20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1924 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1924  hypothetical protein, putative phage gene  100 
 
 		 206 aa  410  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.460525  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1867  YadA domain-containing protein  33.33 
 
 		 420 aa  71.2  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.704815 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  26.24 
 
 		 1411 aa  51.2  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0019  repeated sequence found in lipoprotein LPP  28.45 
 
 		 540 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1341  YadA domain protein  36.36 
 
 		 563 aa  47  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0589  hypothetical protein  26.75 
 
 		 338 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.664865 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  37.08 
 
 		 601 aa  47.4  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  30.12 
 
 		 1065 aa  46.2  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2286  YadA domain-containing protein  38.98 
 
 		 1584 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0535407  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  32 
 
 		 4384 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1308  Haemagluttinin domain protein  31.71 
 
 		 308 aa  46.2  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0878  hemagglutinin domain-containing protein  30.12 
 
 		 525 aa  45.4  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  32.43 
 
 		 998 aa  45.1  0.0008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  29.46 
 
 		 1813 aa  44.3  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4120  hypothetical protein  34.15 
 
 		 457 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0533  hypothetical protein  30.48 
 
 		 338 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  31.08 
 
 		 600 aa  43.1  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  30.68 
 
 		 1230 aa  42.4  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  30.68 
 
 		 691 aa  42.7  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  30.39 
 
 		 1309 aa  42.4  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>