More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4955 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4955  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 170 aa  340  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.782858 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4435  OmpA/MotB domain-containing protein  98.24 
 
 		 170 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0232251  hitchhiker  0.000146268 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3341  OmpA/MotB  87.65 
 
 		 170 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5026  OmpA/MotB domain-containing protein  87.65 
 
 		 170 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11353  normal  0.0977146 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5258  OmpA/MotB domain-containing protein  87.06 
 
 		 170 aa  300  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0645  OmpA/MotB family outer membrane protein  86.39 
 
 		 169 aa  276  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0623294  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3618  OmpA/MotB domain-containing protein  78.95 
 
 		 185 aa  269  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4669  OmpA/MotB domain protein  44.08 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0672  OmpA/MotB domain-containing protein  42.77 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3488  ompA family protein  41.51 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0821  ompA family protein  41.51 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4667  OmpA/MotB domain-containing protein  45.77 
 
 		 163 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.153114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4533  OmpA/MotB domain-containing protein  44.37 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0765  OmpA/MotB domain-containing protein  45.07 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0693  OmpA/MotB  45.07 
 
 		 166 aa  117  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2223  OmpA/MotB  46.85 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  42.86 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  39.1 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4250  hypothetical protein  41.84 
 
 		 159 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3484  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3844  putative outer membrane lipoprotein  33.33 
 
 		 160 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00547019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2757  putative outer membrane lipoprotein  34.19 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.116959  decreased coverage  0.00399171 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1069  OmpA/MotB domain protein  34.19 
 
 		 160 aa  92  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000483624  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02494  predicted outer membrane lipoprotein  33.55 
 
 		 160 aa  91.7  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1078  putative outer membrane lipoprotein  33.55 
 
 		 160 aa  91.7  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0037573  hitchhiker  0.00684711 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02458  hypothetical protein  33.55 
 
 		 160 aa  91.7  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0788684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  36.17 
 
 		 240 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2764  putative outer membrane lipoprotein  33.55 
 
 		 160 aa  91.7  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000137509  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2889  putative outer membrane lipoprotein  33.55 
 
 		 160 aa  91.7  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00115542  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 270 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  43.4 
 
 		 261 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3084  putative outer membrane lipoprotein  33.77 
 
 		 161 aa  89.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0237  OmpA/MotB  34.51 
 
 		 170 aa  87  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.064428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 228 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  42.86 
 
 		 243 aa  85.5  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  40.95 
 
 		 228 aa  85.1  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  43.81 
 
 		 221 aa  85.1  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 228 aa  85.1  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  42.86 
 
 		 220 aa  84.7  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  37.21 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  37.21 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  39.05 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  39.52 
 
 		 269 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  38.1 
 
 		 294 aa  81.3  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  31.69 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  39.62 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  39.62 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  39.52 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  37.14 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  40.4 
 
 		 447 aa  79  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  43.4 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 		 263 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  39.05 
 
 		 209 aa  77.8  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  34.15 
 
 		 236 aa  77.8  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 262 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 		 219 aa  77.8  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  34.4 
 
 		 217 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 261 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 263 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  39.6 
 
 		 239 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  40.2 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  40.2 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  37.7 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  33.9 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.7 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  37.7 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  35.85 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  37.84 
 
 		 320 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  38.46 
 
 		 375 aa  75.5  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 375 aa  75.5  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  39.09 
 
 		 334 aa  75.1  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  31.93 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  34.4 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  33.59 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.35 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  36.72 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  38.64 
 
 		 270 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  37.62 
 
 		 231 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  39 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  35.85 
 
 		 217 aa  74.3  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 		 209 aa  74.3  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  37.96 
 
 		 326 aa  73.9  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  36.79 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  33.62 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  35.85 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>