167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0209 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0209  large adhesin  100 
 
 		 5143 aa  10130    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  73.95 
 
 		 3920 aa  2412    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  83.1 
 
 		 4526 aa  1423    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1616  large adhesin  48.67 
 
 		 3078 aa  999    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1154  large adhesin  43.86 
 
 		 3554 aa  612  1e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  48.36 
 
 		 2851 aa  523  1e-146  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1085  large adhesin  54.9 
 
 		 3737 aa  456  1.0000000000000001e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0383  large adhesin  37.91 
 
 		 4238 aa  425  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  63.64 
 
 		 2906 aa  400  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  43.36 
 
 		 2914 aa  343  5.9999999999999996e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  30.37 
 
 		 2078 aa  197  4e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  31.04 
 
 		 1813 aa  186  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  29.57 
 
 		 2075 aa  177  5.999999999999999e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  29.6 
 
 		 2073 aa  164  3e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  28.41 
 
 		 2092 aa  152  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  28.47 
 
 		 2091 aa  149  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  33.03 
 
 		 1230 aa  128  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  27.56 
 
 		 1333 aa  129  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  30.19 
 
 		 2078 aa  103  9e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  47.71 
 
 		 998 aa  101  5e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  30.97 
 
 		 827 aa  100  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1185  hypothetical protein  51.67 
 
 		 239 aa  99.4  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00454576  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  32.68 
 
 		 1014 aa  97.8  5e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  47.22 
 
 		 1259 aa  95.5  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  26.36 
 
 		 1516 aa  95.1  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  30.55 
 
 		 2141 aa  91.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  30.21 
 
 		 1411 aa  89.7  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  30.72 
 
 		 1588 aa  84.7  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  28.98 
 
 		 691 aa  84.3  0.00000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  30.85 
 
 		 1674 aa  83.2  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  29.59 
 
 		 1616 aa  82.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  29.59 
 
 		 1616 aa  82.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  29.59 
 
 		 1616 aa  82.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0311  Brp family immunodominant surface antigen  38.6 
 
 		 551 aa  82  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  36.17 
 
 		 1405 aa  82  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  29.75 
 
 		 1212 aa  80.5  0.0000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  39.66 
 
 		 1390 aa  80.1  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  31.58 
 
 		 2095 aa  79.7  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  34.05 
 
 		 600 aa  79  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  28.67 
 
 		 617 aa  79  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  39.05 
 
 		 2504 aa  77.4  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  29.37 
 
 		 1186 aa  77  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  29.93 
 
 		 737 aa  76.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  41.81 
 
 		 1190 aa  76.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  26.61 
 
 		 4191 aa  73.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  31.58 
 
 		 1549 aa  73.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  40.44 
 
 		 740 aa  72.8  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  29.02 
 
 		 877 aa  72.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  31.25 
 
 		 1916 aa  72.4  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  26.42 
 
 		 2868 aa  71.2  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  33.33 
 
 		 548 aa  70.5  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0176  Hemagluttinin domain protein  37.36 
 
 		 209 aa  70.5  0.0000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0086  YadA domain-containing protein  27.25 
 
 		 599 aa  70.5  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  26.95 
 
 		 2157 aa  70.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  31.38 
 
 		 1854 aa  69.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  32.35 
 
 		 1065 aa  68.6  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  28.48 
 
 		 1068 aa  68.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  40.15 
 
 		 766 aa  68.9  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  28.97 
 
 		 650 aa  68.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  48.54 
 
 		 589 aa  68.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1341  YadA domain protein  27.76 
 
 		 563 aa  68.2  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  38.26 
 
 		 601 aa  68.2  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  27.92 
 
 		 1072 aa  68.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  39.6 
 
 		 1440 aa  67.4  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  38.24 
 
 		 575 aa  67.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  36.42 
 
 		 831 aa  65.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  36.42 
 
 		 831 aa  65.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  34 
 
 		 831 aa  66.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  33.65 
 
 		 595 aa  66.2  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  36.42 
 
 		 816 aa  65.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  33.01 
 
 		 572 aa  65.9  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  36.42 
 
 		 820 aa  65.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  36.42 
 
 		 816 aa  66.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  36.42 
 
 		 816 aa  65.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  36.42 
 
 		 816 aa  65.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0602  adhesin  29.32 
 
 		 404 aa  65.5  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  39.04 
 
 		 536 aa  65.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  41.38 
 
 		 1434 aa  65.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  25.27 
 
 		 1265 aa  64.7  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  27.14 
 
 		 3355 aa  64.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  34.69 
 
 		 1472 aa  64.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  38.69 
 
 		 2866 aa  63.9  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  39.18 
 
 		 1204 aa  63.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  38.93 
 
 		 898 aa  63.9  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  38.78 
 
 		 597 aa  63.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  38.78 
 
 		 597 aa  63.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  28.89 
 
 		 962 aa  63.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  27.2 
 
 		 3718 aa  63.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  36.04 
 
 		 597 aa  63.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  28.9 
 
 		 1012 aa  62.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  42.31 
 
 		 655 aa  62.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  30.33 
 
 		 1447 aa  62.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  30.15 
 
 		 1447 aa  62.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  29.34 
 
 		 1446 aa  62  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  29.06 
 
 		 2728 aa  62  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  30.71 
 
 		 492 aa  61.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  38.14 
 
 		 1451 aa  61.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  38.14 
 
 		 1197 aa  61.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  38.14 
 
 		 1197 aa  61.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  38.14 
 
 		 1125 aa  61.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.613322 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>