229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2172 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2172  OmpA domain-containing protein  100 
 
 		 199 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0261  OmpA/MotB domain-containing protein  46.19 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.836799  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0324  OmpA/MotB domain protein  44.16 
 
 		 201 aa  180  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3785  OmpA/MotB domain-containing protein  31.41 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000797099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 240 aa  62  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  37 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  39 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3958  OmpA/MotB domain protein  28.95 
 
 		 499 aa  58.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.330203 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  39 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  35.71 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2581  OmpA family protein  43.16 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0955  OmpA family protein  43.16 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0192  OmpA family protein  43.16 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0436  OmpA family protein  43.16 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2953  ompA family protein  43.16 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  43.16 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2891  ompA family protein  43.16 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  36 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  42.11 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  37.62 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  37.37 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  38.14 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  38.14 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  38.14 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  32.76 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  32.76 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6051  OmpA/MotB domain protein  36.54 
 
 		 642 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  34.31 
 
 		 264 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  31.07 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3010  OmpA/MotB domain protein  37.76 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354586  normal  0.0152683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  31.07 
 
 		 230 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  31.39 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  31.07 
 
 		 230 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0973  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.76 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0727581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 294 aa  54.3  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  43.28 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  43.28 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  43.28 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  36.46 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  32.14 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.46 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  36.46 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  36.46 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  41.77 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000937501  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  31.78 
 
 		 288 aa  53.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  26.78 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  34.34 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.28 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  34.58 
 
 		 348 aa  52.4  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  41.77 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  31.25 
 
 		 326 aa  52.4  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  35 
 
 		 330 aa  52.4  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7209  OmpA/MotB domain protein  42.11 
 
 		 652 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0110011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3484  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 168 aa  52  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  41.77 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.52 
 
 		 607 aa  51.6  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  31.07 
 
 		 230 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  34.34 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0770  OmpA/MotB domain protein  40.51 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244637 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  48.48 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0841  OmpA/MotB domain protein  40.51 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0197529 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  34.34 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  31.67 
 
 		 321 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  34.26 
 
 		 296 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2188  OmpA/MotB  30.21 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.166555  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  33.96 
 
 		 669 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  35.45 
 
 		 485 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  34.62 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  30.15 
 
 		 243 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0672  OmpA/MotB domain-containing protein  44.29 
 
 		 165 aa  49.3  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  39.44 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  31.17 
 
 		 341 aa  48.9  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  34.55 
 
 		 485 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  34.29 
 
 		 345 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  35.19 
 
 		 485 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 376 aa  48.5  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  34.55 
 
 		 485 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  36.21 
 
 		 352 aa  48.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  35.45 
 
 		 481 aa  48.1  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  30.77 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  30.23 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0704  OmpA/MotB domain protein  29.2 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  33.01 
 
 		 355 aa  47.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  38.03 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  39.44 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  31.78 
 
 		 656 aa  47.8  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0973  OmpA/MotB domain-containing protein  32.41 
 
 		 267 aa  47  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1848  NAD-dependent DNA ligase  30.84 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.449373  normal  0.815473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.65 
 
 		 407 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  38.24 
 
 		 261 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  39.71 
 
 		 261 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1207  OmpA/MotB domain-containing protein  33.05 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000250814  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>