200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4704 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  100 
 
 
1072 aa  2103    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  56.23 
 
 
3718 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  46.29 
 
 
4191 aa  416  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  33.03 
 
 
3126 aa  242  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  44.37 
 
 
1417 aa  239  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  46.13 
 
 
3355 aa  220  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  37.76 
 
 
536 aa  207  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  33.47 
 
 
2832 aa  204  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  38.44 
 
 
597 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  33.8 
 
 
877 aa  197  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  35.9 
 
 
575 aa  196  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  33.1 
 
 
810 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  44.29 
 
 
597 aa  184  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  44.29 
 
 
597 aa  184  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  29.5 
 
 
1674 aa  181  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  33.02 
 
 
3192 aa  178  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  30.12 
 
 
1549 aa  172  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  36.84 
 
 
2868 aa  171  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  40.39 
 
 
589 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  27.35 
 
 
1447 aa  157  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  27.45 
 
 
1447 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  27.16 
 
 
1342 aa  155  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  41.85 
 
 
655 aa  152  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  27.17 
 
 
1472 aa  152  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  28.1 
 
 
1446 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  31.16 
 
 
472 aa  147  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  35.43 
 
 
735 aa  146  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  31.63 
 
 
4384 aa  145  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  34.18 
 
 
1190 aa  142  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  30.56 
 
 
880 aa  137  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  32.82 
 
 
1197 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  32.82 
 
 
1197 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  32.82 
 
 
1197 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  30.16 
 
 
876 aa  133  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  48.19 
 
 
330 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  30.15 
 
 
1117 aa  131  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  29.17 
 
 
4726 aa  129  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  30.26 
 
 
753 aa  129  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  32.01 
 
 
1204 aa  127  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  47.78 
 
 
831 aa  124  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  47.78 
 
 
816 aa  124  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  47.78 
 
 
831 aa  124  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  47.78 
 
 
831 aa  124  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  35.92 
 
 
963 aa  124  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  47.78 
 
 
816 aa  124  9e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  47.78 
 
 
820 aa  124  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  47.78 
 
 
816 aa  124  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  47.78 
 
 
816 aa  124  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  34.55 
 
 
2504 aa  122  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  34.22 
 
 
1390 aa  119  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  29.99 
 
 
878 aa  119  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  30.84 
 
 
1451 aa  118  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  25.82 
 
 
1065 aa  115  6e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  33.72 
 
 
2392 aa  115  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  31.65 
 
 
1613 aa  112  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  31.06 
 
 
716 aa  110  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  31.07 
 
 
716 aa  107  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  33.21 
 
 
279 aa  106  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  24.74 
 
 
1230 aa  105  7e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  31.12 
 
 
2157 aa  104  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  31.7 
 
 
962 aa  104  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  43.97 
 
 
1916 aa  103  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  33.55 
 
 
1713 aa  102  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  33.76 
 
 
1265 aa  102  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  31.37 
 
 
1012 aa  100  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  28.29 
 
 
2396 aa  98.6  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  40 
 
 
1516 aa  99  5e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  43.93 
 
 
1068 aa  98.2  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  30.92 
 
 
967 aa  98.2  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  44.51 
 
 
1186 aa  98.2  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  29.88 
 
 
1616 aa  96.7  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  29.88 
 
 
1616 aa  96.7  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0377  YadA-like protein  45.56 
 
 
423 aa  95.9  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.337345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  43.68 
 
 
1654 aa  95.5  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  30.1 
 
 
1616 aa  95.5  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  31.92 
 
 
1588 aa  95.5  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3593  YadA domain protein  35.52 
 
 
742 aa  94.7  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.50488  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  44.65 
 
 
601 aa  94.7  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03061  adhesin-like protein B  34.29 
 
 
989 aa  94.7  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  33.33 
 
 
492 aa  94  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  29.21 
 
 
1440 aa  94.4  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  32.27 
 
 
740 aa  93.2  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3661  hemagluttinin-like protein  43.48 
 
 
418 aa  93.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0725058  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  34 
 
 
1411 aa  93.6  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  31.33 
 
 
1246 aa  90.9  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6312  surface protein  40 
 
 
356 aa  89.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  42.53 
 
 
1766 aa  89.4  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  42.53 
 
 
715 aa  89.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  42.53 
 
 
1705 aa  89.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  42.53 
 
 
1669 aa  89.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  42.53 
 
 
1535 aa  89  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  42.53 
 
 
1626 aa  89  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  31.56 
 
 
766 aa  89  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  32.84 
 
 
3635 aa  88.6  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2308  Haemagluttinin domain protein  39.53 
 
 
744 aa  86.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  37.44 
 
 
990 aa  86.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  33.03 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  33.03 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  33.03 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  33.77 
 
 
378 aa  84.7  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>