167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0855 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0768  YadA domain-containing protein  92.51 
 
 
997 aa  1147    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0855  outer membrane protein XadA  100 
 
 
815 aa  1560    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.912116  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  36.34 
 
 
2392 aa  293  7e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  41.3 
 
 
1265 aa  248  4e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03061  adhesin-like protein B  38.42 
 
 
989 aa  197  8.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  36.75 
 
 
877 aa  127  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  34.25 
 
 
1588 aa  122  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  33.15 
 
 
1616 aa  120  9e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  33.15 
 
 
1616 aa  120  9e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  33.15 
 
 
1616 aa  120  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  40.7 
 
 
1549 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  35.53 
 
 
1012 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  34.22 
 
 
1068 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  34.04 
 
 
962 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  35.31 
 
 
1186 aa  109  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  36.31 
 
 
548 aa  106  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  31.39 
 
 
1674 aa  103  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  33.92 
 
 
4191 aa  102  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  34.23 
 
 
737 aa  102  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  35.65 
 
 
1447 aa  99  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  33.57 
 
 
1447 aa  99  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  35.65 
 
 
1342 aa  99  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  28.82 
 
 
2832 aa  97.8  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  35.19 
 
 
1446 aa  94.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  28.71 
 
 
2868 aa  94.4  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  29.06 
 
 
1117 aa  92.8  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  31.4 
 
 
827 aa  90.5  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  31.31 
 
 
810 aa  90.5  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  32.27 
 
 
1613 aa  90.1  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  35.46 
 
 
3126 aa  88.2  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  32.4 
 
 
735 aa  87.4  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  36.59 
 
 
1814 aa  87  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  35.61 
 
 
597 aa  85.1  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  35.61 
 
 
597 aa  85.1  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  35.61 
 
 
597 aa  85.1  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  30.67 
 
 
3192 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  27.59 
 
 
1333 aa  84.3  0.000000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  31.13 
 
 
2095 aa  84  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  30.68 
 
 
617 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  34.39 
 
 
536 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  27.48 
 
 
691 aa  82.4  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  26.98 
 
 
1230 aa  80.5  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  31.32 
 
 
3718 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  28.33 
 
 
1212 aa  80.1  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  30.85 
 
 
3355 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  47.44 
 
 
2157 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  30.21 
 
 
3635 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  32.3 
 
 
575 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  27.14 
 
 
1065 aa  74.3  0.000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  29.35 
 
 
1472 aa  74.3  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  33.02 
 
 
589 aa  74.3  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  32.6 
 
 
880 aa  73.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6299  hemagluttinin domain-containing protein  36.36 
 
 
654 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.525407 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  29.61 
 
 
990 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  30.64 
 
 
2396 aa  71.2  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  39.51 
 
 
4384 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  28.57 
 
 
1471 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  28.57 
 
 
1471 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  27.42 
 
 
4526 aa  69.7  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  28.57 
 
 
1516 aa  69.7  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  28.43 
 
 
1411 aa  69.3  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  31.91 
 
 
876 aa  69.3  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  26.94 
 
 
600 aa  66.6  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  26.51 
 
 
1122 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  26.51 
 
 
1122 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  30.92 
 
 
716 aa  66.6  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  27.34 
 
 
1125 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1085  large adhesin  30.47 
 
 
3737 aa  64.7  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1616  large adhesin  29.64 
 
 
3078 aa  64.7  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  26.36 
 
 
1122 aa  65.1  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  28.86 
 
 
1654 aa  64.7  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  28.28 
 
 
4726 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  31.23 
 
 
1204 aa  64.3  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  39.29 
 
 
601 aa  63.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  34.09 
 
 
1713 aa  63.9  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  26.44 
 
 
1090 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  28.14 
 
 
1197 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  28.06 
 
 
5143 aa  63.5  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  27.74 
 
 
1353 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  28.14 
 
 
1197 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  26.44 
 
 
1090 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  26.44 
 
 
1090 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0878  hemagglutinin domain-containing protein  42.71 
 
 
525 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  29.37 
 
 
1546 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  45.21 
 
 
753 aa  62  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  29.75 
 
 
472 aa  62  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  28.4 
 
 
572 aa  62  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  27.81 
 
 
1197 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  33.33 
 
 
601 aa  61.2  0.00000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  28.61 
 
 
595 aa  60.8  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  35.15 
 
 
2505 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  40.76 
 
 
1246 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0383  large adhesin  29.87 
 
 
4238 aa  60.8  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  29.27 
 
 
2851 aa  60.8  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  32.63 
 
 
1916 aa  60.8  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  47.3 
 
 
963 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3661  hemagluttinin-like protein  30.93 
 
 
418 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0725058  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  30.4 
 
 
816 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0602  adhesin  32.35 
 
 
404 aa  59.3  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  32.98 
 
 
650 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>