201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6584 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  74.96 
 
 		 2866 aa  708    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  74.87 
 
 		 2728 aa  656    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  100 
 
 		 898 aa  1677    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  74.87 
 
 		 2814 aa  676    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  74.87 
 
 		 2778 aa  658    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  73.91 
 
 		 2493 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  61.36 
 
 		 2505 aa  526  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0957  outer membrane protein, putative  55.91 
 
 		 2025 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0459  haemagluttinin family protein  55.42 
 
 		 2757 aa  313  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.312259  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1946  putative cell surface protein  55.42 
 
 		 1916 aa  312  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  43.27 
 
 		 1654 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2042  putative cell surface protein  56.03 
 
 		 365 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  56.78 
 
 		 977 aa  269  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  34.51 
 
 		 877 aa  246  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  43.4 
 
 		 1117 aa  229  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  39.45 
 
 		 715 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  39.45 
 
 		 1535 aa  228  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  69.23 
 
 		 330 aa  227  9e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  39.45 
 
 		 1766 aa  226  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  39.01 
 
 		 1705 aa  226  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  39.3 
 
 		 1669 aa  226  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  39.88 
 
 		 575 aa  224  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  40.79 
 
 		 2396 aa  223  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0810  YadA-like C-terminal region protein  55.63 
 
 		 459 aa  219  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0646  YadA-like C-terminal region protein  55.63 
 
 		 459 aa  219  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0378174  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1599  YadA-like C-terminal region protein  55.63 
 
 		 459 aa  219  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  52.16 
 
 		 1626 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  38.64 
 
 		 536 aa  212  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  40.58 
 
 		 589 aa  212  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0463  putative membrane-anchored cell surface protein  54.37 
 
 		 1616 aa  207  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.590511  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2048  putative outer membrane protein  54.37 
 
 		 322 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  47.06 
 
 		 2141 aa  206  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  40.11 
 
 		 655 aa  204  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1951  membrane-anchored cell surface protein  54.06 
 
 		 1608 aa  204  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  35.09 
 
 		 810 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  49.46 
 
 		 1434 aa  177  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  39.2 
 
 		 4384 aa  175  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  39.44 
 
 		 1074 aa  171  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  39.44 
 
 		 1122 aa  171  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  39.44 
 
 		 1090 aa  171  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  39.44 
 
 		 1122 aa  171  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  39.44 
 
 		 1090 aa  171  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  39.44 
 
 		 1090 aa  171  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  39.44 
 
 		 1122 aa  171  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  50.84 
 
 		 1353 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  29.08 
 
 		 1446 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  29.53 
 
 		 1447 aa  161  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  29.53 
 
 		 1472 aa  161  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  29.4 
 
 		 1342 aa  161  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  29.4 
 
 		 1447 aa  160  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  38.24 
 
 		 1125 aa  160  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  38.37 
 
 		 1197 aa  158  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  38.37 
 
 		 1197 aa  158  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  38.37 
 
 		 1197 aa  158  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  58.97 
 
 		 831 aa  157  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  58.33 
 
 		 816 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  58.33 
 
 		 816 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  58.33 
 
 		 816 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  58.33 
 
 		 831 aa  156  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  58.33 
 
 		 831 aa  156  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  58.33 
 
 		 820 aa  156  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  58.33 
 
 		 816 aa  156  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  31.96 
 
 		 595 aa  150  7e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0533  YadA-like C-terminal region protein  48.72 
 
 		 229 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  46.77 
 
 		 1471 aa  148  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  46.77 
 
 		 1471 aa  148  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  29.98 
 
 		 1230 aa  147  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  46.77 
 
 		 1546 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  35.29 
 
 		 472 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  48.72 
 
 		 1451 aa  142  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  35.87 
 
 		 600 aa  141  7e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  28.44 
 
 		 1616 aa  140  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  28.44 
 
 		 1616 aa  140  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  30.35 
 
 		 880 aa  140  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  28.68 
 
 		 1549 aa  140  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  30.7 
 
 		 716 aa  139  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  36.04 
 
 		 827 aa  138  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  33.73 
 
 		 4726 aa  137  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  37.31 
 
 		 691 aa  137  9.999999999999999e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  28.03 
 
 		 1674 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  28.4 
 
 		 2868 aa  134  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  30.23 
 
 		 716 aa  132  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  30.17 
 
 		 876 aa  132  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  27.51 
 
 		 1588 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  27.11 
 
 		 1065 aa  130  9.000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  40.08 
 
 		 492 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  27.51 
 
 		 1616 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  40.73 
 
 		 572 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  46.15 
 
 		 597 aa  124  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  46.15 
 
 		 597 aa  124  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  48.68 
 
 		 1440 aa  124  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  46.41 
 
 		 597 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  41.74 
 
 		 1190 aa  123  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0589  adhesin  41.43 
 
 		 386 aa  120  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  48.68 
 
 		 1390 aa  119  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  48.03 
 
 		 2504 aa  118  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  33.46 
 
 		 878 aa  118  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  39.02 
 
 		 1516 aa  117  6e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  32.46 
 
 		 279 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  46.03 
 
 		 1713 aa  117  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>