More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0301 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  63.01 
 
 
1014 aa  904    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  76.39 
 
 
2091 aa  3013    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  57.95 
 
 
1813 aa  1950    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  79.06 
 
 
2078 aa  3108    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  79.2 
 
 
2092 aa  3157    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  75.73 
 
 
2078 aa  3011    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  77.36 
 
 
2073 aa  3029    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  100 
 
 
2075 aa  4063    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1154  large adhesin  36.75 
 
 
3554 aa  439  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  70.88 
 
 
1411 aa  329  4.0000000000000003e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0176  Hemagluttinin domain protein  70.87 
 
 
209 aa  282  6e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  59.7 
 
 
601 aa  278  7e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1085  large adhesin  31.41 
 
 
3737 aa  251  9e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0383  large adhesin  30.03 
 
 
4238 aa  211  1e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  31.67 
 
 
2906 aa  202  5e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  27.88 
 
 
2851 aa  198  9e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  30.8 
 
 
3920 aa  194  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  29.57 
 
 
5143 aa  177  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  28.93 
 
 
4526 aa  153  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  43.24 
 
 
998 aa  146  4e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  30.54 
 
 
2914 aa  144  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1616  large adhesin  30.47 
 
 
3078 aa  126  5e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  48.57 
 
 
1230 aa  124  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  53.39 
 
 
600 aa  116  4.0000000000000004e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  53.39 
 
 
691 aa  116  4.0000000000000004e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  46.32 
 
 
1333 aa  114  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1341  YadA domain protein  44.83 
 
 
563 aa  110  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  44.78 
 
 
1065 aa  105  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  52.17 
 
 
1212 aa  103  5e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  39.44 
 
 
595 aa  102  7e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  41.91 
 
 
572 aa  98.6  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1334  YadA domain protein  41.38 
 
 
565 aa  97.8  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0248  OmpA/MotB domain protein  32.87 
 
 
367 aa  96.3  5e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0873  OmpA/MotB domain protein  31.66 
 
 
314 aa  91.3  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  28.8 
 
 
2095 aa  90.9  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  29.39 
 
 
2392 aa  87.8  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  24.78 
 
 
1516 aa  86.7  0.000000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  25.78 
 
 
2868 aa  84.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  28.46 
 
 
1190 aa  81.3  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  28.79 
 
 
1440 aa  80.5  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  27.95 
 
 
1068 aa  80.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  31.3 
 
 
1613 aa  80.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  28.84 
 
 
1259 aa  80.1  0.0000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  44.25 
 
 
1405 aa  80.1  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  26.14 
 
 
737 aa  79.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  27.68 
 
 
2504 aa  79  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  26.47 
 
 
827 aa  77.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  28.1 
 
 
3126 aa  78.2  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  25.16 
 
 
810 aa  77.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  27.3 
 
 
1390 aa  75.9  0.000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  28.06 
 
 
4384 aa  75.9  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  29.08 
 
 
1012 aa  75.1  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  25.28 
 
 
650 aa  74.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  26.71 
 
 
617 aa  71.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  25.32 
 
 
735 aa  72  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  28.57 
 
 
4726 aa  71.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0314  Brp family immunodominant surface antigen  37.12 
 
 
1235 aa  70.5  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  32.43 
 
 
3635 aa  69.7  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  25.1 
 
 
1654 aa  68.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  26.01 
 
 
962 aa  68.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  31.84 
 
 
3718 aa  67.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  27.96 
 
 
2832 aa  68.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  23.85 
 
 
3355 aa  67.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  23.58 
 
 
548 aa  66.6  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  29.25 
 
 
1549 aa  66.6  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  27.99 
 
 
1186 aa  66.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  28.4 
 
 
1197 aa  65.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  29.79 
 
 
1451 aa  64.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  28.4 
 
 
1197 aa  64.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  25.56 
 
 
2396 aa  64.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  28.4 
 
 
1197 aa  64.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0311  Brp family immunodominant surface antigen  34.62 
 
 
551 aa  64.7  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0589  adhesin  32.18 
 
 
386 aa  63.9  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  40 
 
 
597 aa  62.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  40 
 
 
597 aa  62.4  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  40 
 
 
597 aa  62.4  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0175  hypothetical protein  62.75 
 
 
52 aa  62  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  31.39 
 
 
1326 aa  60.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  34.82 
 
 
1246 aa  60.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  42.99 
 
 
753 aa  60.5  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  46.58 
 
 
330 aa  60.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  25.97 
 
 
1713 aa  59.7  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  44.04 
 
 
2141 aa  59.7  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  27.48 
 
 
1674 aa  58.9  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  44.32 
 
 
990 aa  58.2  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  28.89 
 
 
963 aa  58.2  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1888  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  33.82 
 
 
919 aa  57  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.640223  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0237  OmpA/MotB domain protein  32.03 
 
 
491 aa  57  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03061  adhesin-like protein B  29.69 
 
 
989 aa  57  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  23.58 
 
 
3192 aa  57  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  41.53 
 
 
1117 aa  57  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  32.69 
 
 
707 aa  56.6  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  24.31 
 
 
472 aa  56.6  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
221 aa  56.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  32.28 
 
 
270 aa  56.2  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  33.33 
 
 
221 aa  56.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  28.75 
 
 
4191 aa  56.2  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
221 aa  56.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0602  adhesin  26.64 
 
 
404 aa  56.2  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  33.33 
 
 
1072 aa  55.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>