154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2844 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2844  Hep_Hag repeat-containing protein  100 
 
 
506 aa  930    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341394  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  40.65 
 
 
601 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3661  hemagluttinin-like protein  35.52 
 
 
418 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0725058  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  33.82 
 
 
1012 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  34.18 
 
 
1068 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  44.3 
 
 
650 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0011  putative outer membrane protein  45.7 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0825987 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  33.09 
 
 
962 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  46.4 
 
 
2866 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  35.67 
 
 
1549 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  34.55 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  45.87 
 
 
1854 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  37.21 
 
 
2095 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  33.33 
 
 
600 aa  65.9  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  32.72 
 
 
1186 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  45.08 
 
 
2505 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  38.75 
 
 
877 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0589  adhesin  31.01 
 
 
386 aa  64.3  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  34.33 
 
 
691 aa  64.3  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  39.89 
 
 
810 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  43.61 
 
 
3192 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  41.8 
 
 
548 aa  62  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  29.84 
 
 
589 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  39.6 
 
 
1613 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  42.86 
 
 
617 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  36.23 
 
 
1814 aa  59.7  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  31.33 
 
 
1411 aa  59.7  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  29.14 
 
 
1333 aa  59.3  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  34.16 
 
 
1446 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  35.15 
 
 
1447 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  35.15 
 
 
1447 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  35.15 
 
 
1342 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  46.15 
 
 
898 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  39.47 
 
 
1546 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  39.47 
 
 
1471 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  29.85 
 
 
575 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  39.47 
 
 
1471 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  30.49 
 
 
2832 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  39.55 
 
 
3126 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  45.37 
 
 
2392 aa  57.8  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  38.39 
 
 
1516 aa  57.8  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  31.17 
 
 
373 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  31.67 
 
 
1230 aa  56.6  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  31.17 
 
 
373 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  33.09 
 
 
1616 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  33.09 
 
 
1588 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  35.56 
 
 
1535 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  29.8 
 
 
597 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  29.8 
 
 
597 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  35.56 
 
 
715 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  31.17 
 
 
378 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  35.56 
 
 
1766 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  42.62 
 
 
2396 aa  55.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  34.21 
 
 
2868 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  35.56 
 
 
1705 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  35.56 
 
 
1669 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  29.29 
 
 
597 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  35.56 
 
 
1626 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  32.82 
 
 
1212 aa  54.3  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  34.57 
 
 
1072 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  36.04 
 
 
1065 aa  53.9  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  33.06 
 
 
2075 aa  53.9  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2684  hemagluttinin family protein  40 
 
 
706 aa  53.9  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2308  Haemagluttinin domain protein  40 
 
 
744 aa  53.9  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  43.36 
 
 
737 aa  53.9  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  30.15 
 
 
1616 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  31.3 
 
 
492 aa  53.5  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  30.15 
 
 
1616 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3593  YadA domain protein  37.96 
 
 
742 aa  53.5  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.50488  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  25.91 
 
 
536 aa  53.5  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  30.15 
 
 
1674 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  32.23 
 
 
2091 aa  53.5  0.000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0768  YadA domain-containing protein  40.86 
 
 
997 aa  53.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  35.56 
 
 
3920 aa  53.1  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  43.51 
 
 
2493 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  42.37 
 
 
1487 aa  53.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  45.83 
 
 
3718 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  35.27 
 
 
1654 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  34.52 
 
 
831 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  30.18 
 
 
4526 aa  52.4  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  32.23 
 
 
2092 aa  52.8  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03061  adhesin-like protein B  41.18 
 
 
989 aa  52.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  28.63 
 
 
192 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  28.63 
 
 
192 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0086  YadA domain-containing protein  52.56 
 
 
599 aa  52  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  27.78 
 
 
1916 aa  52  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0855  outer membrane protein XadA  39.78 
 
 
815 aa  51.6  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.912116  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  33.63 
 
 
2078 aa  51.6  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  39.71 
 
 
1197 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  39.71 
 
 
1197 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  33.93 
 
 
816 aa  50.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  33.93 
 
 
820 aa  50.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  33.93 
 
 
816 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  33.93 
 
 
816 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  33.93 
 
 
816 aa  50.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  39.71 
 
 
1197 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  29.85 
 
 
1813 aa  50.8  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  42.5 
 
 
1451 aa  50.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  43.36 
 
 
827 aa  50.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  39.17 
 
 
1259 aa  50.8  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>