68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1950 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2585  putative haemagglutinin/invasin  97.53 
 
 
364 aa  686    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1950  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  701    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000156547  normal  0.0548369 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2673  hemagluttinin domain-containing protein  97.53 
 
 
364 aa  686    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2672  hypothetical protein  37.93 
 
 
615 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1951  hypothetical protein  37.93 
 
 
615 aa  169  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000838552  normal  0.108368 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2584  hypothetical protein  37.64 
 
 
615 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.268174  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6299  hemagluttinin domain-containing protein  35.59 
 
 
654 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.525407 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0019  repeated sequence found in lipoprotein LPP  27.34 
 
 
540 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  50.63 
 
 
2157 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3187  putative immunoglobuling-binding protein  24.38 
 
 
369 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.725317  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03061  adhesin-like protein B  35.59 
 
 
989 aa  56.6  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  38.14 
 
 
2095 aa  56.2  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1867  YadA domain-containing protein  34.55 
 
 
420 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.704815 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  34.45 
 
 
3718 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0086  YadA domain-containing protein  28.92 
 
 
599 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  34.29 
 
 
1549 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  34.29 
 
 
1674 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  34.29 
 
 
1472 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  34.29 
 
 
1446 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  34.29 
 
 
1447 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  34.29 
 
 
1616 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  34.29 
 
 
1616 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  34.29 
 
 
279 aa  50.8  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4120  hypothetical protein  35.8 
 
 
457 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  34.29 
 
 
1447 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  36.36 
 
 
735 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  34.29 
 
 
1342 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  36.7 
 
 
1072 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  46.77 
 
 
877 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  31.37 
 
 
716 aa  49.7  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  34.51 
 
 
2868 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0314  Brp family immunodominant surface antigen  26.52 
 
 
1235 aa  49.3  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  39.39 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0589  hypothetical protein  26.24 
 
 
338 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.664865 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  45 
 
 
2141 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  31.37 
 
 
716 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  22.49 
 
 
1259 aa  47.8  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4209  superfamily II helicase  32.22 
 
 
554 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.324894 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  25.07 
 
 
1814 aa  47.4  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0533  hypothetical protein  31.52 
 
 
338 aa  47  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  44.59 
 
 
1417 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  36.84 
 
 
1117 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  27.48 
 
 
3635 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  29.36 
 
 
1713 aa  46.2  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  45.16 
 
 
810 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  32.98 
 
 
2073 aa  45.1  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  36.47 
 
 
2075 aa  45.1  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  36.47 
 
 
2092 aa  45.1  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  36.47 
 
 
2091 aa  44.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  32.98 
 
 
2078 aa  45.1  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  36.47 
 
 
2078 aa  45.1  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  44.44 
 
 
1309 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0311  Brp family immunodominant surface antigen  26.05 
 
 
551 aa  44.7  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  40 
 
 
655 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  44 
 
 
1390 aa  44.7  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  40.58 
 
 
2832 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  44 
 
 
2504 aa  44.3  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  25.14 
 
 
1440 aa  43.9  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  31.36 
 
 
2906 aa  43.9  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  36.11 
 
 
2505 aa  43.5  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  36.64 
 
 
3192 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  36.47 
 
 
472 aa  43.1  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0377  YadA-like protein  34.15 
 
 
423 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.337345  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  41.56 
 
 
597 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1154  large adhesin  33.33 
 
 
3554 aa  43.1  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  41.56 
 
 
597 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  48.98 
 
 
766 aa  42.7  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  48.98 
 
 
740 aa  42.7  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>