196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6038 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  82.45 
 
 		 1246 aa  1023    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  100 
 
 		 963 aa  1858    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  37.03 
 
 		 990 aa  326  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  37.75 
 
 		 1613 aa  291  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  35.11 
 
 		 4384 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  36.16 
 
 		 3718 aa  243  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  36.16 
 
 		 2832 aa  241  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  37.66 
 
 		 4726 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  46.48 
 
 		 3126 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  29.65 
 
 		 4191 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  42.18 
 
 		 3192 aa  189  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  28.9 
 
 		 1417 aa  179  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  35.18 
 
 		 735 aa  168  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  45.34 
 
 		 2868 aa  165  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  52.43 
 
 		 617 aa  164  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  59.73 
 
 		 827 aa  164  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  55.06 
 
 		 1068 aa  160  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  55.06 
 
 		 1012 aa  160  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  55.06 
 
 		 962 aa  160  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  29.17 
 
 		 1446 aa  159  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  30.84 
 
 		 967 aa  157  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0146  hypothetical protein  60.43 
 
 		 135 aa  155  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0122  haemagluttinin family protein  60.43 
 
 		 135 aa  155  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  49.72 
 
 		 1309 aa  154  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  33.4 
 
 		 1090 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  33.4 
 
 		 1074 aa  154  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  33.4 
 
 		 1090 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  33.4 
 
 		 1090 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  33.13 
 
 		 1122 aa  154  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  33.13 
 
 		 1122 aa  154  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  33.13 
 
 		 1122 aa  154  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  38.83 
 
 		 1654 aa  148  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  50.31 
 
 		 1326 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  43.58 
 
 		 3635 aa  146  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  38.86 
 
 		 1705 aa  146  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  39.61 
 
 		 715 aa  144  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  50.6 
 
 		 1626 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  50.6 
 
 		 1535 aa  142  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  50.6 
 
 		 1669 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  50.6 
 
 		 1766 aa  142  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  27.59 
 
 		 1197 aa  141  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  27.59 
 
 		 1197 aa  141  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  28.42 
 
 		 1451 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  27.59 
 
 		 1197 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  29.02 
 
 		 1472 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  46.47 
 
 		 378 aa  138  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  46.47 
 
 		 460 aa  138  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  33.18 
 
 		 1616 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  33.18 
 
 		 1616 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  33.18 
 
 		 1616 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  31.8 
 
 		 1588 aa  137  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  31.68 
 
 		 753 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  30.07 
 
 		 1125 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  38.36 
 
 		 1447 aa  135  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  27.33 
 
 		 1204 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  47.09 
 
 		 192 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  47.09 
 
 		 192 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  47.09 
 
 		 378 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  47.09 
 
 		 373 aa  135  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  47.09 
 
 		 373 aa  135  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  52.82 
 
 		 737 aa  134  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  38.68 
 
 		 1447 aa  134  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  39.47 
 
 		 1342 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  47.73 
 
 		 650 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  51.55 
 
 		 3355 aa  131  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  45.61 
 
 		 533 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  28.43 
 
 		 1674 aa  122  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  30.29 
 
 		 1549 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  36.76 
 
 		 597 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  36.76 
 
 		 597 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  36.76 
 
 		 597 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  47.68 
 
 		 2141 aa  119  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  39.1 
 
 		 1072 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0878  hemagglutinin domain-containing protein  40.24 
 
 		 525 aa  106  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  35.69 
 
 		 655 aa  105  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  30.89 
 
 		 1440 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  42.55 
 
 		 1353 aa  102  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  42.35 
 
 		 1854 aa  102  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  42.55 
 
 		 1434 aa  101  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  34.08 
 
 		 575 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  32.55 
 
 		 1713 aa  100  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  30.7 
 
 		 1190 aa  100  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  42.37 
 
 		 1546 aa  99.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  42.37 
 
 		 1471 aa  99.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  42.37 
 
 		 1471 aa  99.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  30.34 
 
 		 1390 aa  97.1  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  38.32 
 
 		 977 aa  96.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  41.3 
 
 		 589 aa  97.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  40.24 
 
 		 536 aa  95.1  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  34.35 
 
 		 492 aa  92.4  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  38.57 
 
 		 1814 aa  92.8  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  35.1 
 
 		 2504 aa  92  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0957  outer membrane protein, putative  37.28 
 
 		 2025 aa  91.7  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2042  putative cell surface protein  36.69 
 
 		 365 aa  90.9  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0459  haemagluttinin family protein  36.69 
 
 		 2757 aa  89.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.312259  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1946  putative cell surface protein  36.69 
 
 		 1916 aa  89.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  44 
 
 		 877 aa  88.2  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  39.24 
 
 		 548 aa  87  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  43.48 
 
 		 2392 aa  85.9  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  31.47 
 
 		 831 aa  84.3  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>