123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0177 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  71.49 
 
 
2092 aa  1139    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  100 
 
 
1014 aa  1977    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  62.34 
 
 
2091 aa  915    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  63.54 
 
 
2073 aa  929    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  63.01 
 
 
2075 aa  887    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  61.02 
 
 
2078 aa  932    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  64.84 
 
 
1813 aa  1216    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  61.59 
 
 
2078 aa  928    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  66.86 
 
 
998 aa  241  5.999999999999999e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  56.35 
 
 
600 aa  195  4e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  55.84 
 
 
691 aa  195  4e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  60.61 
 
 
1333 aa  193  1e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1341  YadA domain protein  63.92 
 
 
563 aa  192  4e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  68.57 
 
 
1065 aa  190  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  63.64 
 
 
595 aa  185  4.0000000000000006e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  42.86 
 
 
3920 aa  184  9.000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1334  YadA domain protein  58.93 
 
 
565 aa  184  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  70.09 
 
 
1212 aa  165  5.0000000000000005e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  48.77 
 
 
572 aa  143  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  49.12 
 
 
1411 aa  136  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  52.07 
 
 
601 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0383  large adhesin  29.51 
 
 
4238 aa  112  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  32.79 
 
 
2851 aa  112  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  35.22 
 
 
4526 aa  103  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  31.8 
 
 
2914 aa  101  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1154  large adhesin  47.62 
 
 
3554 aa  99  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1616  large adhesin  32.77 
 
 
3078 aa  96.3  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  46.09 
 
 
2906 aa  92.8  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  36 
 
 
5143 aa  89.4  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1085  large adhesin  30.61 
 
 
3737 aa  80.9  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  33.71 
 
 
1259 aa  79.7  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  31.97 
 
 
1190 aa  79.3  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  45.56 
 
 
1390 aa  77.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  43.33 
 
 
2504 aa  74.7  0.000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  31.62 
 
 
1440 aa  73.9  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  41.03 
 
 
1405 aa  73.9  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  36.6 
 
 
597 aa  72  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  36.6 
 
 
597 aa  72  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  44 
 
 
597 aa  71.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  32.84 
 
 
1516 aa  70.9  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  27.37 
 
 
2868 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0311  Brp family immunodominant surface antigen  33.33 
 
 
551 aa  68.6  0.0000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  30.97 
 
 
1616 aa  67.8  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  45.45 
 
 
1613 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  32.02 
 
 
740 aa  66.6  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0314  Brp family immunodominant surface antigen  33.96 
 
 
1235 aa  65.1  0.000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  35.29 
 
 
1472 aa  65.1  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  30.6 
 
 
1588 aa  65.1  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  35.29 
 
 
1447 aa  64.7  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  35.29 
 
 
1447 aa  64.7  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  35.29 
 
 
1446 aa  64.7  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  37.23 
 
 
1246 aa  64.7  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  35.29 
 
 
1342 aa  64.3  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  41.46 
 
 
4726 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  35.77 
 
 
279 aa  62.8  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  38.14 
 
 
1713 aa  63.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  35.77 
 
 
1616 aa  62.4  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  35.77 
 
 
1674 aa  62.4  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  35.77 
 
 
1616 aa  62.4  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  39.08 
 
 
963 aa  62  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  41.49 
 
 
3635 aa  61.2  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  30.71 
 
 
1549 aa  61.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  29.94 
 
 
4384 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  40.37 
 
 
1230 aa  59.7  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  28.51 
 
 
766 aa  59.3  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  43.75 
 
 
3355 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  29.62 
 
 
990 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  28.4 
 
 
4191 aa  57.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  39.09 
 
 
1117 aa  57  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  28.23 
 
 
1125 aa  55.1  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  41.07 
 
 
753 aa  55.1  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  27.52 
 
 
2396 aa  54.7  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  38.64 
 
 
810 aa  53.9  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  27.81 
 
 
536 aa  53.9  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4209  superfamily II helicase  29.27 
 
 
554 aa  54.3  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.324894 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  34.38 
 
 
716 aa  53.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  34.38 
 
 
1451 aa  52.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4120  hypothetical protein  33.66 
 
 
457 aa  52.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  34.38 
 
 
1197 aa  52  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  34.38 
 
 
1197 aa  52  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  34.38 
 
 
1197 aa  52  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1543  outer membrane protein  31.13 
 
 
452 aa  51.2  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.316973  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1563  hypothetical protein  29.1 
 
 
305 aa  50.8  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000159898  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  34.45 
 
 
878 aa  50.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  33.59 
 
 
716 aa  50.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  36.8 
 
 
3126 aa  50.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  30.37 
 
 
3718 aa  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  26.87 
 
 
3192 aa  49.7  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  30.63 
 
 
1204 aa  49.7  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  35.71 
 
 
2866 aa  49.3  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  34.83 
 
 
877 aa  49.3  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  27.44 
 
 
2095 aa  48.9  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  35.11 
 
 
967 aa  48.5  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1512  hypothetical protein  31.13 
 
 
362 aa  48.1  0.0009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  33.08 
 
 
880 aa  47.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  33.08 
 
 
876 aa  47.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  31.33 
 
 
1814 aa  47.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1182  YadA domain protein  37.18 
 
 
224 aa  46.6  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  42.47 
 
 
330 aa  47  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  36.84 
 
 
1072 aa  47  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>