119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1781 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1781  heme-hemopexin-binding/utilization protein  100 
 
 
770 aa  1506    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4106  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  56.76 
 
 
800 aa  655    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0612134  normal  0.370277 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3705  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  71.65 
 
 
1105 aa  455  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2106  filamentous haemagglutinin, N-terminal  47.48 
 
 
2079 aa  355  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0197473  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  47.35 
 
 
2328 aa  350  4e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  44.3 
 
 
2334 aa  347  5e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  48.17 
 
 
4500 aa  340  4e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  45.39 
 
 
2387 aa  331  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  47.76 
 
 
1058 aa  331  4e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  45.23 
 
 
1081 aa  329  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  45.87 
 
 
1419 aa  328  3e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.89 
 
 
1137 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.65 
 
 
985 aa  308  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.24 
 
 
1148 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  41.63 
 
 
991 aa  304  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  40.47 
 
 
1009 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  51.71 
 
 
607 aa  298  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.71 
 
 
1004 aa  296  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  43.54 
 
 
1003 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  47.01 
 
 
1417 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  50.31 
 
 
2716 aa  282  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  47.14 
 
 
1447 aa  269  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  37.84 
 
 
1018 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  45.89 
 
 
1451 aa  260  6e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.69 
 
 
4016 aa  260  8e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0748  filamentous haemagglutinin-like protein  44.14 
 
 
390 aa  254  3e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.704937  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  47.18 
 
 
5613 aa  251  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0010  filamentous haemagglutinin-like protein  40.4 
 
 
1169 aa  236  9e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  46.79 
 
 
1371 aa  218  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.61 
 
 
3589 aa  216  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  46.51 
 
 
1999 aa  212  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3174  hemagglutination domain-containing protein  38.69 
 
 
1910 aa  204  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3312  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.44 
 
 
2054 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0780  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.61 
 
 
3132 aa  197  5.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0940  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  47.35 
 
 
1691 aa  188  4e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2172  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.26 
 
 
2834 aa  187  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.718813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  38.41 
 
 
1994 aa  179  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1149  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.97 
 
 
2217 aa  179  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3524  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.29 
 
 
481 aa  177  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.838951  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  38.01 
 
 
2271 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.35 
 
 
4855 aa  173  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.95 
 
 
2744 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1008  GLUG  34.64 
 
 
1013 aa  168  4e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2096  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.16 
 
 
2887 aa  168  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.63 
 
 
1637 aa  164  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4014  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.9 
 
 
956 aa  150  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.893958  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0504  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  35.41 
 
 
1844 aa  142  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2227  hemagglutinin-related protein  35.16 
 
 
3349 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1458  filamentous haemagglutinin-like protein  33.98 
 
 
3299 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2610  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.4 
 
 
3340 aa  120  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0482  haemagglutinin-like protein  34.36 
 
 
4007 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2234  filamentous haemagglutinin-like protein  35.2 
 
 
4009 aa  108  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0056  hypothetical protein  33.45 
 
 
2679 aa  107  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.602314 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3126  filamentous haemagglutinin-like protein  33.07 
 
 
4347 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.588086 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  33.93 
 
 
715 aa  101  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2911  filamentous haemagglutinin-like protein  33.33 
 
 
4135 aa  101  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.06 
 
 
759 aa  100  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  31.13 
 
 
1741 aa  99.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2206  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  33.2 
 
 
4132 aa  97.4  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.498823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2207  filamentous haemagglutinin-like protein  33.33 
 
 
4049 aa  97.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.370432 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4821  hemagglutination repeat-containing protein  32.27 
 
 
4184 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.2 
 
 
808 aa  94.7  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2214  filamentous haemagglutinin-like protein  32.28 
 
 
4030 aa  93.2  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.699209 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55400  hypothetical protein  31.87 
 
 
4177 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0355  filamentous haemagglutinin-like protein  33.64 
 
 
3472 aa  90.9  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.06862 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2405  filamentous haemagglutinin-like protein  33.91 
 
 
3332 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.621417 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2575  filamentous hemeagglutinin-like protein  34.35 
 
 
3409 aa  85.1  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3171  filamentous haemagglutinin-like protein  30.43 
 
 
4170 aa  85.1  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.336923 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2997  filamentous haemagglutinin-like protein  33.33 
 
 
4435 aa  79  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.157653 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2110  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.53 
 
 
4219 aa  74.3  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.328655 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4093  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.96 
 
 
946 aa  69.3  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114159 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1009  hypothetical protein  45.21 
 
 
122 aa  68.2  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0529  putative periplasmic protein  36.07 
 
 
553 aa  68.2  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.935894  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1743  putative periplasmic protein  36.07 
 
 
553 aa  68.2  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1068  haemagglutinin-like  37.63 
 
 
4283 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0837  hemagglutination domain-containing protein  38.3 
 
 
139 aa  65.5  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0185805  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0760  hemagglutination domain-containing protein  38.3 
 
 
144 aa  61.6  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.955622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.79 
 
 
1349 aa  61.2  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.79 
 
 
1570 aa  61.2  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.79 
 
 
1391 aa  61.2  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1530  conserved hypothetical protein, hemagglutination domain protein  34.64 
 
 
1085 aa  60.5  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.307259  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  25.21 
 
 
1650 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2352  filamentous haemagglutinin-like protein  35.35 
 
 
820 aa  55.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3737  filamentous haemagglutinin-like protein  42.5 
 
 
805 aa  55.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2353  filamentous haemagglutinin-like protein  40.4 
 
 
824 aa  55.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4131  filamentous haemagglutinin-like protein  29.36 
 
 
848 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.343736  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4181  filamentous haemagglutinin-like protein  35.16 
 
 
759 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153742 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1755  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.34 
 
 
965 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655087 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2359  hypothetical protein  42.11 
 
 
212 aa  52  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.486627  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.39 
 
 
3299 aa  51.6  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2674  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  33.66 
 
 
952 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3442  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.66 
 
 
952 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5479  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.69 
 
 
816 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0379  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.91 
 
 
1073 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0161593  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.39 
 
 
3535 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.39 
 
 
3419 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2350  filamentous haemagglutinin-like protein  35.05 
 
 
816 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.883366  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2530  filamentous haemagglutinin-like protein  27.27 
 
 
776 aa  48.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.957928 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  26.38 
 
 
2637 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  35.16 
 
 
3635 aa  47.8  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>