More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2223 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2223  OmpA/MotB  100 
 
 		 186 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  57.23 
 
 		 167 aa  167  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0672  OmpA/MotB domain-containing protein  52.87 
 
 		 165 aa  164  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0693  OmpA/MotB  56.55 
 
 		 166 aa  164  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4669  OmpA/MotB domain protein  55.19 
 
 		 172 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  51.9 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4667  OmpA/MotB domain-containing protein  55.94 
 
 		 163 aa  158  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.153114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4533  OmpA/MotB domain-containing protein  55.24 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4250  hypothetical protein  54.61 
 
 		 159 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3488  ompA family protein  48.39 
 
 		 168 aa  150  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0821  ompA family protein  48.39 
 
 		 168 aa  150  8.999999999999999e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  48.39 
 
 		 168 aa  150  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0765  OmpA/MotB domain-containing protein  53.85 
 
 		 163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3618  OmpA/MotB domain-containing protein  44.51 
 
 		 185 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5258  OmpA/MotB domain-containing protein  43.93 
 
 		 170 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3341  OmpA/MotB  43.93 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5026  OmpA/MotB domain-containing protein  43.93 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11353  normal  0.0977146 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3084  putative outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 161 aa  124  9e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.061063 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1069  OmpA/MotB domain protein  41.14 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000483624  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02494  predicted outer membrane lipoprotein  41.14 
 
 		 160 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2764  putative outer membrane lipoprotein  41.14 
 
 		 160 aa  123  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000137509  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1078  putative outer membrane lipoprotein  41.14 
 
 		 160 aa  123  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0037573  hitchhiker  0.00684711 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3844  putative outer membrane lipoprotein  41.4 
 
 		 160 aa  123  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00547019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2889  putative outer membrane lipoprotein  41.14 
 
 		 160 aa  123  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00115542  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0237  OmpA/MotB  45.77 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.064428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02458  hypothetical protein  41.14 
 
 		 160 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0788684  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2757  putative outer membrane lipoprotein  40.76 
 
 		 160 aa  122  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.116959  decreased coverage  0.00399171 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3484  OmpA/MotB domain-containing protein  46.94 
 
 		 168 aa  122  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0645  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.76 
 
 		 169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0623294  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4435  OmpA/MotB domain-containing protein  46.1 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0232251  hitchhiker  0.000146268 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4955  OmpA/MotB domain-containing protein  42.24 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.782858 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  47.62 
 
 		 206 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  47.62 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.71 
 
 		 248 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  38.22 
 
 		 166 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  43.14 
 
 		 214 aa  88.2  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  42.16 
 
 		 219 aa  87.8  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  42.16 
 
 		 242 aa  85.5  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  43.14 
 
 		 219 aa  85.5  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 218 aa  84.7  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 218 aa  84.7  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  42.16 
 
 		 210 aa  84.3  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  40.38 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  41.18 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  40.2 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  41.35 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  41.35 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  41.28 
 
 		 344 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  44.66 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  39.16 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  39.66 
 
 		 486 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  41.67 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  39.16 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  41.35 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  39.01 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  39.16 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  41.35 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1832  OmpA/MotB  49.33 
 
 		 523 aa  79  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  45.1 
 
 		 607 aa  79.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  43.12 
 
 		 350 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  43.12 
 
 		 350 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  37.4 
 
 		 240 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  39.16 
 
 		 263 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  48.39 
 
 		 402 aa  78.2  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  42.72 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  41 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1745  OmpA domain-containing protein  44 
 
 		 524 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.155252  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  40.37 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  40.37 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  40.37 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  42.57 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  39.45 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  42.57 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  40.43 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  39.32 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  32.53 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  42.72 
 
 		 337 aa  75.9  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06186  hypothetical protein  32.26 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  34.56 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  38.39 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  34.1 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  40.19 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  50.72 
 
 		 487 aa  75.5  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  44.68 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  40.37 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  40.37 
 
 		 345 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  37.72 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  39.81 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1139  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.528624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  42.57 
 
 		 344 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>