149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0179 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  100 
 
 
998 aa  1969    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  78.44 
 
 
1333 aa  490  1e-137  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  66.86 
 
 
1014 aa  241  5.999999999999999e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  80.3 
 
 
1230 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  64.09 
 
 
1813 aa  222  3.9999999999999997e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  77.54 
 
 
600 aa  216  1.9999999999999998e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  76.09 
 
 
691 aa  215  3.9999999999999995e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1341  YadA domain protein  67.88 
 
 
563 aa  192  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  66.18 
 
 
595 aa  181  4e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  65.22 
 
 
1065 aa  178  6e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1334  YadA domain protein  62.77 
 
 
565 aa  175  3.9999999999999995e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  34.15 
 
 
1212 aa  170  2e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  41.7 
 
 
2091 aa  149  3e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  41.15 
 
 
2078 aa  149  4.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  41.15 
 
 
2078 aa  148  4.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  42.34 
 
 
2092 aa  147  7.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  42.86 
 
 
2073 aa  147  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  43.24 
 
 
2075 aa  146  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  60.71 
 
 
572 aa  134  6.999999999999999e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  45.62 
 
 
1411 aa  120  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  46.38 
 
 
601 aa  116  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  36.65 
 
 
1259 aa  105  5e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  47.71 
 
 
5143 aa  101  9e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  37.5 
 
 
1440 aa  100  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  33.63 
 
 
2851 aa  99.4  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0311  Brp family immunodominant surface antigen  33.75 
 
 
551 aa  99.4  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  37.5 
 
 
1190 aa  99  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  50.53 
 
 
2914 aa  93.2  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  33.8 
 
 
1405 aa  93.6  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0383  large adhesin  45.87 
 
 
4238 aa  90.5  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  35.62 
 
 
4526 aa  86.3  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  32.42 
 
 
2095 aa  84.7  0.000000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1154  large adhesin  48.35 
 
 
3554 aa  84.3  0.000000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0086  YadA domain-containing protein  32.32 
 
 
599 aa  82  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1085  large adhesin  30.49 
 
 
3737 aa  79.3  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  33.72 
 
 
1451 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  26.49 
 
 
597 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  33.86 
 
 
1390 aa  76.3  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  34.93 
 
 
1516 aa  75.1  0.000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  34.52 
 
 
1549 aa  75.1  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  30.82 
 
 
2504 aa  74.7  0.000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  27.65 
 
 
597 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  27.65 
 
 
597 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  32.44 
 
 
1197 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  32.44 
 
 
1197 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  32.44 
 
 
1197 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  32.35 
 
 
3920 aa  71.6  0.00000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  34.98 
 
 
1117 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  28.12 
 
 
810 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  34.9 
 
 
4726 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0314  Brp family immunodominant surface antigen  38.53 
 
 
1235 aa  69.3  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  30.33 
 
 
3718 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  36.08 
 
 
2868 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  36.57 
 
 
877 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  32 
 
 
2396 aa  66.6  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  34.74 
 
 
1125 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  34.74 
 
 
1204 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  31.35 
 
 
1613 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  36.31 
 
 
4384 aa  65.1  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  32.35 
 
 
2832 aa  64.7  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03061  adhesin-like protein B  29.66 
 
 
989 aa  64.7  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  33.18 
 
 
1471 aa  64.7  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  33.18 
 
 
1471 aa  64.7  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  29.27 
 
 
1654 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  32.69 
 
 
1674 aa  63.9  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  33.18 
 
 
1546 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  30.43 
 
 
2906 aa  62.8  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  29.77 
 
 
2141 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  33.49 
 
 
1616 aa  62.4  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  33.49 
 
 
1616 aa  62  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  35.47 
 
 
1588 aa  62.4  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  33.49 
 
 
1616 aa  62  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  40.74 
 
 
3192 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  33.67 
 
 
1854 aa  61.6  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  29.1 
 
 
1472 aa  61.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  30.68 
 
 
4191 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  31.98 
 
 
3635 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  42.27 
 
 
3355 aa  61.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  32.38 
 
 
2392 aa  60.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  41.57 
 
 
3126 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  34.32 
 
 
735 aa  59.3  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  33.49 
 
 
1068 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  33.33 
 
 
1353 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  33.49 
 
 
1012 aa  58.2  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  42.31 
 
 
1447 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  34.22 
 
 
1186 aa  57.4  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  42.31 
 
 
1447 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  32.08 
 
 
2505 aa  57.4  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  29.9 
 
 
753 aa  57.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3661  hemagluttinin-like protein  32.07 
 
 
418 aa  56.6  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0725058  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  42.31 
 
 
1446 aa  57  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  33.17 
 
 
1434 aa  57  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  42.31 
 
 
1342 aa  57  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  33.33 
 
 
962 aa  56.2  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  34.32 
 
 
831 aa  55.5  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  34.32 
 
 
816 aa  55.1  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  34.32 
 
 
820 aa  55.5  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  34.32 
 
 
816 aa  55.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  34.32 
 
 
816 aa  55.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  34.32 
 
 
816 aa  55.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>