199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6369 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  84.44 
 
 		 1125 aa  1340    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  82.33 
 
 		 1451 aa  1441    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  88.54 
 
 		 1197 aa  2010    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  88.79 
 
 		 1197 aa  2019    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  100 
 
 		 1204 aa  2322    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  88.79 
 
 		 1197 aa  2019    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  33.37 
 
 		 967 aa  231  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  35.88 
 
 		 4384 aa  211  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  31.25 
 
 		 2832 aa  211  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  29.83 
 
 		 3192 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  29.29 
 
 		 4191 aa  200  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  34.65 
 
 		 990 aa  199  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  34.23 
 
 		 1417 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  40.11 
 
 		 597 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  40.11 
 
 		 597 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  27.29 
 
 		 1588 aa  192  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  38.7 
 
 		 597 aa  191  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  36.06 
 
 		 3126 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  47.39 
 
 		 1326 aa  183  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  28.44 
 
 		 1472 aa  181  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  28.11 
 
 		 1447 aa  171  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  28.04 
 
 		 1447 aa  168  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  28.03 
 
 		 1446 aa  167  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  40.86 
 
 		 877 aa  164  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  40.68 
 
 		 330 aa  158  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  41.56 
 
 		 575 aa  157  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  30.27 
 
 		 3355 aa  155  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  36.71 
 
 		 1440 aa  154  8.999999999999999e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  31.2 
 
 		 1342 aa  153  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  36.46 
 
 		 1190 aa  152  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  35.93 
 
 		 810 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  31 
 
 		 3635 aa  149  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  31.42 
 
 		 2868 aa  146  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  37.17 
 
 		 589 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  39.44 
 
 		 655 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  40.68 
 
 		 1117 aa  141  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  36.19 
 
 		 831 aa  140  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  37.46 
 
 		 536 aa  140  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  34.33 
 
 		 816 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  34.33 
 
 		 816 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  34.33 
 
 		 816 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  34.33 
 
 		 816 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  34.33 
 
 		 820 aa  139  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  34.33 
 
 		 831 aa  138  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  34.33 
 
 		 831 aa  138  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  34.68 
 
 		 1390 aa  137  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  27.47 
 
 		 963 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  46.78 
 
 		 2504 aa  134  9e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  27.75 
 
 		 753 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  30.52 
 
 		 3718 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  32.32 
 
 		 1674 aa  132  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  33.15 
 
 		 1616 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  32.1 
 
 		 2157 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  32.14 
 
 		 1616 aa  130  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1616 aa  130  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  28.49 
 
 		 1309 aa  129  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  32.42 
 
 		 1549 aa  129  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  36.8 
 
 		 898 aa  126  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6312  surface protein  42.51 
 
 		 356 aa  124  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  35.8 
 
 		 716 aa  124  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  28.91 
 
 		 1246 aa  123  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  35.11 
 
 		 880 aa  123  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  46.34 
 
 		 472 aa  121  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  35.41 
 
 		 716 aa  121  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  31.74 
 
 		 876 aa  119  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  28.3 
 
 		 1613 aa  119  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  36.87 
 
 		 1713 aa  119  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  32.08 
 
 		 1072 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  30.4 
 
 		 878 aa  115  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  35.06 
 
 		 4726 aa  115  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0377  YadA-like protein  45.66 
 
 		 423 aa  114  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.337345  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  35.19 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0314  Brp family immunodominant surface antigen  26.49 
 
 		 1235 aa  106  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  38.43 
 
 		 735 aa  102  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  42.42 
 
 		 192 aa  102  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  42.42 
 
 		 192 aa  102  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  39.24 
 
 		 1516 aa  101  8e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  34.92 
 
 		 1090 aa  100  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  34.92 
 
 		 1074 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  34.92 
 
 		 1090 aa  100  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  34.92 
 
 		 1090 aa  100  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  34.92 
 
 		 1122 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  45.38 
 
 		 378 aa  100  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  34.92 
 
 		 1122 aa  100  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  34.92 
 
 		 1122 aa  100  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  45.38 
 
 		 373 aa  99.8  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  45.38 
 
 		 373 aa  99.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  42.03 
 
 		 378 aa  98.2  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  47.86 
 
 		 533 aa  97.8  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  40 
 
 		 460 aa  97.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  36.24 
 
 		 977 aa  95.9  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  31.05 
 
 		 1705 aa  93.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  29.13 
 
 		 2095 aa  93.2  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  32.05 
 
 		 1916 aa  90.9  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  41.42 
 
 		 1012 aa  89.7  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  41.22 
 
 		 492 aa  89.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  41.42 
 
 		 1068 aa  89.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  41.42 
 
 		 962 aa  89.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  31.75 
 
 		 600 aa  89.7  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  40.24 
 
 		 1186 aa  89.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>