74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0533 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0533  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  680    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0589  hypothetical protein  95.86 
 
 		 338 aa  651    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.664865 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4317  YadA domain-containing protein  58.76 
 
 		 427 aa  112  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.130798  normal  0.0481736 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1867  YadA domain-containing protein  37.8 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.704815 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  36.23 
 
 		 589 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  33.93 
 
 		 575 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  35.77 
 
 		 967 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  31.08 
 
 		 492 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  38.46 
 
 		 1417 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  33.33 
 
 		 597 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  33.33 
 
 		 597 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  33.33 
 
 		 597 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  35.82 
 
 		 2504 aa  59.7  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  30.3 
 
 		 1072 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  35.07 
 
 		 1390 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  39.78 
 
 		 1516 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  38.6 
 
 		 2095 aa  57  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  32.61 
 
 		 716 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  33.08 
 
 		 330 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  36.73 
 
 		 1451 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  36.73 
 
 		 1197 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  36.73 
 
 		 1197 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  36.73 
 
 		 1197 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  37.5 
 
 		 1916 aa  53.5  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1512  hypothetical protein  30.43 
 
 		 362 aa  53.5  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  35.71 
 
 		 1125 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  35.56 
 
 		 2078 aa  52  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  32.86 
 
 		 716 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  30.25 
 
 		 1190 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  35.71 
 
 		 1204 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  35.56 
 
 		 2073 aa  51.6  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  35.56 
 
 		 2091 aa  52  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  35.56 
 
 		 2078 aa  51.6  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  34.58 
 
 		 655 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  30.25 
 
 		 1440 aa  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  35.56 
 
 		 2092 aa  51.2  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  35.56 
 
 		 2075 aa  51.2  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1543  outer membrane protein  28.87 
 
 		 452 aa  50.8  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.316973  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  38.96 
 
 		 1212 aa  48.9  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  27.49 
 
 		 536 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  34.88 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  31.63 
 
 		 1447 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  31.63 
 
 		 1342 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  31.63 
 
 		 1447 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  31.63 
 
 		 1446 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  31.63 
 
 		 1472 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  32.81 
 
 		 977 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1950  hypothetical protein  31.52 
 
 		 364 aa  47.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000156547  normal  0.0548369 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2673  hemagluttinin domain-containing protein  31.52 
 
 		 364 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  34.88 
 
 		 1616 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  34.88 
 
 		 1616 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  34.88 
 
 		 1588 aa  47  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  34.88 
 
 		 1616 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2585  putative haemagglutinin/invasin  31.52 
 
 		 364 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  34.88 
 
 		 1549 aa  47  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1563  hypothetical protein  37.66 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000159898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  34.88 
 
 		 1674 aa  47  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2654  hypothetical protein  27.05 
 
 		 527 aa  46.6  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.481724  normal  0.288172 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  37.66 
 
 		 601 aa  45.8  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  35.29 
 
 		 998 aa  45.4  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  38.67 
 
 		 1333 aa  45.1  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  41.56 
 
 		 1065 aa  45.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  37.66 
 
 		 595 aa  44.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  30.95 
 
 		 1014 aa  45.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0533  YadA-like C-terminal region protein  32.11 
 
 		 229 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  34.67 
 
 		 600 aa  44.3  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  40 
 
 		 1713 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  34.67 
 
 		 1230 aa  43.9  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  34.44 
 
 		 572 aa  43.9  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1924  hypothetical protein, putative phage gene  30.48 
 
 		 206 aa  43.5  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.460525  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  34.67 
 
 		 691 aa  43.5  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2048  putative outer membrane protein  34.02 
 
 		 322 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  35.06 
 
 		 1411 aa  42.7  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1334  YadA domain protein  36.49 
 
 		 565 aa  42.7  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>