78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1308 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1308  Haemagluttinin domain protein  100 
 
 		 308 aa  596  1e-169  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4120  hypothetical protein  32.06 
 
 		 457 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2286  YadA domain-containing protein  41.28 
 
 		 1584 aa  94  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0535407  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0146  hypothetical protein  44.63 
 
 		 135 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0122  haemagluttinin family protein  44.63 
 
 		 135 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  44.63 
 
 		 617 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4209  superfamily II helicase  30.36 
 
 		 554 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.324894 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  44.63 
 
 		 827 aa  90.5  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  43.93 
 
 		 737 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  38.84 
 
 		 4191 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  41.44 
 
 		 3718 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  42.34 
 
 		 3355 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  37.61 
 
 		 1705 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  37.61 
 
 		 1669 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  37.61 
 
 		 1766 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  37.61 
 
 		 715 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  37.61 
 
 		 1626 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  37.61 
 
 		 1535 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  36.5 
 
 		 1012 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  36.5 
 
 		 962 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  36.5 
 
 		 1068 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  36.75 
 
 		 1654 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  36.03 
 
 		 1326 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  36.5 
 
 		 1186 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  34.71 
 
 		 650 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  36.07 
 
 		 977 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  33.77 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  36.08 
 
 		 1122 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  33.77 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  36.08 
 
 		 1090 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  36.08 
 
 		 1122 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  36.08 
 
 		 1090 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  36.08 
 
 		 1122 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  33.77 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  36.08 
 
 		 1090 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  33.77 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  33.77 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  36.08 
 
 		 1074 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0878  hemagglutinin domain-containing protein  35.2 
 
 		 525 aa  67  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  33.33 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  42 
 
 		 963 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  42 
 
 		 1246 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  33.33 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  32.62 
 
 		 533 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  34.43 
 
 		 2141 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  38.64 
 
 		 4384 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  30.88 
 
 		 1309 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0463  putative membrane-anchored cell surface protein  30.3 
 
 		 1616 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.590511  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  30.3 
 
 		 1353 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1951  membrane-anchored cell surface protein  30.3 
 
 		 1608 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2048  putative outer membrane protein  30.3 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1599  YadA-like C-terminal region protein  30.3 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0810  YadA-like C-terminal region protein  30.3 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0646  YadA-like C-terminal region protein  30.3 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0378174  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  30.3 
 
 		 1434 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1946  putative cell surface protein  29.55 
 
 		 1916 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  37.41 
 
 		 548 aa  57  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0459  haemagluttinin family protein  29.55 
 
 		 2757 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.312259  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0533  YadA-like C-terminal region protein  30.3 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2042  putative cell surface protein  29.55 
 
 		 365 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  30.1 
 
 		 1854 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0957  outer membrane protein, putative  28.79 
 
 		 2025 aa  53.1  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  29.08 
 
 		 1471 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  29.08 
 
 		 1546 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  29.08 
 
 		 1471 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  30.41 
 
 		 2505 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  31.2 
 
 		 2493 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  31.2 
 
 		 2728 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  30.56 
 
 		 597 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  31.2 
 
 		 2778 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  31.2 
 
 		 2814 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  31.2 
 
 		 2866 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  30.56 
 
 		 597 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  30.56 
 
 		 597 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1924  hypothetical protein, putative phage gene  31.71 
 
 		 206 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.460525  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1867  YadA domain-containing protein  28.89 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.704815 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  39.29 
 
 		 4726 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  33.57 
 
 		 1125 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.613322 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>