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
201 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0261  OmpA/MotB domain-containing protein  66.67 
 
 
201 aa  286  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.836799  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2172  OmpA domain-containing protein  44.16 
 
 
199 aa  180  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3785  OmpA/MotB domain-containing protein  34.52 
 
 
191 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000797099  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  47.83 
 
 
220 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  43.4 
 
 
320 aa  58.9  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3328  OmpA/MotB  39.22 
 
 
273 aa  58.5  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  34.58 
 
 
348 aa  57.4  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 
344 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 
288 aa  57.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  46.38 
 
 
221 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  46.38 
 
 
221 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  46.38 
 
 
221 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  35.58 
 
 
244 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3958  OmpA/MotB domain protein  32.09 
 
 
499 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.330203 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  37.74 
 
 
318 aa  56.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  32.41 
 
 
345 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 
228 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.62 
 
 
407 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  34.86 
 
 
210 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  34.86 
 
 
210 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  46.48 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  35.24 
 
 
264 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.52 
 
 
607 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  46.48 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0704  OmpA/MotB domain protein  31.78 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 
222 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3934  OmpA/MotB domain protein  34.62 
 
 
358 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000488148  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  40 
 
 
478 aa  53.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  35 
 
 
217 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.84 
 
 
222 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 
222 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  34.58 
 
 
200 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  36.84 
 
 
222 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  46.48 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 
222 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 
222 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  33.09 
 
 
243 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 
222 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2314  OmpA/MotB domain protein  41.24 
 
 
278 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104336  normal  0.160283 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  40 
 
 
326 aa  52.8  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  43.66 
 
 
242 aa  53.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  40.85 
 
 
219 aa  53.1  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  33.98 
 
 
239 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 
355 aa  52.4  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  32.38 
 
 
294 aa  52.4  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  37.14 
 
 
230 aa  52.4  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3488  ompA family protein  35.19 
 
 
168 aa  52.4  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  35.19 
 
 
168 aa  52.4  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2839  OmpA/MotB domain protein  36.04 
 
 
471 aa  52.4  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0821  ompA family protein  35.19 
 
 
168 aa  52.4  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  43.66 
 
 
219 aa  52  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
445 aa  52  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  33.98 
 
 
229 aa  52  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  33.98 
 
 
217 aa  51.6  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  36.89 
 
 
167 aa  51.6  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  33.01 
 
 
239 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  33.01 
 
 
321 aa  51.6  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2581  OmpA family protein  37.63 
 
 
209 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  42.25 
 
 
210 aa  51.6  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2953  ompA family protein  37.63 
 
 
224 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0436  OmpA family protein  37.63 
 
 
224 aa  51.2  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0192  OmpA family protein  37.63 
 
 
224 aa  51.2  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  37.63 
 
 
224 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2891  ompA family protein  37.63 
 
 
224 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  41.67 
 
 
212 aa  51.2  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5561  OmpA/MotB domain protein  32.09 
 
 
276 aa  51.6  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  31.78 
 
 
229 aa  50.8  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  34.65 
 
 
213 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  45.16 
 
 
215 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  32 
 
 
361 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  31.73 
 
 
230 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  37.63 
 
 
224 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  32.69 
 
 
230 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  38.57 
 
 
321 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0955  OmpA family protein  37.63 
 
 
179 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  42.25 
 
 
214 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  42.25 
 
 
217 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  32.08 
 
 
330 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  34.91 
 
 
296 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3010  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 
215 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354586  normal  0.0152683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  31.73 
 
 
230 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6593  OmpA/MotB family outer membrane protein  29.87 
 
 
235 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13573  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  40.24 
 
 
348 aa  50.1  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
228 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0973  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.62 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0727581  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3372  OmpA/MotB domain protein  32.74 
 
 
266 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363185  hitchhiker  0.00000000701335 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  31.73 
 
 
230 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  35.51 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  32.74 
 
 
227 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  43.48 
 
 
241 aa  49.7  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  36.7 
 
 
227 aa  49.3  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  43.48 
 
 
241 aa  49.7  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  40.85 
 
 
229 aa  49.3  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  39.02 
 
 
229 aa  49.3  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  33.59 
 
 
352 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  46.38 
 
 
230 aa  49.3  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  44.93 
 
 
226 aa  48.9  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2977  OmpA/MotB domain protein  31.68 
 
 
198 aa  48.9  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  34.29 
 
 
669 aa  48.9  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>