More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0672 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0672  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 165 aa  339  8e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3488  ompA family protein  66.88 
 
 		 168 aa  214  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0821  ompA family protein  66.88 
 
 		 168 aa  214  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  66.88 
 
 		 168 aa  214  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  55.15 
 
 		 168 aa  190  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0693  OmpA/MotB  58.16 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4250  hypothetical protein  60.99 
 
 		 159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4669  OmpA/MotB domain protein  56.41 
 
 		 172 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3844  putative outer membrane lipoprotein  57.05 
 
 		 160 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00547019  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02494  predicted outer membrane lipoprotein  56.77 
 
 		 160 aa  175  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02458  hypothetical protein  56.77 
 
 		 160 aa  175  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0788684  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1078  putative outer membrane lipoprotein  56.77 
 
 		 160 aa  175  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0037573  hitchhiker  0.00684711 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2889  putative outer membrane lipoprotein  56.77 
 
 		 160 aa  175  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00115542  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2764  putative outer membrane lipoprotein  56.77 
 
 		 160 aa  175  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000137509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1069  OmpA/MotB domain protein  56.77 
 
 		 160 aa  175  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000483624  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2757  putative outer membrane lipoprotein  56.13 
 
 		 160 aa  174  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.116959  decreased coverage  0.00399171 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3084  putative outer membrane lipoprotein  53.25 
 
 		 161 aa  169  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0765  OmpA/MotB domain-containing protein  57.45 
 
 		 163 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4533  OmpA/MotB domain-containing protein  55.32 
 
 		 162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4667  OmpA/MotB domain-containing protein  55.32 
 
 		 163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.153114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  50.32 
 
 		 167 aa  157  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2223  OmpA/MotB  53.47 
 
 		 186 aa  153  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3484  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 168 aa  136  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3618  OmpA/MotB domain-containing protein  42.24 
 
 		 185 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5258  OmpA/MotB domain-containing protein  41.77 
 
 		 170 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3341  OmpA/MotB  41.77 
 
 		 170 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5026  OmpA/MotB domain-containing protein  41.77 
 
 		 170 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11353  normal  0.0977146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4955  OmpA/MotB domain-containing protein  45.19 
 
 		 170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.782858 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4435  OmpA/MotB domain-containing protein  45.19 
 
 		 170 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0232251  hitchhiker  0.000146268 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0645  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.19 
 
 		 169 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0623294  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0237  OmpA/MotB  40.14 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.064428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  41.03 
 
 		 206 aa  91.7  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  41.03 
 
 		 206 aa  91.3  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.32 
 
 		 248 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  41.18 
 
 		 331 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  35.25 
 
 		 623 aa  85.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 		 189 aa  85.5  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  36.52 
 
 		 216 aa  85.1  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  36.69 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  37.8 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  33.85 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  37.01 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  37.01 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  38.79 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  45.74 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  52.7 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  52.7 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  36.75 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  39.2 
 
 		 241 aa  80.9  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  38.6 
 
 		 264 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  41.9 
 
 		 230 aa  80.5  0.000000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  39.81 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  38.79 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  40 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  41.49 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  39.39 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  38.66 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  56.72 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  36.8 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  36.57 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  37.58 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  36.22 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  35.43 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  36.22 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  36.22 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  42.55 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  42.55 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  42.55 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  40.57 
 
 		 367 aa  78.6  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  38.98 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  55.22 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  51.39 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  39.53 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  36.22 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  36.22 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  36.22 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  36.22 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  38.83 
 
 		 345 aa  78.6  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  39.53 
 
 		 263 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  53.73 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  39.53 
 
 		 260 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  39.45 
 
 		 241 aa  77.4  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  39.45 
 
 		 241 aa  77.4  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  39.53 
 
 		 260 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  38.98 
 
 		 305 aa  77  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  38.6 
 
 		 227 aa  77  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  35.9 
 
 		 235 aa  77.4  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  36.61 
 
 		 236 aa  77  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  37.93 
 
 		 239 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  40.31 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  33.33 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  31.97 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  37.07 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  38.03 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  38.03 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>