More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0261 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0261  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 201 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.836799  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0324  OmpA/MotB domain protein  66.67 
 
 		 201 aa  286  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2172  OmpA domain-containing protein  46.19 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3785  OmpA/MotB domain-containing protein  36.73 
 
 		 191 aa  95.5  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000797099  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 		 244 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  41.28 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  41.28 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  34.19 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  37.4 
 
 		 352 aa  65.1  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  39.06 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  34.56 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  36.75 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  36.54 
 
 		 348 aa  62.4  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.9 
 
 		 220 aa  62  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  35.66 
 
 		 376 aa  61.6  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  36.79 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  37.38 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  37.88 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3958  OmpA/MotB domain protein  37.74 
 
 		 499 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.330203 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.13 
 
 		 607 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  39.62 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  33.63 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  32.76 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  36 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  40.95 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3328  OmpA/MotB  39.22 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  40 
 
 		 481 aa  58.5  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  36.75 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  29.86 
 
 		 367 aa  58.2  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.46 
 
 		 407 aa  58.2  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  33.94 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  34.21 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  38.95 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.95 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  38.95 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  38.61 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  38.95 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  38.95 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  38.95 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  38.95 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2581  OmpA family protein  40.43 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2891  ompA family protein  40.43 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0436  OmpA family protein  40.43 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  40.43 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2953  ompA family protein  40.43 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0192  OmpA family protein  40.43 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  36.04 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  34.26 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0955  OmpA family protein  40.43 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  33.96 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  40.43 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  36.19 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  36.36 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  33.64 
 
 		 318 aa  55.5  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  33.96 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  32.74 
 
 		 326 aa  55.1  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  33.96 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2314  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 278 aa  55.1  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104336  normal  0.160283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  39 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  36.63 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  38.32 
 
 		 320 aa  54.7  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3010  OmpA/MotB domain protein  38.95 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354586  normal  0.0152683 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  37.25 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3934  OmpA/MotB domain protein  37.8 
 
 		 358 aa  53.9  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000488148  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  31.65 
 
 		 355 aa  54.7  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  36.63 
 
 		 404 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  37.39 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  33.03 
 
 		 656 aa  53.9  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  46.27 
 
 		 168 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3488  ompA family protein  46.27 
 
 		 168 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  34.21 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  38.24 
 
 		 288 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  31.82 
 
 		 463 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  36.27 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4535  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  37.04 
 
 		 169 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  45.78 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  35.94 
 
 		 486 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0821  ompA family protein  46.27 
 
 		 168 aa  53.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 220 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51710  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  37.04 
 
 		 168 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147686  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  35.64 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  35.64 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  37.84 
 
 		 345 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  33.65 
 
 		 230 aa  52.8  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3148  OmpA/MotB domain-containing protein  36.79 
 
 		 371 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597966  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>