93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2584 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2672  hypothetical protein  99.35 
 
 		 615 aa  1179    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2584  hypothetical protein  100 
 
 		 615 aa  1186    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.268174  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1951  hypothetical protein  98.7 
 
 		 615 aa  1168    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000838552  normal  0.108368 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2673  hemagluttinin domain-containing protein  37.39 
 
 		 364 aa  176  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2585  putative haemagglutinin/invasin  37.39 
 
 		 364 aa  176  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1950  hypothetical protein  36.71 
 
 		 364 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000156547  normal  0.0548369 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6299  hemagluttinin domain-containing protein  31.45 
 
 		 654 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.525407 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  34.74 
 
 		 880 aa  59.7  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  33.68 
 
 		 876 aa  58.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  33.71 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  25.26 
 
 		 1713 aa  58.2  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0019  repeated sequence found in lipoprotein LPP  25.97 
 
 		 540 aa  57.4  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  33.59 
 
 		 877 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  32.95 
 
 		 878 aa  53.9  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  34.11 
 
 		 597 aa  53.9  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  37.68 
 
 		 810 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  32.99 
 
 		 4384 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  34.88 
 
 		 597 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  34.88 
 
 		 597 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  37.23 
 
 		 3126 aa  51.2  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  30.43 
 
 		 279 aa  50.8  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  31.71 
 
 		 1451 aa  50.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  29.17 
 
 		 1616 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  41.18 
 
 		 460 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  37.18 
 
 		 3355 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  36.28 
 
 		 3718 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  41.18 
 
 		 378 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  30.71 
 
 		 1549 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  39.29 
 
 		 1417 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  30.86 
 
 		 1125 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  28.39 
 
 		 330 aa  49.7  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  46.88 
 
 		 2392 aa  49.3  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  29.17 
 
 		 1588 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  32.1 
 
 		 1197 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  30.86 
 
 		 1204 aa  48.9  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  32.1 
 
 		 1197 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  32.1 
 
 		 1197 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03061  adhesin-like protein B  24.14 
 
 		 989 aa  48.1  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0377  YadA-like protein  28.71 
 
 		 423 aa  47.8  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.337345  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  32.98 
 
 		 1309 aa  47.4  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  38.46 
 
 		 533 aa  47.8  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  39.47 
 
 		 3192 aa  47.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  34.43 
 
 		 1068 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0878  hemagglutinin domain-containing protein  30.77 
 
 		 525 aa  47  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  29.25 
 
 		 1440 aa  47  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  29.25 
 
 		 1190 aa  47  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  34.57 
 
 		 589 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  28.69 
 
 		 2868 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  41.18 
 
 		 1326 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  48.33 
 
 		 2141 aa  47  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  41.54 
 
 		 373 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  41.54 
 
 		 373 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  36.07 
 
 		 1186 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  41.54 
 
 		 378 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  36.07 
 
 		 1012 aa  47  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  40.3 
 
 		 1472 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  29.29 
 
 		 1616 aa  46.2  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  29.29 
 
 		 1616 aa  46.2  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  40.32 
 
 		 735 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  30.88 
 
 		 1342 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  30.88 
 
 		 1447 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  35.14 
 
 		 2832 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  30.88 
 
 		 1446 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  30.69 
 
 		 831 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  30.43 
 
 		 3635 aa  46.2  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  30.69 
 
 		 816 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  30.69 
 
 		 831 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  30.88 
 
 		 1447 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  30.69 
 
 		 816 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  30.69 
 
 		 816 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  30.69 
 
 		 831 aa  46.2  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  29.29 
 
 		 1674 aa  46.6  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  30.69 
 
 		 820 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  29.55 
 
 		 473 aa  46.2  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  30.69 
 
 		 816 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  36.84 
 
 		 1434 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  41.54 
 
 		 192 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  41.54 
 
 		 192 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  35.48 
 
 		 655 aa  45.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  52.17 
 
 		 4191 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  44.78 
 
 		 1117 aa  45.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6312  surface protein  30.43 
 
 		 356 aa  45.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  38.82 
 
 		 1353 aa  44.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  36.05 
 
 		 1546 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  33.58 
 
 		 962 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  37.1 
 
 		 575 aa  44.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  36.05 
 
 		 1471 aa  44.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  36.05 
 
 		 1471 aa  44.7  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  32.14 
 
 		 2504 aa  44.7  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  38.82 
 
 		 1854 aa  44.3  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  35.87 
 
 		 1390 aa  44.3  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  31.36 
 
 		 536 aa  43.9  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  27.91 
 
 		 1265 aa  43.5  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>