169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0176 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0176  Hemagluttinin domain protein  100 
 
 		 209 aa  412  1e-114  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  73.91 
 
 		 2078 aa  292  2e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  71.77 
 
 		 1813 aa  291  7e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  71.84 
 
 		 2073 aa  286  1e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  73.63 
 
 		 2092 aa  287  1e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  73.13 
 
 		 2091 aa  285  5e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  70.87 
 
 		 2075 aa  282  3.0000000000000004e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  69.76 
 
 		 2078 aa  281  6.000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1085  large adhesin  37.8 
 
 		 3737 aa  134  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1154  large adhesin  37.78 
 
 		 3554 aa  131  9e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  40 
 
 		 2851 aa  126  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0383  large adhesin  36.32 
 
 		 4238 aa  114  8.999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  37.11 
 
 		 2914 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  43.51 
 
 		 2906 aa  111  6e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1616  large adhesin  34.78 
 
 		 3078 aa  87  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  34.27 
 
 		 3920 aa  80.9  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  39.41 
 
 		 4726 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  36.57 
 
 		 4526 aa  72.8  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  41.84 
 
 		 2868 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  37.36 
 
 		 5143 aa  70.5  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  34.34 
 
 		 548 aa  68.2  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  40.37 
 
 		 3635 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  47.62 
 
 		 4384 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  33.52 
 
 		 4191 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  38.79 
 
 		 3126 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  34.81 
 
 		 1186 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  34.13 
 
 		 1012 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  34.13 
 
 		 1068 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  34.13 
 
 		 962 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  31.82 
 
 		 2141 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  31.15 
 
 		 2095 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  32.57 
 
 		 877 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0602  adhesin  34.18 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  33.55 
 
 		 827 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  33.77 
 
 		 1405 aa  58.2  0.00000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  36.84 
 
 		 766 aa  57.4  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  35.88 
 
 		 740 aa  57.4  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  42.53 
 
 		 990 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  33.95 
 
 		 473 aa  57  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  31.43 
 
 		 691 aa  56.2  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3661  hemagluttinin-like protein  33.13 
 
 		 418 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0725058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  31.97 
 
 		 753 aa  55.8  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  33.06 
 
 		 460 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  31.29 
 
 		 1616 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  30.43 
 
 		 2866 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0589  adhesin  36.31 
 
 		 386 aa  55.5  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  31.29 
 
 		 1616 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  32.93 
 
 		 575 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  28.1 
 
 		 898 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  29.89 
 
 		 1613 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  31.29 
 
 		 1674 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  33.97 
 
 		 3718 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  32.96 
 
 		 600 aa  54.3  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  31.33 
 
 		 1446 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  28.99 
 
 		 2814 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0459  haemagluttinin family protein  39.36 
 
 		 2757 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.312259  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  32.23 
 
 		 378 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  32.67 
 
 		 1072 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  31.71 
 
 		 998 aa  53.9  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  34.16 
 
 		 1516 aa  53.9  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  30.67 
 
 		 1472 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  39.42 
 
 		 589 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  29.33 
 
 		 650 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  31.62 
 
 		 601 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  37.72 
 
 		 1117 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  31.85 
 
 		 3355 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  31.29 
 
 		 1588 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  31.29 
 
 		 1616 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  26.67 
 
 		 2493 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  30.67 
 
 		 1447 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  30.67 
 
 		 1342 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  30.67 
 
 		 1447 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  31.43 
 
 		 2505 aa  52  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  30.12 
 
 		 735 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  28.82 
 
 		 597 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  30.61 
 
 		 536 aa  51.6  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  28.82 
 
 		 597 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  28.82 
 
 		 597 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  32.9 
 
 		 878 aa  50.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  35.23 
 
 		 1654 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  37.21 
 
 		 3192 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  32.94 
 
 		 472 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  28.99 
 
 		 2778 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  30.51 
 
 		 2832 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  44.58 
 
 		 1713 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  37.04 
 
 		 1190 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  30.43 
 
 		 1854 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0957  outer membrane protein, putative  40.7 
 
 		 2025 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  29.94 
 
 		 810 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  31.18 
 
 		 737 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  28.99 
 
 		 2728 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  37.04 
 
 		 1440 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  30.57 
 
 		 2392 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6299  hemagluttinin domain-containing protein  34.85 
 
 		 654 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.525407 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  34.62 
 
 		 1204 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  34.62 
 
 		 1125 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1946  putative cell surface protein  41.18 
 
 		 1916 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6312  surface protein  38.75 
 
 		 356 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  39.36 
 
 		 1326 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  29.93 
 
 		 963 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.408762 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>