More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0362 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  63.66 
 
 
1014 aa  947    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  77.58 
 
 
2091 aa  3066    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  100 
 
 
2073 aa  4041    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  74.93 
 
 
2092 aa  2939    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  79.48 
 
 
2078 aa  3141    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  65.62 
 
 
1813 aa  1338    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  77.49 
 
 
2075 aa  3022    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  80.72 
 
 
2078 aa  3234    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1154  large adhesin  33.27 
 
 
3554 aa  422  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  31.1 
 
 
2906 aa  327  1e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  69.47 
 
 
1411 aa  327  2e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0176  Hemagluttinin domain protein  71.84 
 
 
209 aa  286  2.0000000000000002e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  60.31 
 
 
601 aa  280  2e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1085  large adhesin  31.23 
 
 
3737 aa  254  1e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0383  large adhesin  28.59 
 
 
4238 aa  214  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  28.15 
 
 
2851 aa  206  4e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  37.92 
 
 
3920 aa  202  3.9999999999999996e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  27.15 
 
 
2914 aa  166  4.0000000000000004e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  28.24 
 
 
5143 aa  154  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  42.86 
 
 
998 aa  147  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  27.32 
 
 
4526 aa  147  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1616  large adhesin  29.91 
 
 
3078 aa  138  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  46.81 
 
 
1230 aa  128  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1341  YadA domain protein  46.43 
 
 
563 aa  119  6e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  50.42 
 
 
691 aa  117  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  50.42 
 
 
600 aa  117  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  45.19 
 
 
1333 aa  114  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  39.72 
 
 
595 aa  111  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1334  YadA domain protein  43.57 
 
 
565 aa  110  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  43.7 
 
 
1065 aa  108  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  53.49 
 
 
1212 aa  102  8e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  45.37 
 
 
572 aa  97.8  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0873  OmpA/MotB domain protein  32.82 
 
 
314 aa  93.2  5e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0248  OmpA/MotB domain protein  31.01 
 
 
367 aa  92.8  6e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  29.26 
 
 
4726 aa  92  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  25.78 
 
 
827 aa  88.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  28.34 
 
 
2095 aa  85.5  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  25.46 
 
 
1186 aa  85.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  25.27 
 
 
3635 aa  82  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  31.3 
 
 
1613 aa  80.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  25.08 
 
 
1068 aa  80.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  31.97 
 
 
4191 aa  79.3  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  27.64 
 
 
962 aa  78.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  28.06 
 
 
1012 aa  78.2  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  30.53 
 
 
1405 aa  77.4  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  30.81 
 
 
1259 aa  75.9  0.000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  27.07 
 
 
2868 aa  74.7  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  32.03 
 
 
1674 aa  74.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  34.29 
 
 
4384 aa  73.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  27.14 
 
 
3126 aa  73.2  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  28.89 
 
 
1440 aa  72.4  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0311  Brp family immunodominant surface antigen  39.42 
 
 
551 aa  72  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  48 
 
 
1390 aa  70.5  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  23.45 
 
 
735 aa  69.7  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  46.74 
 
 
1190 aa  69.7  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  46.67 
 
 
2504 aa  69.3  0.0000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0314  Brp family immunodominant surface antigen  50 
 
 
1235 aa  68.9  0.0000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  30.45 
 
 
877 aa  68.6  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  30.58 
 
 
1197 aa  67.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  30.58 
 
 
1197 aa  68.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0589  adhesin  32.36 
 
 
386 aa  68.2  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  27.5 
 
 
2493 aa  67.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  30.58 
 
 
1197 aa  68.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  26.56 
 
 
2866 aa  67  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  27.29 
 
 
617 aa  66.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  27.2 
 
 
1451 aa  67  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  24.32 
 
 
1117 aa  67  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  30.38 
 
 
3718 aa  65.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  26.38 
 
 
1072 aa  65.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  25.63 
 
 
2392 aa  65.5  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  32.76 
 
 
548 aa  65.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  27.42 
 
 
898 aa  64.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  27.68 
 
 
1125 aa  63.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  25.63 
 
 
3192 aa  64.3  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  26.54 
 
 
2832 aa  63.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  40 
 
 
597 aa  63.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  25.71 
 
 
810 aa  63.2  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  40 
 
 
597 aa  63.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  27.11 
 
 
2396 aa  63.2  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  40 
 
 
597 aa  63.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  28.03 
 
 
575 aa  62.8  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  24.3 
 
 
737 aa  62.4  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0602  adhesin  31.69 
 
 
404 aa  62.4  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  37.61 
 
 
1549 aa  61.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  33.14 
 
 
270 aa  61.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  25.83 
 
 
1713 aa  61.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  38.46 
 
 
1246 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  25.89 
 
 
1588 aa  61.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  46.58 
 
 
330 aa  60.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  27.31 
 
 
1616 aa  60.1  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  27.31 
 
 
1616 aa  60.1  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  27.31 
 
 
1616 aa  59.7  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  27.57 
 
 
536 aa  59.7  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  37.74 
 
 
963 aa  59.7  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  43.18 
 
 
990 aa  58.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  25.42 
 
 
2814 aa  58.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1182  YadA domain protein  37.7 
 
 
224 aa  58.5  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  31.58 
 
 
3355 aa  57.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  30.26 
 
 
650 aa  57.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  28.28 
 
 
2505 aa  57.4  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.987353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>