175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4026 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  97.03 
 
 		 1616 aa  1368    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  100 
 
 		 753 aa  1454    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  53.77 
 
 		 1447 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  70.86 
 
 		 1549 aa  906    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  53.96 
 
 		 1447 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  99.46 
 
 		 1588 aa  1408    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  54.35 
 
 		 1472 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  97.03 
 
 		 1616 aa  1368    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  72.43 
 
 		 1674 aa  981    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  99.46 
 
 		 1616 aa  1407    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  54.09 
 
 		 1446 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  52.77 
 
 		 1342 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  39.85 
 
 		 2141 aa  205  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  38.42 
 
 		 1117 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  31.65 
 
 		 990 aa  195  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  43.75 
 
 		 1471 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  43.75 
 
 		 1471 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  41.12 
 
 		 1854 aa  185  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  43.42 
 
 		 1546 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  35.94 
 
 		 2396 aa  182  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  40.62 
 
 		 1353 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  44.44 
 
 		 1434 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  28.62 
 
 		 3718 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  29.61 
 
 		 2868 aa  154  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  50.72 
 
 		 1487 aa  151  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  31.1 
 
 		 1326 aa  151  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  28.31 
 
 		 1309 aa  146  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  32.38 
 
 		 2157 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  35.85 
 
 		 880 aa  138  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  31.76 
 
 		 963 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  36.29 
 
 		 878 aa  136  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  35.58 
 
 		 876 aa  135  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  29.73 
 
 		 1451 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  30.97 
 
 		 1246 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  29.84 
 
 		 4384 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  28.63 
 
 		 1197 aa  128  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  28.63 
 
 		 1197 aa  128  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  28.63 
 
 		 1197 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  28.29 
 
 		 1204 aa  125  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  44.15 
 
 		 716 aa  124  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  32.47 
 
 		 1613 aa  124  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  44.15 
 
 		 716 aa  124  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  30.9 
 
 		 2832 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  27.69 
 
 		 1125 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  29.41 
 
 		 4191 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0314  Brp family immunodominant surface antigen  28.68 
 
 		 1235 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  29.68 
 
 		 1072 aa  114  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  29.95 
 
 		 1122 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  29.78 
 
 		 1090 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  29.78 
 
 		 1090 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  29.78 
 
 		 1090 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  29.78 
 
 		 1122 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  29.78 
 
 		 1074 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  29.78 
 
 		 1122 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  31.33 
 
 		 4726 aa  106  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  32.17 
 
 		 766 aa  106  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  30.4 
 
 		 740 aa  103  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  29.51 
 
 		 3192 aa  102  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  32.17 
 
 		 1713 aa  98.6  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  31.54 
 
 		 3126 aa  97.8  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  28.31 
 
 		 735 aa  96.3  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  33.64 
 
 		 1440 aa  93.6  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  29.34 
 
 		 1417 aa  93.2  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  32.29 
 
 		 816 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  32.29 
 
 		 820 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  32.29 
 
 		 816 aa  92.8  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  32.29 
 
 		 816 aa  92.8  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  32.29 
 
 		 816 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  35.38 
 
 		 1190 aa  93.2  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  32.29 
 
 		 831 aa  92.4  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  32.29 
 
 		 831 aa  92.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  33.21 
 
 		 810 aa  90.9  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  25.47 
 
 		 1259 aa  90.9  9e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  32.93 
 
 		 1390 aa  90.5  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  32.79 
 
 		 3635 aa  90.1  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  31.89 
 
 		 877 aa  89.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  32.29 
 
 		 831 aa  89  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  33.12 
 
 		 2504 aa  86.7  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  31.99 
 
 		 3355 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0459  haemagluttinin family protein  38.97 
 
 		 2757 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.312259  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  33.56 
 
 		 589 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1946  putative cell surface protein  38.97 
 
 		 1916 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  29.07 
 
 		 597 aa  77  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  29.07 
 
 		 597 aa  77  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0957  outer membrane protein, putative  37.5 
 
 		 2025 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  33.93 
 
 		 575 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  29.29 
 
 		 597 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  45.61 
 
 		 472 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  29.01 
 
 		 2851 aa  73.6  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  34.74 
 
 		 2392 aa  72.8  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  32.62 
 
 		 536 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  34.58 
 
 		 2095 aa  72.4  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  31.72 
 
 		 1265 aa  72  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  41.48 
 
 		 977 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  35.82 
 
 		 2728 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  37.4 
 
 		 2906 aa  69.3  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  35.82 
 
 		 2778 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  35.82 
 
 		 2814 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  30.98 
 
 		 492 aa  68.2  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  38.06 
 
 		 2866 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>