More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1408 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  76.16 
 
 
2092 aa  3008    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  61.02 
 
 
1014 aa  932    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  78.86 
 
 
2078 aa  3147    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  77.76 
 
 
2091 aa  3086    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  66.84 
 
 
1813 aa  1389    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  100 
 
 
2078 aa  4066    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  79.42 
 
 
2073 aa  3148    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  78.98 
 
 
2075 aa  3100    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1154  large adhesin  36.14 
 
 
3554 aa  420  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  32.33 
 
 
2906 aa  339  2.9999999999999997e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  69.08 
 
 
1411 aa  323  1.9999999999999998e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  61.07 
 
 
601 aa  283  4e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0176  Hemagluttinin domain protein  69.76 
 
 
209 aa  281  1e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  32.89 
 
 
3920 aa  207  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0383  large adhesin  34.41 
 
 
4238 aa  204  9.999999999999999e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1085  large adhesin  30.68 
 
 
3737 aa  204  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  30.37 
 
 
5143 aa  197  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  31.37 
 
 
4526 aa  174  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  32.63 
 
 
2914 aa  166  4.0000000000000004e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  28.36 
 
 
2851 aa  161  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  41.15 
 
 
998 aa  149  7.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1616  large adhesin  29.1 
 
 
3078 aa  137  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  46.81 
 
 
1230 aa  128  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1341  YadA domain protein  46.43 
 
 
563 aa  119  6.9999999999999995e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  50.42 
 
 
691 aa  117  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  50.42 
 
 
600 aa  117  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  39.72 
 
 
595 aa  111  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1334  YadA domain protein  43.57 
 
 
565 aa  110  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  43.38 
 
 
1065 aa  108  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  34.73 
 
 
1333 aa  103  4e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  53.49 
 
 
1212 aa  102  9e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  45.37 
 
 
572 aa  97.4  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  27.04 
 
 
827 aa  95.9  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0248  OmpA/MotB domain protein  31.01 
 
 
367 aa  93.2  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  25.13 
 
 
2095 aa  92.4  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0873  OmpA/MotB domain protein  32.43 
 
 
314 aa  91.7  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  30 
 
 
2392 aa  91.3  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  31.18 
 
 
1259 aa  87.8  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  33.47 
 
 
4191 aa  87.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  29.67 
 
 
4726 aa  86.3  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  28.49 
 
 
1012 aa  85.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  27.31 
 
 
963 aa  84  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  27.89 
 
 
1068 aa  82  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  27.63 
 
 
617 aa  82  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  47.31 
 
 
1405 aa  80.5  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  28.87 
 
 
4384 aa  79.7  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  31 
 
 
1613 aa  79  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  29.4 
 
 
1440 aa  77.4  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  29.16 
 
 
1190 aa  77  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  41.9 
 
 
1516 aa  77.4  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  26.5 
 
 
1186 aa  75.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  24.56 
 
 
3126 aa  75.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  23.79 
 
 
735 aa  74.7  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  26.29 
 
 
3635 aa  73.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  25.23 
 
 
1125 aa  72.8  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  30.83 
 
 
877 aa  72.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  48 
 
 
1390 aa  70.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  28.07 
 
 
3718 aa  70.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  39.62 
 
 
2868 aa  70.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0314  Brp family immunodominant surface antigen  35.46 
 
 
1235 aa  70.1  0.0000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  28.46 
 
 
2832 aa  69.3  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  28.03 
 
 
650 aa  68.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  27.17 
 
 
878 aa  67.4  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  29 
 
 
1451 aa  67  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  40.6 
 
 
2504 aa  67  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  25.34 
 
 
1654 aa  66.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  28.08 
 
 
1549 aa  65.9  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  32.16 
 
 
3355 aa  65.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  26.64 
 
 
1616 aa  64.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0086  YadA domain-containing protein  28.86 
 
 
599 aa  64.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  27.04 
 
 
1204 aa  64.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  26.85 
 
 
1616 aa  63.9  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  30.15 
 
 
1072 aa  63.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  26.85 
 
 
1616 aa  63.9  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  40 
 
 
597 aa  62.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  40 
 
 
597 aa  63.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  40 
 
 
597 aa  63.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  37.78 
 
 
1246 aa  61.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0589  adhesin  30 
 
 
386 aa  62.4  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0311  Brp family immunodominant surface antigen  29 
 
 
551 aa  61.6  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  23.06 
 
 
1713 aa  61.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  38.71 
 
 
716 aa  60.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  28.07 
 
 
3192 aa  60.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  46.58 
 
 
330 aa  60.5  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  26.11 
 
 
1588 aa  59.3  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  29.61 
 
 
1326 aa  59.3  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  39.45 
 
 
716 aa  58.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  43.18 
 
 
990 aa  58.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  26.02 
 
 
2814 aa  58.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1182  YadA domain protein  37.7 
 
 
224 aa  58.9  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03061  adhesin-like protein B  28.51 
 
 
989 aa  58.2  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  33.14 
 
 
270 aa  57.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  38.64 
 
 
727 aa  57.4  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  38.46 
 
 
270 aa  57.4  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  24.64 
 
 
2396 aa  57  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0602  adhesin  27.94 
 
 
404 aa  57  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  42.86 
 
 
1342 aa  57  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  42.72 
 
 
753 aa  57  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  25.35 
 
 
737 aa  56.2  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.33 
 
 
658 aa  56.2  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>