More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3934 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3934  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
358 aa  729    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000488148  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0626  OmpA/MotB domain protein  29.4 
 
 
366 aa  102  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153451  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0237  OmpA/MotB domain protein  34.46 
 
 
491 aa  82.8  0.000000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  28.21 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  46.67 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  40.24 
 
 
240 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  51.06 
 
 
228 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  51.06 
 
 
228 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  51.06 
 
 
228 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  51.25 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  41.12 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  41.12 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  56.34 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  49.33 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  41.12 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  46.15 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  54.79 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  49.35 
 
 
216 aa  72.4  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  43.52 
 
 
208 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  52 
 
 
239 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  52.63 
 
 
212 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  51.32 
 
 
294 aa  72  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  53.42 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  47.47 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  46.15 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  48.61 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  44.76 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  34.25 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  56.94 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3958  OmpA/MotB domain protein  46.58 
 
 
499 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.330203 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  50.67 
 
 
220 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  53.52 
 
 
221 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  48 
 
 
231 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1206  OmpA/MotB domain-containing protein  34.59 
 
 
191 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000845715  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1207  OmpA/MotB domain-containing protein  44.71 
 
 
191 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000250814  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  52 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  43.62 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4332  hypothetical protein  52.05 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  46.59 
 
 
224 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  26.69 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  52 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  48.65 
 
 
463 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  34.38 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1149  OmpA/MotB domain-containing protein  41.41 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.825601  normal  0.159569 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4287  OmpA/MotB domain-containing protein  47.89 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  57.97 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1277  OmpA/MotB domain-containing protein  33.73 
 
 
191 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000882937  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  50.63 
 
 
224 aa  68.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3339  OmpA family protein  45.45 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3027  OmpA/MotB domain-containing protein  48.61 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232741  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1351  OmpA/MotB domain protein  48.61 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000530028  unclonable  0.0000000000012991 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3170  OmpA/MotB domain-containing protein  48.61 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000129051  hitchhiker  0.0000476695 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3012  OmpA/MotB domain-containing protein  48.61 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000126863  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  52.63 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06186  hypothetical protein  41.76 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  51.35 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  48.68 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0237  OmpA/MotB  44.9 
 
 
170 aa  67.8  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.064428  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  48.68 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1848  NAD-dependent DNA ligase  31.52 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.449373  normal  0.815473 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  30.1 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50810  hypothetical protein  52.05 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0075061 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  52.11 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  50.67 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  32.69 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  51.39 
 
 
218 aa  67  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  55.56 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  55.56 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  52.11 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  44.12 
 
 
352 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  48.68 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  34.92 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  55.56 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  54.17 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2674  OmpA/MotB domain-containing protein  47.95 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000176163  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2281  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  34.58 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  50 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  55.56 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  52.11 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  25.93 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  42.06 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  26.21 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  48 
 
 
228 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1128  OmpA/MotB domain protein  46.48 
 
 
344 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  25.85 
 
 
319 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1164  OmpA/MotB domain-containing protein  46.48 
 
 
325 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  33.15 
 
 
350 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  50.7 
 
 
375 aa  65.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1228  OmpA/MotB  47.13 
 
 
364 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  54.17 
 
 
242 aa  65.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  50.7 
 
 
375 aa  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  49.33 
 
 
220 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  43.59 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>