204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2582 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  74.01 
 
 
3635 aa  2417    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  100 
 
 
4384 aa  8127    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  50.92 
 
 
990 aa  695    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  42.28 
 
 
2868 aa  1064    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  44.32 
 
 
1309 aa  544  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  36.26 
 
 
1613 aa  427  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  37.58 
 
 
1122 aa  346  5e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  37.31 
 
 
1074 aa  345  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  37.58 
 
 
1122 aa  344  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  36.93 
 
 
1090 aa  343  4e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  36.93 
 
 
1090 aa  343  4e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  36.93 
 
 
1090 aa  343  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  36.93 
 
 
1122 aa  342  8e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  34.12 
 
 
1246 aa  339  7e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  37.26 
 
 
3126 aa  322  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  34.95 
 
 
2157 aa  292  9e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  35.11 
 
 
963 aa  279  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  31.32 
 
 
4191 aa  279  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  44.04 
 
 
735 aa  273  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  30.72 
 
 
1447 aa  239  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  28.56 
 
 
1447 aa  236  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  34.93 
 
 
880 aa  230  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  40.75 
 
 
1626 aa  229  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  28.97 
 
 
1472 aa  229  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  40.75 
 
 
1766 aa  229  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  40.79 
 
 
1705 aa  229  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  40.75 
 
 
1535 aa  228  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  40.75 
 
 
715 aa  228  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  40.52 
 
 
1669 aa  226  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  36.04 
 
 
878 aa  226  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  36.05 
 
 
876 aa  224  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  38.21 
 
 
740 aa  224  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  43.36 
 
 
877 aa  223  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  29.33 
 
 
1446 aa  222  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0957  outer membrane protein, putative  36.66 
 
 
2025 aa  218  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  29.81 
 
 
1451 aa  218  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  46.76 
 
 
810 aa  212  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  35.2 
 
 
1197 aa  208  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  36.02 
 
 
766 aa  208  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  35.2 
 
 
1197 aa  208  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  35.2 
 
 
1197 aa  208  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  34.65 
 
 
1342 aa  207  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  45.98 
 
 
1326 aa  206  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  34.74 
 
 
1204 aa  204  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  53.66 
 
 
533 aa  204  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  36.54 
 
 
3192 aa  202  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  43.42 
 
 
472 aa  201  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  33.79 
 
 
1125 aa  202  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  53.17 
 
 
373 aa  197  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  53.17 
 
 
373 aa  197  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  53.17 
 
 
378 aa  197  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  55.61 
 
 
617 aa  194  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  53.23 
 
 
192 aa  193  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  53.23 
 
 
192 aa  193  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  51.71 
 
 
460 aa  190  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  51.71 
 
 
378 aa  190  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  29.25 
 
 
1674 aa  189  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  50.68 
 
 
962 aa  188  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  53.2 
 
 
1186 aa  188  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  54.46 
 
 
827 aa  188  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  35.54 
 
 
1549 aa  188  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  50.68 
 
 
1068 aa  187  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  53.2 
 
 
1012 aa  186  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  38.33 
 
 
2866 aa  185  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  38.79 
 
 
2141 aa  182  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  35.14 
 
 
1616 aa  180  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  35.14 
 
 
1616 aa  180  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  36.56 
 
 
2505 aa  178  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  29.14 
 
 
1440 aa  174  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  51.27 
 
 
1654 aa  174  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  48.85 
 
 
737 aa  173  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  34.45 
 
 
2832 aa  173  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  37.36 
 
 
536 aa  172  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  37.61 
 
 
575 aa  172  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0878  hemagglutinin domain-containing protein  50 
 
 
525 aa  171  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  34.58 
 
 
1588 aa  171  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  34.39 
 
 
1616 aa  169  9e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  37.71 
 
 
1117 aa  168  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  40.15 
 
 
589 aa  167  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  37.8 
 
 
2396 aa  162  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  41.04 
 
 
820 aa  160  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  41.04 
 
 
816 aa  160  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  41.04 
 
 
816 aa  160  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  41.04 
 
 
816 aa  160  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  41.04 
 
 
816 aa  160  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0146  hypothetical protein  54.49 
 
 
135 aa  160  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0122  haemagluttinin family protein  54.49 
 
 
135 aa  160  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  41.04 
 
 
831 aa  159  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  41.04 
 
 
831 aa  159  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  40.46 
 
 
831 aa  159  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  37.7 
 
 
716 aa  157  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  35.56 
 
 
716 aa  154  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  49.42 
 
 
3718 aa  150  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  47.09 
 
 
650 aa  149  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  50 
 
 
3355 aa  149  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  38.76 
 
 
898 aa  148  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  32.91 
 
 
1417 aa  145  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  33.1 
 
 
597 aa  144  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  33.73 
 
 
597 aa  144  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  33.73 
 
 
597 aa  144  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>