109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3430 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.11 
 
 
4500 aa  733    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  100 
 
 
5613 aa  10590    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0940  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  34.48 
 
 
1691 aa  441  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  35.28 
 
 
1999 aa  432  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.98 
 
 
4855 aa  346  9e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  41.33 
 
 
2716 aa  332  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.77 
 
 
3589 aa  257  4.0000000000000004e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3705  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.94 
 
 
1105 aa  256  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  36.53 
 
 
1447 aa  253  9e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  40.46 
 
 
1451 aa  253  9e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  46.77 
 
 
2334 aa  249  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1781  heme-hemopexin-binding/utilization protein  47.18 
 
 
770 aa  246  9e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  48.93 
 
 
2328 aa  243  5e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.21 
 
 
2387 aa  241  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.54 
 
 
985 aa  238  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2106  filamentous haemagglutinin, N-terminal  42.4 
 
 
2079 aa  236  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0197473  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1149  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.98 
 
 
2217 aa  235  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.47 
 
 
1004 aa  235  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.78 
 
 
607 aa  234  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  44.78 
 
 
1003 aa  232  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.24 
 
 
1137 aa  229  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.01 
 
 
1148 aa  223  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  42.03 
 
 
1417 aa  223  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  47.5 
 
 
1081 aa  222  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  40.86 
 
 
1419 aa  223  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  48.36 
 
 
1058 aa  222  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.92 
 
 
4016 aa  221  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  41.27 
 
 
991 aa  219  9e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3525  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  40.41 
 
 
1672 aa  218  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2096  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.87 
 
 
2887 aa  216  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4106  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  44.94 
 
 
800 aa  216  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0612134  normal  0.370277 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4014  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.06 
 
 
956 aa  208  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.893958  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  31.74 
 
 
1215 aa  203  7.999999999999999e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3174  hemagglutination domain-containing protein  34.34 
 
 
1910 aa  199  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  44.1 
 
 
1009 aa  196  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3312  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.92 
 
 
2054 aa  196  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  39.37 
 
 
1018 aa  196  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0748  filamentous haemagglutinin-like protein  37.58 
 
 
390 aa  193  8e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.704937  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0010  filamentous haemagglutinin-like protein  35.65 
 
 
1169 aa  188  2.0000000000000003e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0780  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.8 
 
 
3132 aa  188  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  38.64 
 
 
1994 aa  188  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  38.04 
 
 
2271 aa  184  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3524  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.97 
 
 
481 aa  172  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.838951  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  35.92 
 
 
1371 aa  171  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2172  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.21 
 
 
2834 aa  164  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.718813 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.38 
 
 
2744 aa  155  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.52 
 
 
1637 aa  148  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  32.52 
 
 
2296 aa  137  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  29.67 
 
 
1526 aa  126  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2227  hemagglutinin-related protein  36.59 
 
 
3349 aa  126  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0504  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.91 
 
 
1844 aa  124  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0056  hypothetical protein  31.03 
 
 
2679 aa  118  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.602314 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2610  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.89 
 
 
3340 aa  113  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.69 
 
 
759 aa  112  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1008  GLUG  34.57 
 
 
1013 aa  110  7e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  32.74 
 
 
2927 aa  108  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  36.81 
 
 
715 aa  108  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0355  filamentous haemagglutinin-like protein  37.15 
 
 
3472 aa  106  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.06862 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  30.29 
 
 
1741 aa  105  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.1 
 
 
3419 aa  103  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1458  filamentous haemagglutinin-like protein  28.99 
 
 
3299 aa  102  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.14 
 
 
3535 aa  101  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.79 
 
 
3298 aa  100  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.79 
 
 
3537 aa  100  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2575  filamentous hemeagglutinin-like protein  35.02 
 
 
3409 aa  97.8  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.14 
 
 
3299 aa  97.8  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2206  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  35.46 
 
 
4132 aa  94.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.498823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2234  filamentous haemagglutinin-like protein  38.37 
 
 
4009 aa  92.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2911  filamentous haemagglutinin-like protein  37.99 
 
 
4135 aa  92.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2207  filamentous haemagglutinin-like protein  35.27 
 
 
4049 aa  89.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.370432 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55400  hypothetical protein  39.41 
 
 
4177 aa  89  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3126  filamentous haemagglutinin-like protein  35.47 
 
 
4347 aa  87.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.588086 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4821  hemagglutination repeat-containing protein  37.65 
 
 
4184 aa  88.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4093  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  48.7 
 
 
946 aa  87.4  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0482  haemagglutinin-like protein  36.14 
 
 
4007 aa  86.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2214  filamentous haemagglutinin-like protein  34.09 
 
 
4030 aa  84.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.699209 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  36.41 
 
 
1275 aa  84  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2997  filamentous haemagglutinin-like protein  50 
 
 
4435 aa  84  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.157653 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.73 
 
 
2637 aa  83.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2405  filamentous haemagglutinin-like protein  30.46 
 
 
3332 aa  82.8  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.621417 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3171  filamentous haemagglutinin-like protein  34.25 
 
 
4170 aa  82  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.336923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2110  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.23 
 
 
4219 aa  81.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.328655 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.71 
 
 
1650 aa  77  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11500  conserved repeat protein  28.3 
 
 
3920 aa  76.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  28.61 
 
 
1439 aa  67.8  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1009  hypothetical protein  45.59 
 
 
122 aa  65.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.72 
 
 
1884 aa  63.9  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1068  haemagglutinin-like  36.36 
 
 
4283 aa  62  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1530  conserved hypothetical protein, hemagglutination domain protein  37.72 
 
 
1085 aa  60.1  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.307259  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1095  outer membrane autotransporter  48.57 
 
 
10429 aa  57  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  49.06 
 
 
2954 aa  54.3  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3791  filamentous haemagglutinin-like protein  29.96 
 
 
1489 aa  53.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.615569 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  42.67 
 
 
2853 aa  52  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  35.21 
 
 
1610 aa  51.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  50 
 
 
2095 aa  50.8  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  41.1 
 
 
2820 aa  50.8  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  35.21 
 
 
1610 aa  50.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0421  cadherin  33.65 
 
 
1323 aa  50.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.859378 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.33 
 
 
11716 aa  50.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  47.73 
 
 
2396 aa  50.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>