25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3187 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3187  putative immunoglobuling-binding protein  100 
 
 		 369 aa  736    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.725317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  39.53 
 
 		 4191 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2654  hypothetical protein  30.97 
 
 		 527 aa  63.2  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.481724  normal  0.288172 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2673  hemagluttinin domain-containing protein  24.38 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2585  putative haemagglutinin/invasin  24.38 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1846  hypothetical protein  34.48 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  37.59 
 
 		 3718 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0768  YadA domain-containing protein  41.24 
 
 		 997 aa  52.8  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0855  outer membrane protein XadA  41.49 
 
 		 815 aa  52.8  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.912116  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  42.86 
 
 		 1613 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1950  hypothetical protein  23.67 
 
 		 364 aa  50.4  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000156547  normal  0.0548369 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  29.09 
 
 		 2868 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  39 
 
 		 548 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4317  YadA domain-containing protein  31.34 
 
 		 427 aa  47  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.130798  normal  0.0481736 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1867  YadA domain-containing protein  31.25 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.704815 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  37.14 
 
 		 1122 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  37.14 
 
 		 1122 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  37.14 
 
 		 1122 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  26.56 
 
 		 876 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  37.14 
 
 		 1090 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  37.14 
 
 		 1090 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  37.14 
 
 		 1074 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  37.14 
 
 		 1090 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  45.9 
 
 		 3355 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  29.51 
 
 		 330 aa  43.1  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>