60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4120 on replicon NC_007489
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007489  RSP_4120  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  873    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4209  superfamily II helicase  63.07 
 
 		 554 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.324894 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1308  Haemagluttinin domain protein  30.89 
 
 		 308 aa  99.4  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2286  YadA domain-containing protein  34.62 
 
 		 1584 aa  73.6  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0535407  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  34.19 
 
 		 4191 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  31.45 
 
 		 1012 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  31.45 
 
 		 962 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  31.45 
 
 		 1068 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0146  hypothetical protein  33.96 
 
 		 135 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0122  haemagluttinin family protein  33.96 
 
 		 135 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  31.45 
 
 		 1186 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  30.77 
 
 		 378 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  30.77 
 
 		 373 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  30.77 
 
 		 373 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  30.77 
 
 		 192 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  30.77 
 
 		 192 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  30.77 
 
 		 3718 aa  53.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  29.27 
 
 		 378 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  29.27 
 
 		 460 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  36.36 
 
 		 617 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  33.66 
 
 		 1014 aa  52.4  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  32.8 
 
 		 3355 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  29.75 
 
 		 2141 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2673  hemagluttinin domain-containing protein  35.8 
 
 		 364 aa  50.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2585  putative haemagglutinin/invasin  35.8 
 
 		 364 aa  50.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1950  hypothetical protein  35.8 
 
 		 364 aa  50.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000156547  normal  0.0548369 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  35.35 
 
 		 827 aa  50.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  33.03 
 
 		 1326 aa  50.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  35.44 
 
 		 650 aa  50.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  36.36 
 
 		 737 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  30.51 
 
 		 1353 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  34.4 
 
 		 1390 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  33.6 
 
 		 2504 aa  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  33 
 
 		 998 aa  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  30.51 
 
 		 1434 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  34.57 
 
 		 655 aa  47.4  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  35.24 
 
 		 1813 aa  47.4  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  29.41 
 
 		 533 aa  47  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28282  predicted protein  31.88 
 
 		 3288 aa  46.6  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  33.65 
 
 		 2075 aa  45.8  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  30.49 
 
 		 3920 aa  45.8  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  34.74 
 
 		 2078 aa  45.1  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  34.74 
 
 		 2073 aa  45.1  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  36.59 
 
 		 575 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  34.74 
 
 		 2092 aa  45.8  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0878  hemagglutinin domain-containing protein  30.83 
 
 		 525 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  34.74 
 
 		 2078 aa  45.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  30.13 
 
 		 1854 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  28.78 
 
 		 4384 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1924  hypothetical protein, putative phage gene  34.15 
 
 		 206 aa  44.3  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.460525  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  30.16 
 
 		 1190 aa  44.3  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  30.16 
 
 		 1440 aa  43.9  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  26.89 
 
 		 1090 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  26.89 
 
 		 1090 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  26.89 
 
 		 1090 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  26.83 
 
 		 1122 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  26.83 
 
 		 1122 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  26.83 
 
 		 1122 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  33.33 
 
 		 536 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  26.89 
 
 		 1074 aa  43.5  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>