More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0174 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  100 
 
 		 2091 aa  4094    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  76.61 
 
 		 2075 aa  3016    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  77.79 
 
 		 2078 aa  3086    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  55.83 
 
 		 1813 aa  863    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  77.53 
 
 		 2078 aa  3099    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  77.72 
 
 		 2073 aa  3065    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  62.34 
 
 		 1014 aa  934    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  84.51 
 
 		 2092 aa  3397    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1154  large adhesin  35 
 
 		 3554 aa  401  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  69.08 
 
 		 1411 aa  323  3e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  30.73 
 
 		 2906 aa  290  2.9999999999999996e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0176  Hemagluttinin domain protein  73.13 
 
 		 209 aa  285  1e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  61.07 
 
 		 601 aa  282  5e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  32.02 
 
 		 2914 aa  243  4e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  38.19 
 
 		 3920 aa  211  9e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0383  large adhesin  28.84 
 
 		 4238 aa  208  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  28.49 
 
 		 5143 aa  160  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  41.7 
 
 		 998 aa  149  5e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  34.26 
 
 		 2851 aa  142  7.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  46.81 
 
 		 1230 aa  127  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  51.26 
 
 		 600 aa  120  3.9999999999999997e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  50.42 
 
 		 691 aa  118  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1616  large adhesin  28.91 
 
 		 3078 aa  118  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1341  YadA domain protein  46.43 
 
 		 563 aa  117  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  45.19 
 
 		 1333 aa  116  4.0000000000000004e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  39.72 
 
 		 595 aa  110  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  43.7 
 
 		 1065 aa  108  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1334  YadA domain protein  43.57 
 
 		 565 aa  108  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  35.34 
 
 		 4526 aa  107  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  53.49 
 
 		 1212 aa  102  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  30.53 
 
 		 4384 aa  101  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  45.37 
 
 		 572 aa  97.4  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  26.15 
 
 		 827 aa  96.7  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1085  large adhesin  38.46 
 
 		 3737 aa  95.9  8e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  24.77 
 
 		 2868 aa  94.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0873  OmpA/MotB domain protein  32.82 
 
 		 314 aa  92.4  8e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0248  OmpA/MotB domain protein  30.61 
 
 		 367 aa  92  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  27.67 
 
 		 1068 aa  89.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  25.91 
 
 		 617 aa  86.7  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  25.75 
 
 		 1516 aa  85.5  0.000000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  33.87 
 
 		 2095 aa  84.7  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  28.16 
 
 		 962 aa  83.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  26.29 
 
 		 4726 aa  83.2  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  32.88 
 
 		 1405 aa  80.9  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  26.76 
 
 		 737 aa  80.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  30.95 
 
 		 2141 aa  80.1  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  32.41 
 
 		 1451 aa  79  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  32.1 
 
 		 4191 aa  78.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  33.46 
 
 		 1549 aa  76.6  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  32.59 
 
 		 877 aa  77  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  29.01 
 
 		 1012 aa  76.6  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  30.33 
 
 		 1613 aa  74.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  27.23 
 
 		 3126 aa  72.8  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  33.7 
 
 		 1674 aa  72.8  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  28.42 
 
 		 3718 aa  71.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  28.49 
 
 		 1259 aa  71.6  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  28.08 
 
 		 2504 aa  70.5  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  28.23 
 
 		 1390 aa  70.5  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  27.24 
 
 		 2832 aa  70.1  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  46.74 
 
 		 1440 aa  69.7  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  46.74 
 
 		 1190 aa  69.3  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  31.78 
 
 		 1186 aa  69.3  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  25.05 
 
 		 1446 aa  68.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0602  adhesin  33.47 
 
 		 404 aa  68.6  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  31.8 
 
 		 1072 aa  68.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  23.4 
 
 		 735 aa  68.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  24.51 
 
 		 3635 aa  68.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0589  adhesin  31.09 
 
 		 386 aa  67.8  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  28.06 
 
 		 650 aa  67.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  23.59 
 
 		 1117 aa  68.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  31.53 
 
 		 575 aa  68.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  25.25 
 
 		 1472 aa  66.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  23.65 
 
 		 810 aa  65.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0175  hypothetical protein  61.11 
 
 		 52 aa  63.9  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0314  Brp family immunodominant surface antigen  42.86 
 
 		 1235 aa  63.9  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  37 
 
 		 1246 aa  63.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  32.27 
 
 		 3355 aa  63.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  40 
 
 		 597 aa  62.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  40 
 
 		 597 aa  62.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  40 
 
 		 597 aa  62.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  25.94 
 
 		 1447 aa  62.4  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  25.94 
 
 		 1447 aa  62.4  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  25.94 
 
 		 1342 aa  62  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  28.32 
 
 		 1616 aa  62  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  25.99 
 
 		 3192 aa  62.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1616 aa  62  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  28.57 
 
 		 963 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0311  Brp family immunodominant surface antigen  33.33 
 
 		 551 aa  61.2  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  33.85 
 
 		 1916 aa  60.8  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  27.6 
 
 		 753 aa  60.1  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  31.08 
 
 		 1326 aa  60.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  46.58 
 
 		 330 aa  60.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1182  YadA domain protein  37.7 
 
 		 224 aa  58.9  0.0000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  36.46 
 
 		 1713 aa  58.9  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3661  hemagluttinin-like protein  30.8 
 
 		 418 aa  58.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0725058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  24.06 
 
 		 536 aa  58.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  32.11 
 
 		 990 aa  58.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  35.88 
 
 		 270 aa  58.2  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  30.29 
 
 		 548 aa  57.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  26.92 
 
 		 1588 aa  57.4  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>