55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2286 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2286  YadA domain-containing protein  100 
 
 		 1584 aa  2844    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0535407  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1308  Haemagluttinin domain protein  41.86 
 
 		 308 aa  93.2  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4209  superfamily II helicase  34.62 
 
 		 554 aa  73.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.324894 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4120  hypothetical protein  34.62 
 
 		 457 aa  73.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  43.4 
 
 		 617 aa  72  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  34.42 
 
 		 548 aa  65.9  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0146  hypothetical protein  43.4 
 
 		 135 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0122  haemagluttinin family protein  43.4 
 
 		 135 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  35.46 
 
 		 977 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  35.14 
 
 		 1654 aa  57.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  35.14 
 
 		 1626 aa  58.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  31.91 
 
 		 827 aa  58.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  35.14 
 
 		 1766 aa  57.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  35.14 
 
 		 1705 aa  57.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  35.14 
 
 		 1535 aa  57  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  35.14 
 
 		 1669 aa  57  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  31.3 
 
 		 4191 aa  56.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  35.14 
 
 		 715 aa  56.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  30.33 
 
 		 1186 aa  56.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  30.33 
 
 		 1068 aa  55.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  33.91 
 
 		 737 aa  53.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0459  haemagluttinin family protein  24.44 
 
 		 2757 aa  51.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.312259  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  28.12 
 
 		 2505 aa  50.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0957  outer membrane protein, putative  28.15 
 
 		 2025 aa  50.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  31.3 
 
 		 3718 aa  49.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  29.03 
 
 		 1447 aa  49.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  29.03 
 
 		 1447 aa  49.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  37.19 
 
 		 1090 aa  49.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  37.19 
 
 		 1090 aa  49.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  27.51 
 
 		 1472 aa  49.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  37.19 
 
 		 1090 aa  49.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  37.19 
 
 		 1074 aa  49.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  29.03 
 
 		 1446 aa  49.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0019  repeated sequence found in lipoprotein LPP  41.38 
 
 		 540 aa  48.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  31.62 
 
 		 4726 aa  48.9  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  30.51 
 
 		 1342 aa  48.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  31.37 
 
 		 2743 aa  48.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  37.19 
 
 		 1122 aa  48.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  31.03 
 
 		 3355 aa  48.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  37.19 
 
 		 1122 aa  48.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  37.19 
 
 		 1122 aa  48.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  30.61 
 
 		 2078 aa  47.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  35.71 
 
 		 1246 aa  47.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  27.34 
 
 		 2728 aa  47.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  27.34 
 
 		 2778 aa  47.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  33.33 
 
 		 4384 aa  47.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1168  hypothetical protein  27.82 
 
 		 535 aa  47.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000338543  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  27.34 
 
 		 2814 aa  47.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  28.12 
 
 		 1434 aa  47  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  32.93 
 
 		 2091 aa  47  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5675  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1065 aa  47  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  27.34 
 
 		 2866 aa  46.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  30.83 
 
 		 1326 aa  46.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  28.23 
 
 		 1854 aa  45.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  31.62 
 
 		 3635 aa  45.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>