179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0383 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0383  large adhesin  100 
 
 
4238 aa  8425    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1085  large adhesin  48.38 
 
 
3737 aa  1334    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  47 
 
 
2914 aa  1068    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1154  large adhesin  62.92 
 
 
3554 aa  589  1e-166  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  63.14 
 
 
4526 aa  525  1e-147  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1616  large adhesin  51.21 
 
 
3078 aa  465  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  48.27 
 
 
5143 aa  430  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  45.78 
 
 
2851 aa  374  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  38.1 
 
 
3920 aa  369  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  43.38 
 
 
2906 aa  264  3e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  29.85 
 
 
2078 aa  226  6e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  28.59 
 
 
2073 aa  214  2e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  30.03 
 
 
2075 aa  211  2e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  28.84 
 
 
2091 aa  208  2e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  28.94 
 
 
1813 aa  208  2e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  28.77 
 
 
2092 aa  206  9.999999999999999e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  34.41 
 
 
2078 aa  204  3e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  35.15 
 
 
1014 aa  115  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0176  Hemagluttinin domain protein  36.32 
 
 
209 aa  114  4.0000000000000004e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  29.37 
 
 
2868 aa  97.1  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  28.47 
 
 
827 aa  96.7  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  28.44 
 
 
1411 aa  96.3  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  28.86 
 
 
1616 aa  94.7  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  29.29 
 
 
1588 aa  93.6  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  28.57 
 
 
1616 aa  92.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  28.57 
 
 
1616 aa  92.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  27.61 
 
 
1230 aa  92.4  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  29.79 
 
 
691 aa  91.7  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  45.87 
 
 
998 aa  90.5  7e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  28.18 
 
 
1212 aa  85.1  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  27.12 
 
 
4191 aa  85.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  24.25 
 
 
1516 aa  85.1  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  29.78 
 
 
1674 aa  84.7  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0086  YadA domain-containing protein  25.51 
 
 
599 aa  84.3  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  30.05 
 
 
617 aa  84  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  42.55 
 
 
1472 aa  83.6  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  42.55 
 
 
1447 aa  83.2  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  42.55 
 
 
1342 aa  83.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  42.55 
 
 
1447 aa  83.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  42.55 
 
 
1446 aa  82.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  41.67 
 
 
279 aa  82  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  29.33 
 
 
3718 aa  82.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  41.67 
 
 
1549 aa  81.6  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  47.32 
 
 
2814 aa  79.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  47.32 
 
 
2728 aa  79.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  34.52 
 
 
4384 aa  79.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  47.32 
 
 
2778 aa  79.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  27.66 
 
 
650 aa  80.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  29.11 
 
 
3635 aa  79  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  35.11 
 
 
4726 aa  79  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  31.58 
 
 
2095 aa  78.6  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  30.15 
 
 
600 aa  78.6  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  38.89 
 
 
2396 aa  77.4  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  28.96 
 
 
962 aa  77  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  28.3 
 
 
1068 aa  76.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  27.57 
 
 
1613 aa  76.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  28.74 
 
 
2832 aa  75.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  43.62 
 
 
716 aa  75.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  34.92 
 
 
1405 aa  75.1  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  47.41 
 
 
2866 aa  74.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  31.86 
 
 
1197 aa  74.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  43.62 
 
 
716 aa  73.9  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  29.6 
 
 
1333 aa  73.9  0.00000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  40.62 
 
 
1713 aa  73.6  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  32.32 
 
 
1197 aa  73.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  32.32 
 
 
1197 aa  73.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  29.97 
 
 
877 aa  72.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  29.62 
 
 
1440 aa  72  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0459  haemagluttinin family protein  48.04 
 
 
2757 aa  72.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.312259  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  36.04 
 
 
1916 aa  72.4  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  28.88 
 
 
1012 aa  71.6  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  30.93 
 
 
1451 aa  71.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  32.77 
 
 
536 aa  72  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  32.14 
 
 
1259 aa  71.6  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1946  putative cell surface protein  48.51 
 
 
1916 aa  71.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  30.93 
 
 
810 aa  71.2  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  29.11 
 
 
735 aa  71.2  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  38.38 
 
 
572 aa  71.2  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  26.43 
 
 
1186 aa  70.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  50 
 
 
2505 aa  70.1  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  27.97 
 
 
737 aa  69.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  32.08 
 
 
575 aa  70.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  29.04 
 
 
601 aa  69.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  31.09 
 
 
1204 aa  68.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  31.09 
 
 
1125 aa  69.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0311  Brp family immunodominant surface antigen  27.68 
 
 
551 aa  68.6  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  29.08 
 
 
1190 aa  68.6  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  43.1 
 
 
1117 aa  67.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  31.39 
 
 
548 aa  67  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  35.09 
 
 
597 aa  66.6  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  35.09 
 
 
597 aa  66.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  35.09 
 
 
597 aa  66.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  40.28 
 
 
1434 aa  66.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  42.15 
 
 
589 aa  65.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0957  outer membrane protein, putative  47.52 
 
 
2025 aa  64.7  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  26.25 
 
 
3192 aa  65.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  25.13 
 
 
1265 aa  65.1  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  47.87 
 
 
876 aa  64.3  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  32.99 
 
 
898 aa  64.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  47.87 
 
 
878 aa  64.3  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.20838 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>