79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4209 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4209  superfamily II helicase  100 
 
 		 554 aa  1069    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.324894 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4120  hypothetical protein  63.07 
 
 		 457 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1308  Haemagluttinin domain protein  30.4 
 
 		 308 aa  89  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2286  YadA domain-containing protein  34.62 
 
 		 1584 aa  75.1  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0535407  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0122  haemagluttinin family protein  34.19 
 
 		 135 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0146  hypothetical protein  34.19 
 
 		 135 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28282  predicted protein  38.1 
 
 		 3288 aa  58.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  31.62 
 
 		 4191 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  34.35 
 
 		 575 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  33.06 
 
 		 1012 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  34.4 
 
 		 1068 aa  57  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  33.06 
 
 		 962 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  30 
 
 		 548 aa  56.6  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  34.4 
 
 		 1186 aa  56.2  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  37.74 
 
 		 737 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  29.27 
 
 		 1014 aa  54.3  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  37.11 
 
 		 650 aa  54.3  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  34.45 
 
 		 589 aa  53.5  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0878  hemagglutinin domain-containing protein  34.65 
 
 		 525 aa  53.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  35.42 
 
 		 655 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  35.9 
 
 		 617 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  30.08 
 
 		 279 aa  52  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  35.29 
 
 		 827 aa  51.2  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  34.62 
 
 		 536 aa  51.6  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  30.6 
 
 		 1390 aa  51.2  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  30.6 
 
 		 2504 aa  50.8  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6312  surface protein  33.56 
 
 		 356 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  29.84 
 
 		 1549 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  29.84 
 
 		 1616 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  29.84 
 
 		 1674 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  29.84 
 
 		 1616 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  29.84 
 
 		 1616 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1950  hypothetical protein  32.22 
 
 		 364 aa  48.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000156547  normal  0.0548369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  28.18 
 
 		 3718 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  30.58 
 
 		 2141 aa  48.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2673  hemagluttinin domain-containing protein  32.22 
 
 		 364 aa  47.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2585  putative haemagglutinin/invasin  32.22 
 
 		 364 aa  47.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  27.34 
 
 		 378 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  27.34 
 
 		 373 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  27.34 
 
 		 373 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  29.1 
 
 		 1190 aa  47.8  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  29.1 
 
 		 1440 aa  47.8  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  27.34 
 
 		 192 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  26.56 
 
 		 378 aa  47  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  27.34 
 
 		 192 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  31.71 
 
 		 1122 aa  47  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  31.71 
 
 		 1122 aa  47  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  31.71 
 
 		 1122 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  31.71 
 
 		 1090 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  31.71 
 
 		 1090 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  31.71 
 
 		 1090 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  26.56 
 
 		 460 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  28.37 
 
 		 2095 aa  46.6  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2025  hemagluttinin motif-containing protein  33 
 
 		 259 aa  46.2  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.219525 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  29.03 
 
 		 1588 aa  47  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  31.71 
 
 		 1074 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  31.11 
 
 		 963 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  24.64 
 
 		 1309 aa  45.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  30.49 
 
 		 3920 aa  45.4  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  32.67 
 
 		 998 aa  45.4  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  25.45 
 
 		 3355 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  32.06 
 
 		 1353 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  34.51 
 
 		 715 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  34.51 
 
 		 1705 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  34.51 
 
 		 1669 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  34.51 
 
 		 1766 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  34.51 
 
 		 1626 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5675  hypothetical protein  37.84 
 
 		 1065 aa  44.3  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  33.7 
 
 		 473 aa  44.3  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  28.79 
 
 		 1326 aa  44.3  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  32.06 
 
 		 1434 aa  44.3  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  30 
 
 		 1246 aa  44.3  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  34.51 
 
 		 1535 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  26.95 
 
 		 1447 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  28.24 
 
 		 1447 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  28.24 
 
 		 1472 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  29.23 
 
 		 1813 aa  43.9  0.007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  26.95 
 
 		 1446 aa  43.9  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  28.37 
 
 		 533 aa  43.5  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>