51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1530 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1530  conserved hypothetical protein, hemagglutination domain protein  100 
 
 		 1085 aa  2154    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.307259  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1743  putative periplasmic protein  57.98 
 
 		 553 aa  183  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0529  putative periplasmic protein  57.98 
 
 		 553 aa  183  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.935894  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0837  hemagglutination domain-containing protein  58.27 
 
 		 139 aa  157  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0185805  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0760  hemagglutination domain-containing protein  59.72 
 
 		 144 aa  154  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.955622  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0761  hypothetical protein  31.69 
 
 		 382 aa  80.9  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.665847  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.88 
 
 		 4855 aa  75.9  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.51 
 
 		 1081 aa  70.1  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.38 
 
 		 759 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  37.8 
 
 		 991 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.23 
 
 		 2744 aa  66.6  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.8 
 
 		 1148 aa  66.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  33.53 
 
 		 715 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0748  filamentous haemagglutinin-like protein  30.62 
 
 		 390 aa  64.3  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.704937  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2106  filamentous haemagglutinin, N-terminal  30.93 
 
 		 2079 aa  62.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0197473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1781  heme-hemopexin-binding/utilization protein  34.64 
 
 		 770 aa  62  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1050  hypothetical protein  72.34 
 
 		 58 aa  61.6  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0536519  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0010  filamentous haemagglutinin-like protein  35.97 
 
 		 1169 aa  61.6  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.83 
 
 		 4500 aa  61.2  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.72 
 
 		 5613 aa  59.3  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0940  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  30.25 
 
 		 1691 aa  58.5  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4106  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.66 
 
 		 800 aa  58.5  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0612134  normal  0.370277 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  34.56 
 
 		 1417 aa  58.2  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  37.12 
 
 		 1451 aa  57.4  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  30.4 
 
 		 1977 aa  57.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  34.91 
 
 		 1058 aa  57  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3705  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.55 
 
 		 1105 aa  55.5  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  37.07 
 
 		 1447 aa  55.5  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.67 
 
 		 2387 aa  55.1  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.36 
 
 		 985 aa  54.3  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  36.36 
 
 		 1003 aa  54.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  43.33 
 
 		 2328 aa  53.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0838  hypothetical protein  33.14 
 
 		 318 aa  53.5  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  32.56 
 
 		 1999 aa  50.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.27 
 
 		 1137 aa  50.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.52 
 
 		 1637 aa  50.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.14 
 
 		 4016 aa  49.7  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  33.95 
 
 		 2716 aa  49.7  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.02 
 
 		 808 aa  49.3  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2080  GLUG domain protein  28.16 
 
 		 3333 aa  49.3  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  29.17 
 
 		 1009 aa  48.9  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  32.2 
 
 		 1419 aa  48.9  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.48 
 
 		 607 aa  48.9  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.54 
 
 		 3589 aa  48.5  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4014  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.33 
 
 		 956 aa  48.1  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.893958  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  38.94 
 
 		 1371 aa  48.1  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  32.34 
 
 		 2334 aa  47.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  35.65 
 
 		 1018 aa  47.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2172  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.33 
 
 		 2834 aa  46.6  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718813 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1458  filamentous haemagglutinin-like protein  26.45 
 
 		 3299 aa  46.2  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3174  hemagglutination domain-containing protein  28.27 
 
 		 1910 aa  45.8  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>