199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6349 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  82.21 
 
 
1451 aa  1441    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  76.34 
 
 
1125 aa  1189    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  100 
 
 
1197 aa  2296    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  99.33 
 
 
1197 aa  2283    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  88.54 
 
 
1204 aa  1982    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  99.33 
 
 
1197 aa  2283    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  32.56 
 
 
2832 aa  239  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  33.47 
 
 
967 aa  235  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  30.69 
 
 
4191 aa  221  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  36.28 
 
 
4384 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  33.28 
 
 
990 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  36.95 
 
 
597 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  36.95 
 
 
597 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  36.72 
 
 
597 aa  198  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  36.31 
 
 
3126 aa  197  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  34.33 
 
 
1417 aa  193  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  28.9 
 
 
1472 aa  184  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  50.59 
 
 
1326 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  30.58 
 
 
3192 aa  181  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  31.53 
 
 
2868 aa  178  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  27.02 
 
 
1588 aa  172  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  27.31 
 
 
1446 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  28.25 
 
 
1447 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  28.09 
 
 
1447 aa  163  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  39.12 
 
 
877 aa  161  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  42.41 
 
 
330 aa  160  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  33.96 
 
 
3635 aa  159  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  37.69 
 
 
1440 aa  157  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  27.27 
 
 
1616 aa  156  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  27.27 
 
 
1616 aa  156  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  37.33 
 
 
810 aa  155  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  37.44 
 
 
1190 aa  155  5e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  41.07 
 
 
575 aa  155  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  31.43 
 
 
1309 aa  151  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  30.36 
 
 
2157 aa  147  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  27.69 
 
 
1246 aa  146  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  35.88 
 
 
816 aa  145  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  35.88 
 
 
816 aa  145  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  35.88 
 
 
816 aa  145  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  35.88 
 
 
831 aa  145  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  35.88 
 
 
831 aa  145  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  35.88 
 
 
820 aa  145  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  35.88 
 
 
816 aa  145  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  42.39 
 
 
1390 aa  144  7e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  40.14 
 
 
655 aa  144  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  42.8 
 
 
1117 aa  144  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  41.26 
 
 
831 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  36.65 
 
 
536 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  49.12 
 
 
2504 aa  142  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  36.8 
 
 
589 aa  140  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  27.91 
 
 
963 aa  138  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  29.02 
 
 
1342 aa  132  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  37.82 
 
 
472 aa  131  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  32.88 
 
 
1072 aa  129  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  30.52 
 
 
3718 aa  128  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6312  surface protein  44.31 
 
 
356 aa  127  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  37.16 
 
 
898 aa  125  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  36.96 
 
 
716 aa  124  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  37.33 
 
 
1713 aa  123  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  31.57 
 
 
3355 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  35.06 
 
 
1549 aa  122  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  29.48 
 
 
1616 aa  121  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  32.86 
 
 
880 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  36.58 
 
 
716 aa  121  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  32.27 
 
 
4726 aa  119  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  32.34 
 
 
1674 aa  119  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  32.38 
 
 
876 aa  119  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  31.75 
 
 
878 aa  116  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0377  YadA-like protein  47.4 
 
 
423 aa  114  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.337345  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  31.63 
 
 
1090 aa  114  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  31.63 
 
 
1090 aa  114  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  31.63 
 
 
1090 aa  114  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  41.76 
 
 
735 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  34.72 
 
 
279 aa  110  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0314  Brp family immunodominant surface antigen  25.82 
 
 
1235 aa  107  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  46.92 
 
 
192 aa  103  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  46.92 
 
 
192 aa  103  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  35.94 
 
 
1074 aa  102  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  35.94 
 
 
1122 aa  102  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  35.94 
 
 
1122 aa  102  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  35.94 
 
 
1122 aa  102  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  52.14 
 
 
533 aa  101  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  46.92 
 
 
373 aa  101  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  46.92 
 
 
378 aa  101  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  46.92 
 
 
373 aa  101  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  39.24 
 
 
1516 aa  98.2  9e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  50 
 
 
378 aa  97.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  33.56 
 
 
2866 aa  97.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  30.1 
 
 
2095 aa  96.7  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  43.08 
 
 
460 aa  95.9  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  43.62 
 
 
492 aa  95.5  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  31.06 
 
 
1705 aa  93.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  37.19 
 
 
977 aa  92.4  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  32.69 
 
 
1916 aa  90.9  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  42.01 
 
 
1068 aa  90.1  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  33.58 
 
 
600 aa  90.1  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  42.01 
 
 
1012 aa  89.7  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  36.39 
 
 
2814 aa  89.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  42.01 
 
 
962 aa  90.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  36.24 
 
 
2396 aa  89  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>