195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6868 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  100 
 
 
2832 aa  5330    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  33.67 
 
 
2868 aa  779    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  60.77 
 
 
3192 aa  1568    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  47.7 
 
 
3126 aa  1219    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  32.06 
 
 
4191 aa  491  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  44.96 
 
 
735 aa  322  6e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  32.73 
 
 
3355 aa  305  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  33.24 
 
 
1246 aa  256  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  36.16 
 
 
963 aa  236  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  32.53 
 
 
1197 aa  223  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  32.56 
 
 
1197 aa  223  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  32.53 
 
 
1197 aa  223  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  33.25 
 
 
1072 aa  219  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  38.31 
 
 
3635 aa  218  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  31.47 
 
 
1204 aa  216  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  41.15 
 
 
4726 aa  210  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  33.03 
 
 
1713 aa  207  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  30.33 
 
 
1342 aa  192  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  37.84 
 
 
597 aa  191  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  38.39 
 
 
597 aa  191  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  38.39 
 
 
597 aa  191  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  40.69 
 
 
1309 aa  190  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  30.74 
 
 
1326 aa  189  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  31.11 
 
 
1447 aa  183  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  30.84 
 
 
1447 aa  179  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  31.25 
 
 
990 aa  178  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  33.78 
 
 
1417 aa  174  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  34.45 
 
 
4384 aa  173  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  30.28 
 
 
1613 aa  172  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  30.28 
 
 
1446 aa  171  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  30.44 
 
 
1472 aa  169  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  32.01 
 
 
1674 aa  169  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  32.71 
 
 
3718 aa  166  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  34.24 
 
 
967 aa  166  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  30.6 
 
 
1616 aa  161  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  30.6 
 
 
1616 aa  161  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  30.38 
 
 
1616 aa  159  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  31.63 
 
 
1122 aa  159  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  31.15 
 
 
1549 aa  159  8e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  31.63 
 
 
1074 aa  159  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  37.72 
 
 
877 aa  158  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  30.27 
 
 
1588 aa  157  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  31.53 
 
 
1122 aa  158  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  31.53 
 
 
1122 aa  156  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  31.53 
 
 
1090 aa  156  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  31.53 
 
 
1090 aa  156  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  31.53 
 
 
1090 aa  156  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  32.59 
 
 
880 aa  155  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  32.3 
 
 
876 aa  152  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  27.64 
 
 
1451 aa  151  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  39.73 
 
 
2157 aa  147  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  32.21 
 
 
1265 aa  140  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  31.74 
 
 
716 aa  139  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  34.66 
 
 
878 aa  139  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  35 
 
 
810 aa  137  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  33.1 
 
 
2396 aa  135  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  32.45 
 
 
1117 aa  133  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  38.36 
 
 
472 aa  133  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  37.87 
 
 
716 aa  131  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  39.59 
 
 
1440 aa  129  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  39.59 
 
 
1190 aa  129  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  33.08 
 
 
816 aa  122  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  33.08 
 
 
831 aa  122  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  33.08 
 
 
831 aa  122  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  33.08 
 
 
816 aa  122  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  33.08 
 
 
820 aa  122  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  33.08 
 
 
816 aa  122  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  33.08 
 
 
816 aa  122  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  31.05 
 
 
740 aa  119  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  46.7 
 
 
1012 aa  119  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  46.49 
 
 
1068 aa  119  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  46.7 
 
 
962 aa  119  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  46.7 
 
 
1186 aa  118  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  40.28 
 
 
533 aa  118  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  38.61 
 
 
655 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  31.93 
 
 
831 aa  117  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  40 
 
 
373 aa  115  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  32.64 
 
 
766 aa  115  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  40 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  40 
 
 
373 aa  115  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  42.54 
 
 
589 aa  115  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  29.44 
 
 
753 aa  115  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  26.76 
 
 
1814 aa  114  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  38.82 
 
 
1390 aa  114  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  46.71 
 
 
617 aa  112  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  35.31 
 
 
575 aa  110  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  32.67 
 
 
1125 aa  110  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  35.62 
 
 
536 aa  110  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  37.97 
 
 
2504 aa  110  6e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  41.46 
 
 
1654 aa  109  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  39.29 
 
 
378 aa  108  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0878  hemagglutinin domain-containing protein  40.34 
 
 
525 aa  108  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  38.91 
 
 
330 aa  107  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  41.15 
 
 
192 aa  107  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  41.15 
 
 
192 aa  107  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  39.29 
 
 
460 aa  106  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  40.85 
 
 
1535 aa  105  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  41.99 
 
 
827 aa  105  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  40.85 
 
 
715 aa  105  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  40.85 
 
 
1766 aa  105  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>