207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5930 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  84.03 
 
 		 1854 aa  1102    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  91.48 
 
 		 1546 aa  1023    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  100 
 
 		 1434 aa  2654    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  77.59 
 
 		 1487 aa  664    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  80.26 
 
 		 1353 aa  1625    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  59.97 
 
 		 1471 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  59.97 
 
 		 1471 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  58.38 
 
 		 1117 aa  552  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  65.18 
 
 		 2141 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  53.16 
 
 		 977 aa  302  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  40.74 
 
 		 898 aa  296  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0957  outer membrane protein, putative  64.71 
 
 		 2025 aa  287  9e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  60.66 
 
 		 330 aa  282  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0459  haemagluttinin family protein  56.76 
 
 		 2757 aa  272  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.312259  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  71.61 
 
 		 2396 aa  268  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  50.31 
 
 		 2814 aa  259  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  49.77 
 
 		 1654 aa  251  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  48.48 
 
 		 2728 aa  251  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  32.31 
 
 		 1122 aa  241  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  32.21 
 
 		 1122 aa  241  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  32.46 
 
 		 1122 aa  240  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  44.22 
 
 		 1705 aa  240  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  32.09 
 
 		 1090 aa  240  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  32.09 
 
 		 1090 aa  240  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  32.09 
 
 		 1090 aa  240  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  32.68 
 
 		 1074 aa  239  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1946  putative cell surface protein  68.48 
 
 		 1916 aa  237  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  43.21 
 
 		 1669 aa  236  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  64.33 
 
 		 2778 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2042  putative cell surface protein  68.48 
 
 		 365 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  61.78 
 
 		 2505 aa  220  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  62.5 
 
 		 2866 aa  218  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  41.5 
 
 		 1626 aa  214  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  39.26 
 
 		 1535 aa  208  8e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  43.38 
 
 		 716 aa  192  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  32.19 
 
 		 1588 aa  190  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  32.19 
 
 		 1616 aa  191  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  42.86 
 
 		 716 aa  189  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  31.61 
 
 		 1674 aa  188  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  57.82 
 
 		 715 aa  186  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  32.81 
 
 		 1616 aa  185  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  32.81 
 
 		 1616 aa  185  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  57.82 
 
 		 1766 aa  184  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  32.51 
 
 		 1472 aa  183  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  31.25 
 
 		 1549 aa  177  9e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  35.25 
 
 		 1342 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  36.89 
 
 		 827 aa  175  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  37.34 
 
 		 1068 aa  172  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  29.49 
 
 		 2868 aa  172  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  34.61 
 
 		 962 aa  170  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  35.8 
 
 		 831 aa  166  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  35.8 
 
 		 831 aa  166  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  35.8 
 
 		 820 aa  166  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  35.8 
 
 		 816 aa  166  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  35.8 
 
 		 816 aa  165  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  35.8 
 
 		 816 aa  165  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  35.8 
 
 		 816 aa  165  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  36.38 
 
 		 1186 aa  165  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  33.75 
 
 		 876 aa  164  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  36.82 
 
 		 831 aa  162  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  33.93 
 
 		 880 aa  162  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  39.61 
 
 		 1012 aa  158  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  39.27 
 
 		 1326 aa  156  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  31.39 
 
 		 4384 aa  157  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  29.21 
 
 		 1333 aa  154  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  50.24 
 
 		 753 aa  154  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  36.36 
 
 		 617 aa  152  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  38.13 
 
 		 2157 aa  149  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  36.39 
 
 		 472 aa  147  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  30.84 
 
 		 1411 aa  145  5e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  33.57 
 
 		 878 aa  145  8e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  34.94 
 
 		 1309 aa  142  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  38.92 
 
 		 2493 aa  142  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  30.01 
 
 		 1814 aa  138  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  32.01 
 
 		 1230 aa  138  6.0000000000000005e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  34.2 
 
 		 575 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0463  putative membrane-anchored cell surface protein  50 
 
 		 1616 aa  136  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.590511  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1951  membrane-anchored cell surface protein  50 
 
 		 1608 aa  135  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  35.6 
 
 		 1190 aa  132  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  34.73 
 
 		 1440 aa  132  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0810  YadA-like C-terminal region protein  50 
 
 		 459 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  34.75 
 
 		 492 aa  130  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  45 
 
 		 533 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  32.78 
 
 		 3635 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1599  YadA-like C-terminal region protein  50 
 
 		 459 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  34.83 
 
 		 691 aa  130  2.0000000000000002e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0646  YadA-like C-terminal region protein  50 
 
 		 459 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0378174  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2048  putative outer membrane protein  50 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  33.5 
 
 		 737 aa  129  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  44.5 
 
 		 373 aa  128  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  44.5 
 
 		 373 aa  128  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  44.5 
 
 		 378 aa  128  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  44.44 
 
 		 192 aa  127  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  44.44 
 
 		 192 aa  127  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  30.46 
 
 		 1613 aa  126  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  37.44 
 
 		 1417 aa  126  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0533  YadA-like C-terminal region protein  50 
 
 		 229 aa  125  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  32.2 
 
 		 4726 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  31.19 
 
 		 735 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  29.63 
 
 		 1265 aa  122  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>