140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6299 on replicon NC_010509
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010509  Mrad2831_6299  hemagluttinin domain-containing protein  100 
 
 
654 aa  1266    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.525407 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03061  adhesin-like protein B  38.65 
 
 
989 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2585  putative haemagglutinin/invasin  35.23 
 
 
364 aa  104  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2673  hemagluttinin domain-containing protein  35.23 
 
 
364 aa  104  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1950  hypothetical protein  35.94 
 
 
364 aa  85.1  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000156547  normal  0.0548369 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  33.33 
 
 
1265 aa  84.3  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  40 
 
 
831 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  39.17 
 
 
831 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  39.17 
 
 
831 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  39.17 
 
 
816 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  39.17 
 
 
820 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  39.17 
 
 
816 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  39.17 
 
 
816 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  39.17 
 
 
816 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0768  YadA domain-containing protein  27.75 
 
 
997 aa  73.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0855  outer membrane protein XadA  36.36 
 
 
815 aa  71.6  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.912116  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  51.11 
 
 
4384 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  44.44 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2584  hypothetical protein  31.8 
 
 
615 aa  70.5  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.268174  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2672  hypothetical protein  31.8 
 
 
615 aa  70.5  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1951  hypothetical protein  31.8 
 
 
615 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000838552  normal  0.108368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6312  surface protein  46.25 
 
 
356 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  42.27 
 
 
1309 aa  65.1  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  49.45 
 
 
1190 aa  64.7  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  49.45 
 
 
1440 aa  64.7  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  49.44 
 
 
880 aa  64.7  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  58.21 
 
 
548 aa  64.3  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  53.52 
 
 
601 aa  64.3  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  48.39 
 
 
990 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  47.19 
 
 
876 aa  62.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  46.24 
 
 
2392 aa  62.4  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  47.06 
 
 
597 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  47.06 
 
 
597 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  44.64 
 
 
1390 aa  62  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  50.68 
 
 
1012 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  45.92 
 
 
1068 aa  62  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  51.39 
 
 
962 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  43.18 
 
 
472 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  54.67 
 
 
575 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  59.38 
 
 
3635 aa  62  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  41.84 
 
 
4191 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  43.86 
 
 
1117 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  54.84 
 
 
1125 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  54.84 
 
 
1204 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  43.56 
 
 
597 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  52 
 
 
589 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  49.45 
 
 
2504 aa  60.5  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  53.23 
 
 
1451 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  50 
 
 
963 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  36.62 
 
 
279 aa  60.1  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  52.94 
 
 
4726 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  53.23 
 
 
1197 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  53.23 
 
 
1197 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  53.23 
 
 
1197 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  36.21 
 
 
1814 aa  58.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  49.23 
 
 
810 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  36.18 
 
 
1447 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  36.18 
 
 
1447 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  36.18 
 
 
1446 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  47.37 
 
 
1549 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  39.39 
 
 
378 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  36.18 
 
 
1472 aa  58.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  40.21 
 
 
1713 aa  58.2  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  47.37 
 
 
1588 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  53.52 
 
 
655 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  52 
 
 
3718 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  43.18 
 
 
378 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  35.53 
 
 
1342 aa  57.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  43.18 
 
 
373 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  43.18 
 
 
373 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  47.37 
 
 
1616 aa  57.4  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  47.37 
 
 
1616 aa  57.4  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  39.39 
 
 
460 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  41.57 
 
 
878 aa  57.4  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  52.78 
 
 
1246 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  53.62 
 
 
1186 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  47.37 
 
 
1674 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  38.02 
 
 
1072 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  45.35 
 
 
536 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  46.05 
 
 
1616 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0878  hemagglutinin domain-containing protein  39.39 
 
 
525 aa  55.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  43.18 
 
 
192 aa  55.8  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  43.18 
 
 
192 aa  55.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  41.75 
 
 
1854 aa  55.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  43.43 
 
 
2868 aa  55.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  46.58 
 
 
3192 aa  55.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  45.95 
 
 
1090 aa  54.7  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  45.95 
 
 
1074 aa  54.7  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  52.11 
 
 
1654 aa  55.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  45.95 
 
 
1090 aa  54.7  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  45.95 
 
 
1090 aa  54.7  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  45.95 
 
 
1122 aa  54.7  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  45.95 
 
 
1122 aa  54.7  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  45.95 
 
 
1122 aa  54.7  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0377  YadA-like protein  42.27 
 
 
423 aa  53.9  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.337345  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  46.58 
 
 
2832 aa  53.9  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  53.06 
 
 
735 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  47.69 
 
 
877 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  48.57 
 
 
715 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  36.05 
 
 
3355 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>